计算化学公社

标题: [投票]大家是否使用超算中心资源？ [打印本页]

作者
Author: sobereva 时间: 2014-10-21 15:42
标题: [投票]大家是否使用超算中心资源？
调查一下各位使用超算中心计算资源的情况。也欢迎各位在回复中对用过的超算中心资源进行评价，包括性能、费用、便利程度、各方面限制等等

作者
Author: zhanfei 时间: 2014-10-21 15:47
表示0.0 没钱，还是用集群和自己的单机吧

作者
Author: jiahh 时间: 2014-10-21 17:26

使用的是国家超级计算天津中心，因为节点可并行运算，运算速度要比集群和单片机快的多，美中不足就是拷数据的时候比较麻烦。

作者
Author: ruanyang 时间: 2014-10-21 17:58
我们花钱搭集群用！:(，一个人平均只有4个核

作者
Author: 小和尚 时间: 2014-10-21 22:36
新手表示从来没有用过！:'(:'(:'(:'(:'(

作者
Author: 茶味果冻 时间: 2014-10-22 16:55

jiahh 发表于 2014-10-21 17:26
使用的是国家超级计算天津中心，因为节点可并行运算，运算速度要比集群和单片机快的多，美中不 ...

你在那做的是什么软件计算，我这今天刚买的机时

作者
Author: jiahh 时间: 2014-10-22 21:38

茶味果冻发表于 2014-10-22 16:55
你在那做的是什么软件计算，我这今天刚买的机时

用的Gromacs软件，主要做模拟计算

作者
Author: fcfsdu 时间: 2014-10-23 18:52
了解过一些，但是总体核算下来，觉得收费还是有点高。一个16核的机器，一年下来收费好几万，不如自己动手组装。虽然租这个机时省事，但是自己动手也有优点，能够熟悉各种软件的编译，集群的维护等等。

作者
Author: lip 时间: 2014-10-28 11:39
对于规模不大的课题组，使用超算是比较贵的。
我们组自己建了集群，在初期建设以及后期升级维护中学习乐乐很多的知识。不仅是在搭建维护方面，而且在对程序的调试和感知方面都有很好的自我提升。
综上：对于刚刚毕业的青椒，自己搭建计算资源是个一举多得的过程。

作者
Author: truemantwo 时间: 2014-10-28 17:28
集群也租过，自己也搭过集群。

租的集群：各个软件都安装好了，不需要自己折腾，计算起来很方便。但是，计算数据回传很麻烦（特别是MD的轨迹文件，压缩过以后也很大，很头痛）。

搭的集群：一切从零开始做，很麻烦，也很痛苦。但是，一旦把这条路走通，以后做计算模拟就如同有神器在手，诸如硬件安装，系统安装，编译器安装，并行调优，软件编译等等问题都不在话下。

作者
Author: yaochuang 时间: 2014-10-28 17:56
我们在深圳的一个超算中心开了24个核，一年一万多。主要是我们实验室没有买gaussian软件，他们有使用版权。

作者
Author: 高雪皎 时间: 2014-10-28 21:09
导师在深圳超算中心租了一年天河，128核，一年不到6w，计算速度还是很好的，8核并行要比AMD12核并行速度快了1.5倍（AMD是我们组2011年买的）。但是有个问题就是，128核不是物理的cpu，而是超线程分出来的，大家要是租的话可以问清楚。

作者
Author: haizhiwuyu 时间: 2014-11-5 09:36
济南超算中心价格不贵，还可以优惠，操作简单，登录，上传下载都很方便。

作者
Author: psfan 时间: 2014-11-28 08:55
如果数据传输量大有没有光纤专线的话还是自己搭建合适，否则一个计算周期传数据占一半时间。

作者
Author: ruanyang 时间: 2014-12-4 11:24

jiahh 发表于 2014-10-22 21:38
用的Gromacs软件，主要做模拟计算

能问一下你用gromacs做什么方面的计算吗？我也用gromacs，我主要做材料方面的模拟

作者
Author: patience2014 时间: 2014-12-4 12:44
在深圳超算中心买了35核，一年2万2左右，主要用高斯程序，只有自己用感觉资源够用。

