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标题: 推荐使用ORCA共享库版本 [打印本页]

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sobereva    时间: 2017-8-19 02:08
标题: 推荐使用ORCA共享库版本
ORCA程序体积太大一直为人所诟病,主要是用了静态库所致,Linux版ORCA4解压后体积高达11GB,压缩包也有2.2GB。
最近ORCA下载页面上放出了4.0.1.2版的共享库版本,我也加到了论坛的资源分享版的ORCA下载链接里了。共享库版本.tar.zst格式是166MB,.tar.xz格式是186MB。解压后才2.2GB,比G16 linux版都小得多。共享库版本运行速度和静态库版本实测完全一样,而且用起来不麻烦,把解压后的目录加到$LD_LIBRARY_PATH中,然后就可以照常使用了。
一般就下.tar.xz的就行了,比较新的Linux系统直接就可以解压。.tar.zst用的是新兴的压缩率很高的Zstandard算法压缩的,解压需要额外装zstd程序(http://facebook.github.io/zstd/。下载预编译好的版本,然后用zstd -d orca_4_0_1_2_linux_x86-64_shared_openmpi202.tar.zst即可解压成.tar包)

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Warm_Cloud    时间: 2017-8-19 10:48
很好奇它到底用了什么静态库。。。
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sobereva    时间: 2017-8-19 13:58
有意思,我用7zip在1024MB词典下压缩,ORCA linux动态库版本竟然从2.01GB被压到了90MB,比Neese发布的zst包还小一倍!
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beefly    时间: 2017-8-19 17:57
sobereva 发表于 2017-8-19 13:58
有意思,我用7zip在1024MB词典下压缩,ORCA linux动态库版本竟然从2.01GB被压到了90MB,比Neese发布的zst包 ...

都是水呀!
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ChrisZheng    时间: 2017-8-19 18:06
看了一下,之前的Linux版占了11G的磁盘……
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Jasminer    时间: 2017-8-20 00:05
sobereva 发表于 2017-8-19 13:58
有意思,我用7zip在1024MB词典下压缩,ORCA linux动态库版本竟然从2.01GB被压到了90MB,比Neese发布的zst包 ...

这么大词典,得占多少内存啊?!
一般为了减小压缩和解压时的内存占用,词典大小不会超过100M
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sobereva    时间: 2017-8-20 14:04
Jasminer 发表于 2017-8-20 00:05
这么大词典,得占多少内存啊?!
一般为了减小压缩和解压时的内存占用,词典大小不会超过100M


压缩时约11GB内存,现在很多PC机都有16GB内存,实在不行再降点词典。
解压时需要的内存就更小了,1024MB词典只要有区区1GB内存就能解压,现在的PC没有满足不了的。
64MB词典压缩效果比1024MB词典差太远。


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wudazhuang509    时间: 2017-8-30 15:45
sob老师好,您讲的“把解压后的目录加到$LD_LIBRARY_PATH中”,是在那个文件中加呢?我以前用的4.0.0.2,没有进行这个设置就可以用,系统是Ubuntu,怎样设置呢?
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sobereva    时间: 2017-8-30 20:45
wudazhuang509 发表于 2017-8-30 15:45
sob老师好,您讲的“把解压后的目录加到$LD_LIBRARY_PATH中”,是在那个文件中加呢?我以前用的4.0.0.2,没 ...


.bashrc
你以前用的是静态库版本,显然不需要设这个

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wudazhuang509    时间: 2017-8-30 20:50
sobereva 发表于 2017-8-30 20:45
.bashrc
你以前用的是静态库版本,显然不需要设这个

谢谢sob老师,我找到这个文件了,但是不知道您指的加一行是什么内容,论坛里面找了都试过了,好像都不可以,主要是不懂这个是什么意思,直接照抄别人的应该就不行了
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sobereva    时间: 2017-8-30 21:12
wudazhuang509 发表于 2017-8-30 20:50
谢谢sob老师,我找到这个文件了,但是不知道您指的加一行是什么内容,论坛里面找了都试过了,好像都不可 ...

