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标题: 分子力学和分子动力学电脑配置 [打印本页]

作者
Author: yezhonghua 时间: 2017-7-13 17:46
标题: 分子力学和分子动力学电脑配置
请教一下大神，需要用到分子动力学进行材料的模拟计算；
主要计算方面：
1、分子构象搜索
2、分子晶体构建
3、不同分子间的相互作用
需要用到分子动力学软件和相关计算设备；请教一下基于上述计算任务，那些分子动力学软件比较合适，如果用到GPU加速的话，购买1080的显卡怎么样？
另外CPU方面，是否需要第一性原理计算那样配置多核心的CPU。
谢谢指导！

作者
Author: sobereva 时间: 2017-7-14 10:09
1 molclus
3 Gaussian、ORCA
建议1080Ti而非1080。
36核也没多少钱，直接上36核，参考http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=6310

作者
Author: yezhonghua 时间: 2017-7-14 13:00
谢谢sob老师，因为要模拟计算分子晶体结构和构象搜索等，所以特别想问一下，我增加一块1080Ti的效果是否要比增加CPU核心数来的好，因为好多的分子动力学计算对于GPU的测试性价比要高于CPU
谢谢！

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