计算化学公社

标题: Materials Studio 8.0计算过渡态任务失败 [打印本页]

作者
Author: zhanghuize 时间: 2017-6-29 19:36
标题: Materials Studio 8.0计算过渡态任务失败
本帖最后由 zhanghuize 于 2017-6-29 19:48 编辑

我使用Materials Studio 8.0的Dmol3计算Ir(III)配合物T1和MC态之间的TS过渡态时，任务总是提上3、4个小时就显示任务失败，是不是因为我的MC态能量比T1态高，软件不支持，还是因为过渡态分子没有找对，还是由于我没有连接服务器由本机计算内存不够，哪位大神能有空帮忙解决一下，小生这里先行叩谢

以下是 DMol3 Run Status

作者
Author: sobereva 时间: 2017-6-29 21:29
失败得看输出信息里的具体报错

这和初态是否比末态能量高完全无关

找过渡态还是推荐用Gaussian来做，过渡态搜索是所有程序里做得最好的。何况Dmol3用杂化泛函速度很慢，也缺乏Multiwfn那样能做后处理的分析程序来帮助你讨论电子激发内在特征。

作者
Author: zhanghuize 时间: 2017-6-29 21:52

sobereva 发表于 2017-6-29 21:29
失败得看输出信息里的具体报错

这和初态是否比末态能量高完全无关

老师，之前我也用了高斯，但怎么都算不出来，显示的虚频只有十几，IRC扫描不出来，所以无奈下采用了这种方法，这是我的输入文件和输出文件，还请老师看一下，麻烦您了。

作者
Author: sobereva 时间: 2017-6-30 04:57

zhanghuize 发表于 2017-6-29 21:52
老师，之前我也用了高斯，但怎么都算不出来，显示的虚频只有十几，IRC扫描不出来，所以无奈下采用了这种 ...

高斯弄不出来换dmol3更是白费功夫
不断调整初猜尝试，如果自己没经验初猜摆不好，用QST2
虚频十几明显是没找到真正对应的过渡态，走IRC完全是白走

作者
Author: zhanghuize 时间: 2017-6-30 15:29

sobereva 发表于 2017-6-30 04:57
高斯弄不出来换dmol3更是白费功夫
不断调整初猜尝试，如果自己没经验初猜摆不好，用QST2
虚频十几明 ...

老师，根据你的推荐，我用高斯计算，把出猜的过度态结构使用QST2优化，参照前人的输入模板，可是任务提不上去，不知是哪里出现了问题，老师您有空帮我看一下，麻烦您了

作者
Author: hopedream 时间: 2017-6-30 20:49

sobereva 发表于 2017-6-30 04:57
高斯弄不出来换dmol3更是白费功夫
不断调整初猜尝试，如果自己没经验初猜摆不好，用QST2
虚频十几明 ...

崇拜社长一塌糊涂，还是这么流弊，还是这么耐心！！

作者
Author: hopedream 时间: 2017-6-30 20:49

zhanghuize 发表于 2017-6-30 15:29
老师，根据你的推荐，我用高斯计算，把出猜的过度态结构使用QST2优化，参照前人的输入模板，可是任务提不 ...

社长，只是给你指明方向，具体的怎么做还需要自己摸索啊

作者
Author: zhanghuize 时间: 2017-6-30 21:08

hopedream 发表于 2017-6-30 20:49
社长，只是给你指明方向，具体的怎么做还需要自己摸索啊

你好，那你知道有没有QST2教程之类的

作者
Author: lyfchem 时间: 2017-6-30 21:33
你这输入文件写了genecp，又不去定义还有就是建议去手册看看QST2是什么

作者
Author: sobereva 时间: 2017-7-1 00:58

zhanghuize 发表于 2017-6-30 21:08
你好，那你知道有没有QST2教程之类的

搞清楚QST2的基本原理再去用。QST2要给反应物和产物结构，你就给了一个结构显然不行
过渡态、反应路径的计算方法及相关问题
http://sobereva.com/44

QST2的例子在exploring书里有（基础班培训里也会讲很多，不过已经满了）
QST2通常用gview来构建输入文件。

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