计算化学公社

标题: 怎样在高斯计算,溶剂中添加重原子?谢谢 [打印本页]

作者
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小范范1989    时间: 2015-1-26 19:52
标题: 怎样在高斯计算,溶剂中添加重原子?谢谢
重原子效应分为分子外和分子内,
对于分子内应该就是在分子体系中添加重原子,
如果想添加分子外重原子效应怎么添加?高斯的溶剂中输入是怎么输入的?
scrf=(solvent=??)
问题的起因是因为看到文章中有:exploiting the external heavy-atom effect,我想看看怎么在高斯计算中,添加重原子。
谢谢指点。

作者
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diaolanxinyu    时间: 2015-1-26 21:02
关于高斯中的溶剂,查看手册关键词SCRF就会找到,如下:
已定义溶剂的列表
SCRF=Solvent选项可以接受以下的溶剂关键词。为了方便我们列出了ε值,但要注意
它仅是定义溶剂的众多内部参数之一。因此,简单改变ε值并不能正确定义新的溶剂。
    Water  ε=78.3553
    Acetonitrile  ε=35.688
作者
Author:
小范范1989    时间: 2015-1-26 21:25
diaolanxinyu 发表于 2015-1-26 21:02
关于高斯中的溶剂,查看手册关键词SCRF就会找到,如下:
已定义溶剂的列表
SCRF=Solvent选项可以接受以 ...

谢谢你的回复,
我知道在高斯中输入已有的溶剂,比如:scrf=(pcm,solvent=water)
我也知道点自定义溶剂的方式,SCRF=(pcm,read)  
EPS=36.71
RSOLV=2.647
DENSITY=0.00778
EPSINF=1.75
等等

我目前想知道的是,怎样在溶剂中添加重金属,我不太理解溶剂中怎样添加,也不会添加,
谢谢你的指点。

作者
Author:
sobereva    时间: 2015-1-26 21:50
应该先仔细看那篇文章,确认分子外重原子效应到底指的是什么,有没有可能通过隐式溶剂模型表现。隐式溶剂模型很有局限性,只是把溶剂当成连续介质以介电常数来表现。隐式溶剂模型表现不了的话,就直接在分子周围画上一些带重原子的溶剂分子。
作者
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小范范1989    时间: 2015-1-26 22:10
sobereva 发表于 2015-1-26 21:50
应该先仔细看那篇文章,确认分子外重原子效应到底指的是什么,有没有可能通过隐式溶剂模型表现。隐式溶剂模 ...

偶,这样子,谢谢sob,我在好好看看,等后面在交流,谢谢sob的指点。




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