计算化学公社

标题: DSviewerPro求助 [打印本页]

作者
Author:
my_aman    时间: 2017-7-17 10:20
标题: DSviewerPro求助
本帖最后由 my_aman 于 2017-7-17 10:25 编辑

大家有用过DSviewerPro这个软件的吗,我用程序产生的结构.xyz文件,由于原子间的距离太远,不能显示原子之间的键。每次都是手动或写程序缩小距离太麻烦。
听说这个软件设置一下就可以显示原子间成键。但是我找遍了,也不知道在哪设置的,有用过的能告诉我在哪设置吗。

作者
Author:
liyuanhe211    时间: 2017-7-17 11:37
这个软件没用过。不过GaussView 6 可以设置成键的距离阈值、比较方便
作者
Author:
my_aman    时间: 2017-7-17 12:04
liyuanhe211 发表于 2017-7-17 11:37
这个软件没用过。不过GaussView 6 可以设置成键的距离阈值、比较方便

生成的是.xyz,然后在高斯上算。 GV好像打不开.xyz文件
作者
Author:
Jasminer    时间: 2017-7-17 15:33
my_aman 发表于 2017-7-17 12:04
生成的是.xyz,然后在高斯上算。 GV好像打不开.xyz文件。

手动改,反正里面都是文本。
要不就用chem3d打开另存成mol之类的,好像当年是这么操作的。
作者
Author:
my_aman    时间: 2017-7-17 16:09
Jasminer 发表于 2017-7-17 15:33
手动改,反正里面都是文本。
要不就用chem3d打开另存成mol之类的,好像当年是这么操作的。

我一直也都是手动改的,听说这个软件可以改,但是不会用。
作者
Author:
sobereva    时间: 2017-7-17 16:48
Multiwfn载入xyz文件,用主功能100的选项2就可以转化出gview等所有程序都认的pdb格式
当然你也可以直接把xyz里的坐标部分复制到一个gjf文件里,然后用gview打开

作者
Author:
hakuna    时间: 2017-7-18 16:52
用VESTA吧,免费免安装,可以直接打开xyz格式文件,原子间连不连那根线,你可以随意定义
作者
Author:
my_aman    时间: 2017-7-19 14:36
hakuna 发表于 2017-7-18 16:52
用VESTA吧,免费免安装,可以直接打开xyz格式文件,原子间连不连那根线,你可以随意定义

试用了一下,特别好用。就是需要这样的软件,特别感谢。




欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3