计算化学公社

标题: 求助metadynamics的参数设置 [打印本页]

作者
Author:
laifeng20151107    时间: 2017-9-15 11:44
标题: 求助metadynamics的参数设置
我现在想要用CPMD中的Metadynamics做Cu(Ac)2+2Cl-=CuCl2+2Ac- 这个交换反应,CV选的是Ac和Cl与Cu的配位数。 我不知道SCF KCV MCV 还有HILL的参数该如何设置,有什么方法可以的到这里参数的设置,还有我的实验是在有55个水分子的盒子里进行的。
作者
Author:
beyond    时间: 2017-9-15 19:21
不知道KCV与MCV是什么参数,感觉与metadynamics没关系吧。

metadynamics的参数 sigma与height (biasfactor),不同的体系,不同的的CV都会有所不同的,需要自己前期做一些简单的
测试与调整。

sigma一般取normal MD中 CV波动范围值,或者其一半,height一般1 kJ/mol的样子, biasfactor与你计算的反映势垒有关。
可以读一读metadynamics的几篇综述。
作者
Author:
18258036115    时间: 2020-8-21 21:05
beyond 发表于 2017-9-15 19:21
不知道KCV与MCV是什么参数,感觉与metadynamics没关系吧。

metadynamics的参数 sigma与height (biasfac ...

老师您好,请问对于SIGMA的选取以及biasfactor的确定,可以采用什么样的方式去调整测试?另外如果我的CV选取的是两个分子间的质心距离,如果我的CV范围超过了盒子的边界,那是不是只能去做一个更大的盒子的体系,有办法可以解决这个问题吗?谢谢老师。




欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3