作者
Author: tjuchan 时间: 2014-12-4 16:48
我用的是towhee（MC程序包），因为它不能并行运算，但是单个任务由于cpu的主频原因计算很慢。一次性可以算很多任务。处于实验室资源问题，超算有比较便宜，所以还是将就。但是算其他可并行化的程序，应该很快，超算要我自己安装高斯，我一直安装不来，纠结。。。。。

作者
Author: sky 时间: 2014-12-8 20:23
用过深圳的和天津的，天津的用了半年多，深圳的操作过几次。
速度方面只测过一个体系，在深圳2200秒左右在天津算要1900秒左右，看CPU也是深圳略差，Xeon X5650vs5670
服务方面天津要好于深圳，连用户手册都有差距。深圳的vpn不好用，而且ftp居然不提供格式转换。当时还在深圳那边还碰到个小白客服，连换行符都不知道。天津的客服不知道怎么样。
要说对天津最不满的地方应该是联系的时候碰到个负责人，一个劲的给我夸他们天津有多好多好，说甩开深圳一大截。之后又迫不及待要我邮箱，把申请表发给我，邮件里还写国内有多少多少人在用天津的机子。比较恶心这种人，说话不负责，到处忽悠小白。
价格方面天津稍高一点，一个节点一年贵一两千的样子，个人觉得还是比较划算的。
深圳现在要到期了，也不准备续了。正在申天河二号，过段时间再发评测。

作者
Author: gengle 时间: 2014-12-18 23:51
我们这边学校帐号是免费的，写文章时致谢即可。

作者
Author: amber15111 时间: 2015-1-18 21:12

haizhiwuyu 发表于 2014-11-5 09:36
济南超算中心价格不贵，还可以优惠，操作简单，登录，上传下载都很方便。

您好！请问济南南边的机时是怎么算的，有最短时间限制吗？

作者
Author: amber15111 时间: 2015-1-18 21:14

gengle 发表于 2014-12-18 23:51
我们这边学校帐号是免费的，写文章时致谢即可。

你好！我可以详细了解一下你们学校那边的计算资源吗？现在我急需一些机时进行计算

作者
Author: koko 时间: 2015-1-18 23:20
天津超算比较快，广州超算比较新，上海北京超算已经比较老比较慢

作者
Author: tzweir 时间: 2015-1-19 20:52
买的广州天河二号的计算资源，按0.1元核小时计费，硬件是目前国内超算中比较新的，性能应该不错。理论上该中心的计算资源非常丰富，但是目前正在逐步扩容中，现在应该差不多了。
此外听说他们正在购买很多收费软件，比如Material Studio，高斯等，以后在他们那可以直接付点费用使用这些软件进行计算，发文章的时候挂个中心的名号就可以了，我觉得这也是一个非常好的模式，不用到处找版权了哈哈，就是希望收费不要太贵。

作者
Author: gengle 时间: 2015-1-21 09:51

amber15111 发表于 2015-1-18 21:14
你好！我可以详细了解一下你们学校那边的计算资源吗？现在我急需一些机时进行计算

你没看清楚，我是说我们这边以学校名义申请的超算资源是免费使用的，我们学校可没有这些资源，呵呵

作者
Author: ZHANGZY 时间: 2015-3-7 06:08
没有钱，羡慕！！！

作者
Author: yjmaxpayne 时间: 2015-3-10 11:33
看任务类型还有集群管理水平。以前有个项目的MD（数百个job）基本全部都是在BlueGene/Q上跑下来的，排队的人少一些还好。现在能用的几个机器人都超多，管理水平也有限，就用的少了。如果是自己做一些基础研究的话一台工作站足矣。最近刚配的一台：2X12核 Xeon + 64G ECC + 2XTesla K20C 也就7W多一些，性能足够强悍，跑几万个原子的MD用GPU加速随便一天就是十几ns。跑QC还有各种DFT也很快，比直接集群上用那么多个核要好很多。

