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标题: zmatrix 与xyz坐标转换问题 [打印本页]

作者
Author: nuke 时间: 2017-8-13 23:39
标题: zmatrix 与xyz坐标转换问题
本帖最后由 nuke 于 2017-8-13 23:39 编辑

linux下的高斯。我需要将xyz坐标的输入文件转化为 zmatrix的形式请问如何做呀？最好使用命令格式，newzmat可以实现么？具体命令可否告知一下谢谢！
我输入 newzmat  h2o.gjf -ozmat h2o-zmat.gjf
得不到下面的h2o-zmat.gjf 的形式

输入文件为 h2o.gjf
%mem=200MB
%nproc=4
# b3lyp/6-311++g**

Title Card Required

0 1
O  0 4.54118984800000       8.25839353400000    -2.12332226800000
H  0 4.05796480178833       8.36400127410889    -2.63183021545410
H  0 5.35649972500000       7.83714888500000    -2.52059140100000

h2o-zmat.gjf 的形式
%mem=200MB
%nprocshared=4
# b3lyp/6-311++g(d,p)

Title Card Required

0 1
O
H                1          B1
H                1          B2 2          A1

B1          0.70939395
B2          1.00000000
A1          109.46999445

作者
Author: itpfeng 时间: 2017-8-14 01:40
少问这种自己花点时间就可以得到答案的问题，既然知道newzmat，那么查一下newzmat的用法或者manual不就知道了
看看它支持什么什么文件格式，语法是什么样的。
newzmat -iformat -oformat input_file_name output_file_name

PS：正常gaussian输入文件格式是cart

作者
Author: nuke 时间: 2017-8-14 12:00

itpfeng 发表于 2017-8-14 01:40
少问这种自己花点时间就可以得到答案的问题，既然知道newzmat，那么查一下newzmat的用法或者manual不就知道 ...

。。。我不是说了么那样得不到h2o-zmat.gjf
newzmat -ixyz -ozmat h2o.gjf h2o-zmat.gjf
您可以得到么？

作者
Author: itpfeng 时间: 2017-8-14 12:19

nuke 发表于 2017-8-14 12:00
。。。我不是说了么那样得不到h2o-zmat.gjf
newzmat -ixyz -ozmat h2o.gjf h2o-zmat.gjf
您可以得到 ...

有些无语。你试过 -icart 了？按manual上说 -ixyz 是转换 .xyz 文件的。

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