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标题: Mopac如何消虚频 [打印本页]

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Shannon    时间: 2015-1-26 07:01
标题: Mopac如何消虚频
请教一个关于用mopac2012优化 产生虚频的问题。
用PM7优化了一个35个原子的体系,但是用force关键词算频率的时候总是会产生虚频。
优化时候用的是这个 方法:PM7 eps=78.54 recalc=0 FLEPO GNORM=0.0 DMAX=0.05 CHARGE=0
计算频率用的是:PM7 eps=78.54 Force LET CHARGE=0 试过很多关键词,还是不知道该如何消掉虚频……剩余两个虚频,一个 -200,一个 -100。
这个虚频是因为mopac没有解析二阶导数的原因吗?怎么都消不掉。
想用Mopac算出来的 带有数目不对的 虚频的 震动频率,修改删除掉 小虚频, 然后用 过渡态理论TST 计算反应速率,不知道 结果可信吗?  



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sobereva    时间: 2015-1-26 08:20
优化时写上PRECISE关键词增加计算精度
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Shannon    时间: 2015-1-26 08:30
sobereva 发表于 2015-1-26 08:20
优化时写上PRECISE关键词增加计算精度

precise用过了,也还是存留有虚频。我怀疑是因为体系内 有几个受阻转动,可能是它们导致的顽固虚频。不知道能否在输出结果里面把negative eigenvalue的值 直接改成 正值,然后和 ORCA还有高斯结果拼到一起, 塞到kisthelp里面算反应速度(感觉这样有点篡改数据,通不过审稿人的样子)。
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sobereva    时间: 2015-1-26 09:22
可以把输入输出文件发给MOPAC作者J.J.P.Stewart问他怎么处理,他回信很快。
才35个原子,没必要用半经验

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Shannon    时间: 2015-1-26 22:06
sobereva 发表于 2015-1-26 09:22
可以把输入输出文件发给MOPAC作者J.J.P.Stewart问他怎么处理,他回信很快。
才35个原子,没必要用半经验

谢谢sob,我多收集点数据,然后问问Stewart该怎么办




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