作者
Author: vigaryang 时间: 2015-4-13 23:40
最近几个月在用超算深圳中心的服务器，两个节点（共24核）跨节点并行计算一个gaussian任务。速度很快。但很纳闷的是，它的计算速度竟然比我自己实验室单台服务器（8核，主频、内存等参数与深圳服务器类似）的计算速度快10倍以上，不知道这是否合理？我怀疑我自己的服务器是不是出问题了，恳请各位牛人解惑。

作者
Author: sobereva 时间: 2015-4-18 05:21

vigaryang 发表于 2015-4-13 23:40
最近几个月在用超算深圳中心的服务器，两个节点（共24核）跨节点并行计算一个gaussian任务。速度很快。但很 ...

就先比单个节点的。将nproc、内存设成同样多比比。并看看CPU架构、软件版本是否一致。

作者
Author: vigaryang 时间: 2015-4-19 10:24

sobereva 发表于 2015-4-18 05:21
就先比单个节点的。将nproc、内存设成同样多比比。并看看CPU架构、软件版本是否一致。

好的，谢谢sob老师！

作者
Author: nuyy 时间: 2015-6-4 04:48
组里有自己的cluster，8核32GB内存的。不过越来越觉得用学校或者科研机构统一管理的supercomputer其实更好，省钱省心

作者
Author: 万里云 时间: 2015-6-16 21:40
上海超算就是个坑。AMD的CPU慢不说，提交任务还要很复杂的脚本，软件版本也老旧。

天津超算CPU不错，编译器等软件也比较新。用得不爽的地方就是没有大内存节点，要跑大任务就得多占核，别人就会有意见。还有一点就是用了自己的mpi，有的软件配置起来很麻烦。

现在一般在超算中心跑一般的DFT计算，内存占用大的在组内的胖节点上算。

作者
Author: zsu007 时间: 2015-7-5 15:53
我免费使用学校里的超算资源，效果很爽！

作者
Author: gzhhe 时间: 2015-7-21 09:29
我们打算自己搭集群，现在已有两台服务器，觉得还是自己有比较方便，虽然刚开始会麻烦点。而且，如果要长期运算，租超算中心每年的费用也不少，觉得还是自己有比较好。

作者
Author: s2nake 时间: 2015-8-17 10:37
一般用不起吧，没钱，呜呜~~
更多的时候是用学校的计算中心，帮忙计算

作者
Author: rocwillow 时间: 2015-9-10 21:11

tzweir 发表于 2015-1-19 20:52
买的广州天河二号的计算资源，按0.1元核小时计费，硬件是目前国内超算中比较新的，性能应该不错。理论上该 ...

请问一下按小时收费，是按软件运行时间吗？

作者
Author: zhuxiaodiu 时间: 2015-9-12 09:25

高雪皎发表于 2014-10-28 21:09
导师在深圳超算中心租了一年天河，128核，一年不到6w，计算速度还是很好的，8核并行要比AMD12核并行速度快 ...

我们导师给买了64核深感计算速度不太好呀 ~~~

作者
Author: 978142355 时间: 2015-11-9 20:05
超算中心是进了群里才听说的，组里都是自己搭建的集群，可是都是组里的一个师兄搭的，包括安装，维护，维修等，所幸的是，近两年有一些服务器出了问题，从购买到硬件和软件的安装都经历到了，学习到了不少知识。对于高斯的DFT计算来说，我个人的计算感觉16个核的比8个核的快（分子只有C、H、O、N四种元素，大概50个原子左右），不过最近通过计算发现，计算文件中的%mem=xxxxMB/GB也是非常重要，对于一个体系，这个给大了给小了，计算时间都超级长。
另外Tinker程序包里的东西不能并行也是真心让人抓狂，以至于动力学跑了1000000歩得跑5天（1万多个原子）。个人认为家中再有不如一技在手，自己搭建集群可以具有随意性，想安什么安什么，只是需要安装人员对这些精通，出现问题得能解决（以下是臆测）租超算中心，可能受限于人，而且毕竟是租的，那里能不能很快更新不好说，可能省去了维护。

