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标题: 【已解决】柔性力常数计算软件Compliance安装“故障” [打印本页]

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airyang    时间: 2017-7-6 23:26
标题: 【已解决】柔性力常数计算软件Compliance安装“故障”
本帖最后由 airyang 于 2017-8-28 14:15 编辑

柔性力常数软件 Compliance
系统是VM虚拟机上的 ubuntu 12.04.2,64位,2GB,双核

按照博客(http://sobereva.com/364)中方法编译安装完成,除了gfortran之外,再无安装其他软件。

启动只有白屏,求助啊

linux不太懂,我把configure.log,以及编译出的可执行文件附上来,不知道还需要提供啥信息

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sobereva    时间: 2017-7-7 06:01
unfortunately, 看不出什么线索。虚拟机的配置没问题,只可能ubuntu安装及之后的事造成的
作者
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airyang    时间: 2017-7-7 09:30
sobereva 发表于 2017-7-7 06:01
unfortunately, 看不出什么线索。虚拟机的配置没问题,只可能ubuntu安装及之后的事造成的

谢谢老师,问题解决了,其实已经可以用compliance了,只是窗口菜单不在窗口上,而在顶部工具条上,compliance的初始界面全白,让我误以为有故障。。。
果然还是因为我没咋用过linux,脑子里都是windows习惯导致的

作者
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airyang    时间: 2017-7-7 09:51
说一下“白屏”原因,省的有像我一样的小白迷糊。

从ubuntu-12.04.2-desktop-amd64.iso安装的系统,默认装了一些包,将窗口菜单从程序窗口转移到了系统的全局菜单(顶部工具条),虽然不影响使用,但可以用如下卸载将窗口菜单挪回。
sudo apt-get autoremove appmenu-gtk appmenu-gtk3 appmenu-qt
(参考:http://blog.csdn.net/abbuggy/article/details/9105669

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另外说下,VMware 12简易安装 ubuntu-12.04.2-desktop-amd64.iso,全新系统除了再安个gfortran之外,按照sob老师博客(http://sobereva.com/364)里的步骤就可以完成compliance的编译安装使用。非图形界面的命令行模式启动不了.
更高版本的Ubuntu-14,16,我都没安装成功,里面总有几个包找不到,费劲的很,当然很可能是我自己的问题。

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airyang    时间: 2017-7-7 11:20
如果是直角坐标输入的频率分析,可以直接读取log文件;目前compliance 3.0.2 还不支持z-martrix 输入的频率分析log文件,需要使用fchk。
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Faye    时间: 2017-7-29 19:27
本人是电脑小白,怕windows和Linux冲突,不敢装,请问除了Compliance方法,还能有什么方法对键的强度进行计算?
作者
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airyang    时间: 2017-7-29 20:49
Faye 发表于 2017-7-29 19:27
本人是电脑小白,怕windows和Linux冲突,不敢装,请问除了Compliance方法,还能有什么方法对键的强度进行计 ...

1.虚拟机没有任何冲突,学了就会,小白也要成长

2.多中心键级也可以考察键的强度
作者
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sobereva    时间: 2017-8-4 21:03
Faye 发表于 2017-7-29 19:27
本人是电脑小白,怕windows和Linux冲突,不敢装,请问除了Compliance方法,还能有什么方法对键的强度进行计 ...

看此文5.2节
Multiwfn波函数分析程序的意义、功能与用途
http://sobereva.com/184
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xujian    时间: 2017-8-5 10:13
请问楼主,“在software center里搜gmm,把libgmm++-dev装上”这一步您是怎么做到的
作者
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airyang    时间: 2017-8-5 12:37
本帖最后由 airyang 于 2017-8-5 12:40 编辑
xujian 发表于 2017-8-5 10:13
请问楼主,“在software center里搜gmm,把libgmm++-dev装上”这一步您是怎么做到的
一、
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二、
(, 下载次数 Times of downloads: 103)
三、
(, 下载次数 Times of downloads: 109)



如果看不到 “二”中的搜索栏,可能是系统默认分辨率不合适,导致没显示出来,尝试拖动边界滑块找找看。
再不行就重装下software center:
sudo apt-get update
sudo apt-get install --reinstall software-center




作者
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xujian    时间: 2017-8-5 14:08
airyang 发表于 2017-8-5 12:37
一、

二、

谢谢!
作者
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xujian    时间: 2017-8-7 14:35
airyang 发表于 2017-8-5 12:37
一、

二、

按照楼主的方法还是不行,是不是自己的Ubuntu版本太低,我的打开只有Ubuntu Software选项,后面没带center,点开后搜索gmm之后找不到软件,请问您的Ubuntu有安装程序方便共享吗?谢谢!
作者
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airyang    时间: 2017-8-7 15:18
xujian 发表于 2017-8-7 14:35
按照楼主的方法还是不行,是不是自己的Ubuntu版本太低,我的打开只有Ubuntu Software选项,后面没带cente ...

(, 下载次数 Times of downloads: 112)
http://bt.neu6.edu.cn/thread-1106228-1-1.html,我就是在六维上下的镜像,这个只要版本号一样,别处下的应该也没差
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xujian    时间: 2017-8-28 14:02
airyang 发表于 2017-8-7 15:18
http://bt.neu6.edu.cn/thread-1106228-1-1.html,我就是在六维上下的镜像,这个只要版本号一样,别处 ...