...
诸如你的目录是/home/sob,你就在/home/sob/.bashrc末尾加一行
export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/home/sob/orca
就完了。然重新进入终端就能用了
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wudazhuang509    时间: 2017-8-31 08:43
sobereva 发表于 2017-8-30 21:12
...
诸如你的目录是/home/sob,你就在/home/sob/.bashrc末尾加一行
export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRAR ...

可以了 谢谢老师
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Charles_Gao    时间: 2017-10-10 19:47
谢谢sober,我下载的时候被(expert only!)吓到了
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anqingpingle    时间: 2018-1-15 08:28
请问一下大家,我下载了zstd-v1.3.3-win64,解压后还是不能运行,改怎么使用呢?
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sobereva    时间: 2018-1-15 10:12
anqingpingle 发表于 2018-1-15 08:28
请问一下大家,我下载了zstd-v1.3.3-win64,解压后还是不能运行,改怎么使用呢?


命令行下运行zstd -d [压缩包名字]
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anqingpingle    时间: 2018-1-16 20:31
我不好意思问了,可是真的装不上。看了以前的帖子,连openmpi也下载了,这个也装不上,对自己的智商无语了
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sobereva    时间: 2018-1-16 21:05
anqingpingle 发表于 2018-1-16 20:31
我不好意思问了,可是真的装不上。看了以前的帖子,连openmpi也下载了,这个也装不上,对自己的智商无语了{ ...

zstd可执行文件不在当前目录,显然这么运行不了
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anqingpingle    时间: 2018-1-16 21:29
多谢sob!惭愧!
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长颈鹿先森    时间: 2018-4-23 14:38
anqingpingle 发表于 2018-1-15 08:28
请问一下大家,我下载了zstd-v1.3.3-win64,解压后还是不能运行,改怎么使用呢?

请问你怎么下载的zst解压软件,我按sob老师说的去http://facebook.github.io/zstd/网站上下载,不知道下哪个,可以告诉我你怎么下的吗
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sobereva    时间: 2018-4-23 15:18
长颈鹿先森 发表于 2018-4-23 14:38
请问你怎么下载的zst解压软件,我按sob老师说的去http://facebook.github.io/zstd/网站上下载,不知道下 ...


页面最上方点latest release,选择相应的包下载。诸如win64系统就下载xxx win64.zip那个
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长颈鹿先森    时间: 2018-4-23 15:59
sobereva 发表于 2018-4-23 15:18
页面最上方点latest release,选择相应的包下载。诸如win64系统就下载xxx win64.zip那个

谢谢,sob老师,我已经按您说的方法成功解压了,并且也装上了MPI,但是不知道怎么使用orca软件。
1.首先输入文件.inp应该在哪里输入,不知道输入文件怎么弄。
2.其次输入文件.inp弄好之后应该在cmd里用orca运行这个文件是吗?
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sobereva    时间: 2018-4-23 16:41
长颈鹿先森 发表于 2018-4-23 15:59
谢谢,sob老师,我已经按您说的方法成功解压了,并且也装上了MPI,但是不知道怎么使用orca软件。
1.首先 ...

1 看手册了解怎么写输入文件(.inp)
2 y
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超级个玛丽    时间: 2018-5-28 19:08
长颈鹿先森 发表于 2018-4-23 14:38
请问你怎么下载的zst解压软件,我按sob老师说的去http://facebook.github.io/zstd/网站上下载,不知道下 ...

请问一下是如何解压缩那个tar.zst文件的,我下载了那个解压软件,解压出来后有一个zst.exe程序 请问是打开那个解压tar.zst文件么 为啥我一点开zst.exe就闪退, 谢谢!
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sobereva    时间: 2018-5-29 00:32
超级个玛丽 发表于 2018-5-28 19:08
请问一下是如何解压缩那个tar.zst文件的,我下载了那个解压软件,解压出来后有一个zst.exe程序 请问是打 ...

zstd -d [压缩包名字]
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TJNina    时间: 2018-11-28 16:51
老师,我在论坛里面没有找个这个版本的ORCA的下载连接,您可以提供一下下载连接吗?
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sobereva    时间: 2018-11-28 17:31
TJNina 发表于 2018-11-28 16:51
老师,我在论坛里面没有找个这个版本的ORCA的下载连接,您可以提供一下下载连接吗?

在资源分享版里。
没权限进入的话就去官网上下




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