作者
Author: milkxx 时间: 2015-11-27 22:11
并行快，避免了服务器维护的麻烦，但是软件安装和调试比较麻烦，不是很方便

作者
Author: tzweir 时间: 2015-12-30 17:09

rocwillow 发表于 2015-9-10 21:11
请问一下按小时收费，是按软件运行时间吗？

就是你用专门的命令提交计算任务的那一刻开始计算机时。任务提交前在超算上的一些准备工作都是不算时间的。

作者
Author: compume 时间: 2016-1-21 10:04
同样使用过深圳的超算中心，384个核……计算速度不如自己买的集群，而且最大的问题是经常出现无法登陆，提交的任务也出现过异常终止。据说比天津超算等其他超算中心差很多（当然暂时还没有试过其他超算）

作者
Author: astrozheng 时间: 2016-4-8 14:27
看来资源不够是普遍现象。
我们这边之前没有国家级的超算中心，只能用学校的HPC机器，速度很快，但是收费贵。自己学院也有两个集群，CPU少而且慢。
新开了个国家级的超算，免费，但是人多，可以用GPU加速，对于做模拟的人还是不错的，以后估计得排队排很久咯。
计算资源实在不够，都不能放心大胆的交job。好在整个区域的网络建的很好，数据传输足够快。网络快实在太重要，传输数据是挺痛苦的事情。

作者
Author: wave0403 时间: 2016-4-9 04:47
提示: 作者被禁止或删除内容自动屏蔽

作者
Author: yezhonghua 时间: 2016-4-14 20:56

高雪皎发表于 2014-10-28 21:09
导师在深圳超算中心租了一年天河，128核，一年不到6w，计算速度还是很好的，8核并行要比AMD12核并行速度快 ...

那就是64核，还不如买了

作者
Author: linuxprobe 时间: 2016-4-26 22:49
我们申请的试用机时，30W不到一个月用完了！！因为可以跨节点，所以速度没得说！上面自带有常用的软件，如果安装商业软件，也比裸机的容易安装写，因为他们把环境都基本搭建好了，总体来说很好用！！！

作者
Author: drdavis 时间: 2016-5-9 22:52
用的院超算中心(免费)，一般是提交TD-DFT、部分post-HF作业，关键是一次性可以提交多个作业，效率明显提高了。有的集群是gaussian 09 C版本的，比A01好用。话说我之前用的A01版本算的还要重新算不？？

至于一部分高精度算法，还是等自己组新买个服务器吧~

作者
Author: liu_tiao 时间: 2016-6-23 18:17
本帖最后由 liu_tiao 于 2016-6-23 18:20 编辑

刚刚来实验室的时候，新买的服务器还没有系统，找同学帮忙，装系统，配网络，搭好集群。然后就是购买软件、租用超算，这些都经历过。相对来说，超算稍微贵一点。如果课题组计算任务不大，在超算租用几十核心的资源，而且超算有专业的工程师维护，省事很多；计算费用，也就几万块钱一年，一般的课题组都能承担。像那种需要几百个cpu的课题组，专门做理论计算的，他们一般都有自己的集群吧。像我这种自己业余的搭建的集群，用更多的核数，计算的效率还没有超算快。。。。

作者
Author: bmwbush 时间: 2016-6-26 15:32
没用过，一是费用，一是担心用了还算不出成果来，不好交差

作者
Author: anmin0127 时间: 2016-8-2 08:56

haizhiwuyu 发表于 2014-11-5 09:36
济南超算中心价格不贵，还可以优惠，操作简单，登录，上传下载都很方便。

济南超算中心都可以计算什么软件啊？费用这块是怎么收的？

作者
Author: alonewolfyang 时间: 2016-11-26 15:50
超算还是不够普及啊

作者
Author: PhoenixYeti 时间: 2016-12-21 08:40
Sob老师，请教个问题。如果组建的集群和购买的超算资源配置相同，比如同样的CPU同样多的核心，那么实际计算效率二者是否有区别？

作者
Author: sobereva 时间: 2016-12-21 09:04

PhoenixYeti 发表于 2016-12-21 08:40
Sob老师，请教个问题。如果组建的集群和购买的超算资源配置相同，比如同样的CPU同样多的核心，那么实际计算 ...

