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标题: Gromacs如何实现NPγT系综? [打印本页]

作者
Author:
xiaoruoqiu    时间: 2017-9-11 15:14
标题: Gromacs如何实现NPγT系综?
模拟磷脂双分子层时可以对x/y方向施加恒定表面张力γ,是为NPγT系综。看了几篇文献,里面的方法描述都是一笔带过,具体如何实现始终不得要领。

如果根据表面张力计算公式 γ = (1/n)  * < Lz * (Pzz - (Pxx + Pyy) / 2) >,使用半各向同性控压,调整x/y向压强数值即可得到不同的表面张力数值。

不知所谓NPγT系综,是否就是用此方法实现的?烦请诸神解答?

作者
Author:
sobereva    时间: 2017-9-11 16:57
gromacs手册里搜Surface-tension coupling可以找到具体实现的公式
gmx里用pcoupltype=surface-tension可以实现
作者
Author:
xiaoruoqiu    时间: 2017-9-11 18:48
sobereva 发表于 2017-9-11 16:57
gromacs手册里搜Surface-tension coupling可以找到具体实现的公式
gmx里用pcoupltype=surface-tension可以 ...

是我自己看手册不认真,麻烦Sob老师了,谢谢




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