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标题: 关于只中止gaussian相关的作业，保留其它作业问题 [打印本页]

作者
Author: meatball1982 时间: 2017-9-18 13:59
标题: 关于只中止gaussian相关的作业，保留其它作业问题
大家好:
   我在连续的节点c1-01,c1-02...c1-10上（通过脚本）提交了gaussian 的作业。各个节点上，还有gromacs的作业。
   因为需要修改，我现在需要把各个节点上的gaussian相关的作来kill掉。

   之前，只要killall -u 我的用户名，把所有作业kill就行。
   现在，我想让gromacs的作业继续运行，只kill gaussian相关的。请问，应该如何实现。
   谢谢。

作者
Author: xylz6188 时间: 2017-9-18 14:53
qdel 作业编号

作者
Author: Graphite 时间: 2017-9-19 21:34
本帖最后由 Graphite 于 2017-9-19 21:39 编辑

kill $(ps -ao comm,pid | grep -E 'l[0-9]{1,4}\.exe' | gawk '{ print $2 }')

复制代码

原理：ps -ao comm,pid生成一个含有COMMAND和PID项的进程表，然后grep在此表内搜索lxxx.exe，gawk把pid那一项取出扔给kill
grep和gawk换sed也一样
(, 下载次数 Times of downloads: 53)
单机zsh用户：

kill l

复制代码

按一下tab就自动补齐了，有其他以字母l开头进程的话会让你选。

作者
Author: meatball1982 时间: 2017-9-20 14:38

Graphite 发表于 2017-9-19 21:34
原理：ps -ao comm,pid生成一个含有COMMAND和PID项的进程表，然后grep在此表内搜索lxxx.exe，gawk把pid那一 ...

非常感谢。我尝试一下先。

作者
Author: meatball1982 时间: 2017-9-22 11:12

xylz6188 发表于 2017-9-18 14:53
qdel 作业编号

你好，请问，我应该如何得到作来号，
我通过脚本ssh 进到节点，交作来，再退出来。
这时，把作业号输出到文件里？
还是通过其它的方式？

作者
Author: meatball1982 时间: 2017-9-22 11:14

Graphite 发表于 2017-9-19 21:34
原理：ps -ao comm,pid生成一个含有COMMAND和PID项的进程表，然后grep在此表内搜索lxxx.exe，gawk把pid那一 ...

你好。
通过
ps -ao comm,pid
并没有关于gaussian的作业。

虽然top 后，
是有l906.exe的。

ps -ao comm,pid
返回
COMMAND PID
ps 22945

我的系统是centos。

作者
Author: xylz6188 时间: 2017-9-22 14:38

meatball1982 发表于 2017-9-22 11:12
你好，请问，我应该如何得到作来号，
我通过脚本ssh 进到节点，交作来，再退出来。
这时，把作业号输出 ...

祖业编号直接qstat 或者top就可以看到

作者
Author: meatball1982 时间: 2017-9-22 15:59

xylz6188 发表于 2017-9-22 14:38
祖业编号直接qstat 或者top就可以看到

收到。谢谢。

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