不跨节点都一样
跨节点并行计算的话由于网络连接方式、相关配置不同，会一定程度影响性能

作者
Author: PhoenixYeti 时间: 2016-12-21 21:52

sobereva 发表于 2016-12-21 09:04
不跨节点都一样
跨节点并行计算的话由于网络连接方式、相关配置不同，会一定程度影响性能

噢噢，谢谢老师~

作者
Author: Mirror 时间: 2016-12-22 11:51
用超算挺方便的，出差出国都能用

作者
Author: Accelerator 时间: 2017-3-16 19:41
正在用济南超算进行DFT的构型优化和单点计算。试用期间给2个节点，每个节点24核心。申请的时候注意有两种操作系统，如果要运行Gaussian的话最好用CentOS 6. 试用期间有专用队列，计算速度飞一般的感觉。价格0.1元/CPU时。
我申请了一周的试用期，然而实际试用时间达到了一个多月。。在管理上好像有些松弛（虽然似乎为我们节省了很多钱？233）

作者
Author: friendlyjun 时间: 2017-3-17 13:31

高雪皎发表于 2014-10-28 21:09
导师在深圳超算中心租了一年天河，128核，一年不到6w，计算速度还是很好的，8核并行要比AMD12核并行速度快 ...

+1 去年有段时间也这么做过

作者
Author: legendyao 时间: 2017-3-17 19:44

Accelerator 发表于 2017-3-16 19:41
正在用济南超算进行DFT的构型优化和单点计算。试用期间给2个节点，每个节点24核心。申请的时候注意有两种操 ...

其实算普遍现象啦。。。每次试用快到期时候做可怜泪眼状@@ 一般都能延长滴

作者
Author: SigFig 时间: 2017-3-18 10:46
用的Sharcnet（隶属于ComputeCanada的超算）。
软件Gaussian09D。提交系统非常原始（竟然需要用户自己，自己，自己指定程序所需内存，从软件设计的角度讲这真心不是用户该关心的东西），对于日常管理上百个计算的工作（包括重新提交和错误处理）写了专门的脚本（最近看了看我的脚本已经有100+K了，赶上一个程序了有木有）。
Gaussian那个重启机制非常坑爹（我承认自己照着Gaussian官方的文档做了很多次restart没有一次成功过，是不是我太笨了）。
再加上几个月一次down机，每down一次我就得把我那几百个job重新提交一遍，心累。不过现在都是打一个命令喝一杯咖啡的事。

作者
Author: 化学势 时间: 2017-3-18 13:31
用过自己课题组的集群，也用过我们学校的超算中心(大连理工凌云超算)的刀片节点和胖节点。
性能：
刀片节点CPU是E5-2660v3，每节点20核(可跨节点并行)；主要跑GAUSSIAN，单节点速度差不多是自己组(2012年，AMD 16核并行)的1.5~2.5倍。试过80个左右原子(CHONS)的体系，20核并行，在DSD-PBEP86-D3/ma-def2-TZVPP下算单点能，2天不到算完。
胖节点CPU是E7-8857v2，每节点96核；我主要跑ORCA，我觉得相当快，调试好后，只用16核并行50个左右的原子(CHONS元素)，在DLPNO-CCSD(T)/aug-cc-pVTZ水平下算单点能1天左右。

便利程度：
我觉得很便利，各种MPI、库都很全，安装好的免费软件很多(基本上免费的主流软件都有)，手册很全。校外用VPN登陆也很方便。

费用：
没用过其他超算，无法比较，具体详见：
http://hpc.dlut.edu.cn/yejiedong ... 6&wbnewsid=1081

限制：

没啥特殊限制

就这么多吧！

作者
Author: Accelerator 时间: 2017-3-19 10:17

legendyao 发表于 2017-3-17 19:44
其实算普遍现象啦。。。每次试用快到期时候做可怜泪眼状@@ 一般都能延长滴

然而我完全没有做可怜状←_←对方似乎完全忘记了收回试用账号233
甚至现在已经签了合同得到了正式账号，试用账号依然可以用。。

作者
Author: chrischen1128 时间: 2017-4-13 20:23
觉得超算用起来比较麻烦，不喜欢。

作者
Author: lzy0702 时间: 2017-5-2 10:45
在用Google Cloud，有300刀的赠金。申请开64线程的机器需要充值35刀。
64线程（2.2G Broadwell）+240GB内存的机器跑可抢占实例，300刀的赠金大概可以跑460小时。一个月按730小时算，全部在跑大概480刀。
课题组里可以每人弄一个Google 账号各搞一轮，对我们这种不做太多计算的组可以折腾相当长时间。

