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标题: 计算isomorphs之间的活化能 [打印本页]

作者
Author: redfoxs 时间: 2017-8-22 04:56
标题: 计算isomorphs之间的活化能
合成的分子存在着两个isomorph, 优化后的结构具有相同的能量，现在想知道从一个构型到另一个构型的活化能，是不是用scan，设置扫描步数和角度变化范围就可以了？
下图是模型分子的两种构型图：

作者
Author: 陌上芬菲 时间: 2017-8-22 09:48
本帖最后由陌上芬菲于 2017-8-22 09:49 编辑

scan可能不好使用。或许，应该找过渡态，做irc验证。看上去这种结构还是容易找的。记得能量是算过渡态，isomers 的自由能G，如果是溶液，还要加上溶剂。
仅供参考！！

作者
Author: 我本是个娃娃 时间: 2017-8-22 10:22

陌上芬菲发表于 2017-8-22 09:48
scan可能不好使用。或许，应该找过渡态，做irc验证。看上去这种结构还是容易找的。记得能量是算过渡态，i ...

这种反应应该存在过渡态，也就是说，存在一个转换的一个过渡结构，然后做IRC来验证。活化能一般用阿伦尼乌斯公式来拟合

作者
Author: liyuanhe211 时间: 2017-8-22 12:24
找TS，用活化自由能考察。
SCAN几乎总是不对应实验上的化学意义的。

作者
Author: ggdh 时间: 2017-8-22 14:19
两个苯环应该不是协同转的，所以有2步。

作者
Author: sobereva 时间: 2017-8-22 21:23

我本是个娃娃发表于 2017-8-22 10:22
这种反应应该存在过渡态，也就是说，存在一个转换的一个过渡结构，然后做IRC来验证。活化能一般用阿伦尼 ...

活化能直接用TS自由能减去反应物自由能所得到的活化自由能就行了，如果不牵扯拟合k~T关系，用不着涉及阿仑尼乌斯公式拟合

作者
Author: 我本是个娃娃 时间: 2017-8-22 21:36

sobereva 发表于 2017-8-22 21:23
活化能直接用TS自由能减去反应物自由能所得到的活化自由能就行了，如果不牵扯拟合k~T关系，用不着涉及阿 ...

哦，明白了，多谢大博士

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