计算化学公社

标题: QM/MM与QM/MM MD的联系与区别 [打印本页]

作者
Author: 15whyhq 时间: 2017-8-1 20:12
标题: QM/MM与QM/MM MD的联系与区别
QM/MM与QM/MM MD的联系与区别是什么？有点迷糊，可以解释地稍微详细点吗？可以提供各种资料、链接等。非常感谢！

作者
Author: fhh2626 时间: 2017-8-1 22:41
没有什么区别，QM/MM一般就指QM/MM-MD，就是MD中核心区域用QM计算加速度，其他区域用MM计算

部分情况下QM/MM也指在QM计算中（比如优化，频率计算）加入MM环境，不过这种情况较少

作者
Author: yflchx 时间: 2017-8-1 22:43
http://staff.ustc.edu.cn/~sxtian/qc-lecture-2014.pdf

科大3系量子化学课讲义，第六章，仅供参考。

作者
Author: michaelm 时间: 2017-8-2 00:09
ONIOM 算是QM/MM么？

作者
Author: agent99 时间: 2017-8-2 05:25
本帖最后由 agent99 于 2017-8-1 15:26 编辑

michaelm 发表于 2017-8-1 10:09
ONIOM 算是QM/MM么？

一般不算。这两种方法原理上还是有挺大区别的。再说ONIOM的外层不一定要用MM，也可以用QM。

作者
Author: jiangning198511 时间: 2017-8-2 06:59
QM/MM 可以想象成一种大体系电子结构的计算方法，可以得到能量，最优几何结构，频率等。QM/MM MD就是在这个基础上做MD

作者
Author: 虎王 时间: 2017-8-2 22:03

agent99 发表于 2017-8-2 05:25
一般不算。这两种方法原理上还是有挺大区别的。再说ONIOM的外层不一定要用MM，也可以用QM。

那MM和MD的区别呢？
之前我问过一位理论计算的老师，但是他一直在解释量子力学和分子力学的区别，我感觉他误解了我的意思。

作者
Author: wbn 时间: 2017-8-2 23:04

虎王发表于 2017-8-2 22:03
那MM和MD的区别呢？
之前我问过一位理论计算的老师，但是他一直在解释量子力学和分子力学的区别，我感觉 ...

MM 还包括Monte Carlo 模拟

作者
Author: 虎王 时间: 2017-8-4 15:44

wbn 发表于 2017-8-2 23:04
MM 还包括Monte Carlo 模拟

所以MD是MM的真子集？

作者
Author: sobereva 时间: 2017-8-4 19:29
任务类型：单点、几何优化、振动分析、MD、MC...
计算能量的方法：QM、MM、QM/MM...

以上两类问题是独立的，可以随意组合

ONIOM是一种广义的能将不同级别方法描述体系不同区域的计算形式，可以通过ONIOM来等效实现QM/MM的目的，这确切来说叫做ONIOM(QM:MM)，这和QM/MM的常规实现方式不同。

作者
Author: XZDZ 时间: 2020-7-20 08:38

yflchx 发表于 2017-8-1 22:43
http://staff.ustc.edu.cn/~sxtian/qc-lecture-2014.pdf

科大3系量子化学课讲义，第六章，仅供参考。

您好，请问这个链接可以再给一下吗？这个打不开。谢谢

作者
Author: yflchx 时间: 2020-7-20 09:28

XZDZ 发表于 2020-7-20 08:38
您好，请问这个链接可以再给一下吗？这个打不开。谢谢

应该是链接失效了。因为用不太着，所以当时我也没保存。

可以用Google搜索点其他资料。

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