作者
Author: gchen001 时间: 2017-6-15 14:04
很多超算还在使用红帽5的操作系统，以至于不能安装GLIBC2.5及以上的库，新版本的高斯不能使用。

作者
Author: hanshan 时间: 2017-7-1 11:19

jiahh 发表于 2014-10-21 17:26
使用的是国家超级计算天津中心，因为节点可并行运算，运算速度要比集群和单片机快的多，美中不 ...

天津超算是2011年成立的，所以硬件可能也需要更新换代

作者
Author: qcn 时间: 2017-7-5 18:27

化学势发表于 2017-3-18 13:31
用过自己课题组的集群，也用过我们学校的超算中心(大连理工凌云超算)的刀片节点和胖节点。
性能：
刀片节 ...

请问我电脑有高斯软件，但单位的高性能计算机上没有高斯软件，这样也可以借助高性能服务计算吗？

作者
Author: 圣人惠 时间: 2017-7-18 10:11
本人新手，刚一开始上手就是用的超算，深圳超算，可能先入为主吧，个人觉得还不错

作者
Author: sobereva 时间: 2017-7-19 05:42

qcn 发表于 2017-7-5 18:27
请问我电脑有高斯软件，但单位的高性能计算机上没有高斯软件，这样也可以借助高性能服务计算吗？

你当然得服务器上也装了高斯才行

作者
Author: qcn 时间: 2017-7-19 12:20
谢谢sob老师的回复

作者
Author: rioning 时间: 2017-8-15 16:31
用的天河2号，广州中心~

作者
Author: lina 时间: 2017-8-25 16:01
使用深圳超算半年，速度并没感觉很快，而且稍微大点体系计算TD单点总是出错，浪费了好多机时后改到最慢的FN分区，计算才得以进行。

作者
Author: 五十八 时间: 2017-10-10 17:24
此前一直使用组内的服务器，今来偶尔用了下太湖神威，虽然是测试账号，但是满足运行小于1小时的小任务的运行，符合我现在的需求。感觉除了编译VASP、Gaussian和提交任务有些不同，其他还是蛮快的，主要是队列很空，不必考虑排队。

作者
Author: legendyao 时间: 2017-11-6 16:37

五十八发表于 2017-10-10 17:24
此前一直使用组内的服务器，今来偶尔用了下太湖神威，虽然是测试账号，但是满足运行小于1小时的小任务的运 ...

求问太湖之光用的什么编译器呀，openACC吗？VASP之类的是不是需要移植的

作者
Author: 五十八 时间: 2017-11-6 18:28

legendyao 发表于 2017-11-6 16:37
求问太湖之光用的什么编译器呀，openACC吗？VASP之类的是不是需要移植的

用的是swxxx 就是神威自己的编译器， vasp已经有人在做移植了，首批效率不高，估计第二次快出来了，另外要是自己编译的话要注意结合sw的slurm来编译，而且intel cpu版本的vasp编译也要注意不然可能无法使用并行。另外SW现在C的适配还是最好的， VASP其实已经可以用openmp 改一改成openacc 然后不用mpi也可以的。

作者
Author: 1234bubble 时间: 2017-12-10 18:03
用过安徽大学的超算，当时是不收钱的，不过计算速度太慢，更加要命的是系统各种软硬件问题，提交的任务没有几个能一次性正常完成的，心好累。
今年10月申请中科大的超算，原因是发一篇SCI并致谢会奖励2W~20W核时，加入超算群后发现基础价格偏高（0.2/核时，校外0.3）、故障率偏高、排队比较多，兴致不大了。
目前计算主要是Sob老师推荐的淘宝服务器，2*2696V4非常舒心。
要说自己买机器不足之处也有，例如受到办公楼电线功率限制，夏天太热只能忍痛关一部分机器，需要自己维护等。

