计算化学公社

标题: 想做NLMO分析，但是输出文件没有这部分信息 [打印本页]

作者
Author: 哈哈宝 时间: 2015-1-26 17:44
标题: 想做NLMO分析，但是输出文件没有这部分信息
按照sob老师《将核独立化学位移（NICS）分解为sigma和pi轨道的贡献》博文中的指导，我利用G09软件， b3lyp/6-31+G* 成功的重复了benzene的NLMO。但是当我将同样的命令行，只是换了基组和泛函PBE1PBE/lanl2dz，结果在输出文件中却没有NLMO的输出，在文件的结尾出现这样的信息，请求各位前辈指点一下，谢谢！输入文件：
%chk=D3h-NICS-NLMO.chk
%mem=8000MB
%nprocshared=8
#p pbe1pbe/lanl2dz pop=NCSall iop(6/65=-1) NMR

输出文件结尾：
NATURAL LOCALIZED MOLECULAR ORBITAL (NLMO) ANALYSIS:

Highest occupied NBOs are not at the beginning of the NBO list;
The NLMO program is not currently set up to handle this.
Leave Link 607 at Mon Jan 26 17:13:26 2015, MaxMem= 1048576000 cpu: 14.8
(Enter /home/zhang/opt/g09/l9999.exe)

是什么缘故呢？

作者
Author: sobereva 时间: 2015-1-26 21:37
这是NBO 3.1的NLMO分析的众所周知的一个bug。如提示所示，必须让占据数最高的NBO出现在所有NBO的最前头。这需要观察输出文件中的NBO列表，调整输入文件里的原子顺序，把占据数最高的NBO涉及的原子放到最前头。
但有时这么调了也不管用，就只能用更新的NBO版本了，或者用别的方式分解NICS。

后记：如果你的目的只是单纯得到定域化轨道，用Multiwfn是最完美选择，比用NBO做NLMO强得多得多，看
Multiwfn的轨道定域化功能的使用以及与NBO、AdNDP分析的对比
http://sobereva.com/380

作者
Author: 哈哈宝 时间: 2015-1-27 11:10
非常感谢sob老师，修改输入的原子顺序，没有解决我的问题，我再另行想办法分解NICS吧！

作者
Author: 紫轩冰蓝0 时间: 2019-3-31 16:57
sob老师，我已经看了您的博文“Multiwfn的轨道定域化功能的使用以及与NBO、AdNDP分析的对比”以及说明书的相关部分。想咨询一下能不能使用Multiwfn轨道定域功能输出相应的原子的电荷，万分感谢！

作者
Author: AndrewX 时间: 2022-9-8 04:47

sobereva 发表于 2015-1-26 21:37
这是NBO 3.1的NLMO分析的众所周知的一个bug。如提示所示，必须让占据数最高的NBO出现在所有NBO的最前头。这 ...

Sob老师，我遇到了跟一楼一样的问题，您说的“用更新的NBO版本”，我有点不明白，我手上是有NBO6的，请问如何用gennbo计算NLMO呢？
我的输入文件如下：
%chk=C6H4UO2Clnlmo.chk
%nprocshared=4
%mem=4GB
# opt freq b3lyp/genecp pop=savenlmo

Title Card Required

-1 1
U                -0.31859400 0.61060800 0.00000000
C                1.77098100 -2.46815600 0.00000000
C                1.35416400 -3.80402500 0.00000000
C                -0.01094900 -4.11473700 0.00000000
C                -0.96672300 -3.09162700 0.00000000
C                -0.54490600 -1.75944200 0.00000000
H                2.08926300 -4.60566700 0.00000000
C                0.81204600 -1.45132200 0.00000000
Cl                1.23324300 2.83239500 0.00000000
O                -0.54490600 0.69834800 1.78755500
O                -0.54490600 0.69834800 -1.78755500
H                2.83720100 -2.24486000 0.00000000
H                -2.02378200 -3.35794600 0.00000000
H                -0.32635600 -5.15590500 0.00000000

U 0
SDD
****
H C O Cl 0
6-311++G**
****

U 0
SDD

$NBO archive file=C6H4UO2Clnlmo $END

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