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楼主,麻烦请教一下,这一步把Compliance解压是怎么做的,Compliance压缩包应该放到哪个文件夹下?谢谢

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airyang    时间: 2017-8-28 14:14
不同压缩方式文件后缀不同,不同压缩方式解压命令不完全相同。任何搜索引擎输入:“linux 解压 .[你看到的后缀名——第一个 . 之后的所有内容]” 。都会知道解压命令。

红框内是编译安装步骤,一般来说压缩包放啥地方都行,常见你就放自己用户目录下的某个文件夹比如自建个setup就好了——/home/[你的名字]/setup
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xujian    时间: 2017-8-29 08:36
airyang 发表于 2017-8-28 14:14
不同压缩方式文件后缀不同,不同压缩方式解压命令不完全相同。任何搜索引擎输入:“linux 解压 .[你看到的 ...

谢谢楼主,我的问题比较弱智,就是如何把Compliance压缩包放到虚拟机的操作系统里
作者
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ABetaCarw    时间: 2017-8-29 09:29
xujian 发表于 2017-8-29 08:36
谢谢楼主,我的问题比较弱智,就是如何把Compliance压缩包放到虚拟机的操作系统里

我和楼主用的不是同一款虚拟机,我用的是virtualbox。我的这个虚拟机有三种方式鼓捣文件进去。1虚拟机也可以上网,然后从自己的网盘下载。2插上自己的U盘,然后把U盘挂载到虚拟机的系统中。3建立共享文件夹(实体机和虚拟机都能访问的一个文件夹,然后把文件放在里面就好了)。
这三种方法都是安装完Virtualbox自带的增强功能后可以轻松实现。
楼主的虚拟机比我的更强大,应该也有类似功能选项。
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xujian    时间: 2017-8-29 11:18
请问楼主,我解压之后,安装不上,出现如下图所示错误,该如何解决,谢谢
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作者
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airyang    时间: 2017-8-29 18:04
xujian 发表于 2017-8-29 11:18
请问楼主,我解压之后,安装不上,出现如下图所示错误,该如何解决,谢谢

先 make , 才能make install。
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xujian    时间: 2017-8-29 21:04
airyang 发表于 2017-8-29 18:04
先 make , 才能make install。

谢谢楼主,我先输入make也出现同样的问题,如图一,我的compliance解压后的文件为图二,不知道问题出在什么地方

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sobereva    时间: 2017-8-29 21:25
xujian 发表于 2017-8-29 21:04
谢谢楼主,我先输入make也出现同样的问题,如图一,我的compliance解压后的文件为图二,不知道问题出在什 ...


先运行configure,使之产生Makefile,再运行make
作者
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airyang    时间: 2017-8-29 21:32
xujian 发表于 2017-8-29 21:04
谢谢楼主,我先输入make也出现同样的问题,如图一,我的compliance解压后的文件为图二,不知道问题出在什 ...

嗯,编译基本都是这三步,我忘记提configure的问题了。另外我传到VM虚拟机上用的是共享文件夹,加载在/mnt/下面,当然你在图形界面直接把文件从主系统拖进虚拟机也可以。
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xujian    时间: 2017-8-29 21:34
sobereva 发表于 2017-8-29 21:25
先运行configure,使之产生Makefile,再运行make

谢谢sob老师。运行configure是输入./ configure 吗?
作者
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sobereva    时间: 2017-8-29 21:34
xujian 发表于 2017-8-29 21:34
谢谢sob老师。运行configure是输入./ configure 吗?


作者
Author:
xujian    时间: 2017-8-30 09:41
谢谢指导,现已安装完毕,但在操作时又遇到问题,我载入fchk文件之后,点击右键,只是图形不断在变动,并没有出现Stretching、Bending、Torsion三种模式,请问这是什么原因导致的?

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airyang    时间: 2017-8-30 10:59
本帖最后由 airyang 于 2017-8-30 11:02 编辑
xujian 发表于 2017-8-30 09:41
谢谢指导,现已安装完毕,但在操作时又遇到问题,我载入fchk文件之后,点击右键,只是图形不断在变动,并没 ...


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xujian    时间: 2017-8-30 11:29
airyang 发表于 2017-8-30 10:59
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2

非常感谢,我在右键空白处的时候只是图形在变动,出现不了三种振动模式的选项,是不是软件问题?
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Author:
liuxm    时间: 2018-12-5 09:17
本帖最后由 liuxm 于 2018-12-5 09:21 编辑

请问各位老师,如何实现在在控制台下的sudo 系列操作啊?我这边到这一步做不下去。提示我说apt-get 命令不存在
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Author:
luzujia    时间: 2022-10-16 14:17
14安装成功了。在software center无法搜到,但用命令sudo apt-get install libgmm++-dev就可以安装上,估计其它版本也可以用这个命令安装。
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Author:
alonewolfyang    时间: 2024-2-24 22:00
airyang 发表于 2017-8-7 15:18
http://bt.neu6.edu.cn/thread-1106228-1-1.html,我就是在六维上下的镜像,这个只要版本号一样,别处 ...

该网站登不上,官网上又没有你这个版本
作者
Author:
alonewolfyang    时间: 2024-2-24 22:19
alonewolfyang 发表于 2024-2-24 22:00
该网站登不上,官网上又没有你这个版本

https://iso.mirrors.yun-idc.com/ubuntu/12.04.2/这个网站有
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chenxinlong    时间: 2024-10-25 10:56
sobereva 发表于 2017-8-29 21:25
先运行configure,使之产生Makefile,再运行make

老师您好,我按照流程将Compliance成功安装在了VMware17下的Ubuntu 2022上,也可以正常打开,但录入Gaussian16计算完成的fchk文件后,一点击程序就闪退了,不知道是版本问题还是安装问题?




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