作者
Author: yezhonghua 时间: 2018-1-10 19:36
请教一下sober老师，上海超算中心的设备这么样，魔方2的硬件感觉还是不错的，单个节点24核心，http://www.ssc.net.cn/resources_1.aspx
不知道sober老师有么有用过，能够给点相关建议，谢谢！

作者
Author: sobereva 时间: 2018-1-10 20:01

yezhonghua 发表于 2018-1-10 19:36
请教一下sober老师，上海超算中心的设备这么样，魔方2的硬件感觉还是不错的，单个节点24核心，http://www.s ...

没用过。我做计算都在我自己的服务器上跑

作者
Author: flour_wheat 时间: 2018-1-19 21:31
自己的工作站。E5 2690V4 X 2。
6万。个人认为还是自己的工作站用起来方便。
主要用Gaussian。Site License 的 D01。运算量不是很大。用超算的机器总觉得不如自己的方便。大概就是自驾游与坐高铁的区别吧。

作者
Author: 在葵夏遇见蓝火 时间: 2018-3-4 11:02

patience2014 发表于 2014-12-4 12:44
在深圳超算中心买了35核，一年2万2左右，主要用高斯程序，只有自己用感觉资源够用。

请问从哪里能看到具体的租用价钱？

作者
Author: timandywang 时间: 2018-3-20 14:05
在新加坡国大，用NSCC (National Super Computing Center)的超算，学生有10'000 min的免费机时，一个账号同时可以使用两百多CPU（我没打到过并行的上限所以不知道最多是多少），感觉还是蛮爽的，现在提交任务都是4 node:: 24 cpu的算，处理大体系真是舒心啊！我做固体表面催化的，这个真的是很给力呢！

作者
Author: 朙天儿 时间: 2018-3-30 15:04
本帖最后由朙天儿于 2018-3-30 15:38 编辑

用的某所组内超算，费用木有，据说电量每年要几W，未详细考证具体数据，节点有不同的批次，登录因为网络安全等问题，会有一定限制，有专门人员负责维护，有gaussian namd gmx vmd tinker tinker等，这些我不怎么用Oz.。
本校也有超算中心，标准机时单价近年为0.12元/核时。但根据使用节点类型、使用量、使用时间、使用频率等有各种优惠政策，乘以相应的＜1 的权重系数，算下来性价比应该不错；一旦注册使用，有一套比较友好完善的计费系统。软件资源比较丰富，不小心看到前X楼有介绍得很详细的，比我了解得多。

作者
Author: 望月凝香 时间: 2018-3-31 13:50
自己组不是做计算的组，老板也不可能掏钱自己装。
我现在是简单计算和占用资源大的单个计算用我自己的计算机算（我同时也搞视频压制，所以当年配了高配PC，装了linux系统就可以跑计算了），小计算好理解，占用资源大的单个计算则是因为排队时间长还不如自己跑。对于中等规模的计算，基本是类似过程的批量计算，是在自己机器上跑了第一个确认无误以后扔服务器批量。

作者
Author: 小巨人 时间: 2018-4-7 16:43

tzweir 发表于 2015-1-19 20:52
买的广州天河二号的计算资源，按0.1元核小时计费，硬件是目前国内超算中比较新的，性能应该不错。理论上该 ...

请问一下，没使用广州超算，也没有高斯软件版权，在写文章的时候可不可以在致谢部分写上广州超算呢？

作者
Author: flying 时间: 2018-5-23 08:16
目前，据我了解，广州、深圳、长沙、天津、济南、无锡都有超算中心。从价格来说，广州、长沙、天津的价格都是0.1元/核·时，其中当购买机时超过10万核·时时，长沙、天津超算会有优惠政策。无锡超算用的是太湖之光，价格略贵（0.2元/核·时，购买超过100万核·时，优惠五折）上面软件据我所知是最全的，有高斯、VASP等常用软件。其中，长沙超算联系过，但感觉服务态度有些问题，打电话联系，工作人员直接把电话给挂了。

作者
Author: flying 时间: 2018-5-23 08:16
不知道大家是什么看法

作者
Author: legendyao 时间: 2018-5-23 09:15

小巨人发表于 2018-4-7 16:43
请问一下，没使用广州超算，也没有高斯软件版权，在写文章的时候可不可以在致谢部分写上广州超算呢？

如果超算中心没有明确说有版权，绝对不要这么写，会引起很多纠纷

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Author: pool 时间: 2018-5-23 09:44
有没有哪的超算可以先试用？

作者
Author: flying 时间: 2018-5-23 15:06
天津超算、深圳超算、吕梁云超算中心、广州超算都可以先试用

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Author: zy0411 时间: 2018-5-30 00:24
不太常用

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Author: 算一算 时间: 2018-9-21 13:46
每个大学不是都有几台超级计算机吗？我在以前的学校和现在的学校都是连到学校的超级计算机上跑计算任务的。人多的时候要排队，提交的任务有时候要等几小时才开始跑，不过不拥挤的时候就特别快。拥挤的时候还是用自己办公室里的PC(intel i7)，有排队那时间早跑完了。

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Author: xiaoma0417 时间: 2018-11-26 22:43

jiahh 发表于 2014-10-21 17:26
使用的是国家超级计算天津中心，因为节点可并行运算，运算速度要比集群和单片机快的多，美中不 ...

请问怎么收费的呢？

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Author: Accelerator 时间: 2018-12-8 21:23
暑假在德州农工访问两个月，在那里使用过一个校级集群和他们电子系的集群。校级集群一共2 w个核心，用的D A Singleton的账号（他的账号里的机时有九位数），不过一般比较满要排挺久的队（似乎是那里有几个做核物理的组占用了大部分）；还有一个电子系的集群，有几千个核心，而且是免费，申请即可使用，而且平时没有什么人用，也不限制每个人占用的核心数，所以用起来极为愉悦。不过这个电子系的集群主要是AMD的CPU(最近又添置了一些Gold)，做量化还是吃亏不少。
虽然感觉大家也都不会用到TAMU的集群（需要TAMU教工才能使用），不过就是单纯感慨一下你国的世界一流大学和美国一流（?）大学的硬件设施差距还是很大的。

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Author: Accelerator 时间: 2018-12-8 21:24

yezhonghua 发表于 2018-1-10 19:36
请教一下sober老师，上海超算中心的设备这么样，魔方2的硬件感觉还是不错的，单个节点24核心，http://www.s ...

魔方和上海的另一个集群都用过，非常适合Gaussian计算。那里的客服人也非常好。

作者
Author: 望月凝香 时间: 2018-12-9 03:54

Accelerator 发表于 2018-12-8 21:24
魔方和上海的另一个集群都用过，非常适合Gaussian计算。那里的客服人也非常好。

我想问一下，如果课题组自己没有买高斯，用有高斯的超算搞计算，最后发文章的时候是需要acknowledgement里面包含超算中心还是coauthor里面要加超算中心的人？

作者
Author: Accelerator 时间: 2018-12-9 11:33

望月凝香发表于 2018-12-9 03:54
我想问一下，如果课题组自己没有买高斯，用有高斯的超算搞计算，最后发文章的时候是需要acknowledgement ...

超算中心

作者
Author: liuyjhx 时间: 2019-6-27 22:47

nuyy 发表于 2015-6-4 04:48
组里有自己的cluster，8核32GB内存的。不过越来越觉得用学校或者科研机构统一管理的supercomputer其实更好 ...

我们学校的超算排不上对队啊

作者
Author: dwen 时间: 2019-9-17 10:44
数据传输的一般都是硬伤，不过数据量特别大的话很多中心支持硬盘快递直接拷贝。超算中心除了知名，还需要考量硬件的迭代，cpu、gpu太旧性能也会衰减。CPU这块有没有虚拟化（开启超线程），也需要考虑

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