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标题: 请教关于tip4pew和tip5p水模型的构建过程,以及拟合力场参数的相关文献? [打印本页]

作者
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jase20    时间: 2017-10-7 02:26
标题: 请教关于tip4pew和tip5p水模型的构建过程,以及拟合力场参数的相关文献?
最近对力场参数的拟合有点感兴趣,看了文献上引用的tip4p或者5p水模型的文章,貌似没找到介绍如何拟合力场参数并搭建这个模型的过程,请问相关的文章在哪里可以找到呢?另外需要拟合力场参数,应该从哪些方面入手呢?


作者
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agent99    时间: 2017-10-7 06:22
原始文献:
TIP4P-Ew    http://aip.scitation.org/doi/10.1063/1.1683075
TIP5P    http://aip.scitation.org/doi/10.1063/1.481505
文章里都讲了拟合的过程。
水的模型除此之外还有很多种,个人认为没必要自己去拟合参数,除非是想练手。
作者
Author:
jase20    时间: 2017-10-7 13:59
agent99 发表于 2017-10-7 06:22
原始文献:
TIP4P-Ew    http://aip.scitation.org/doi/10.1063/1.1683075
TIP5P    http://aip.scitatio ...

嗯嗯,谢谢,不是想拟合水模型。因为也是想拟合力场参数,正好想到了tip5p,想看看他是咋拟合的,作为参考,哈哈~谢啦
作者
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sobereva    时间: 2017-10-7 19:48
不同体系涉及的力场参数拟合的策略差异是比较大的,一般体系的力场参数的获取,用水的策略作为参考没有太大可参考性,毕竟水一般当做刚性处理,而且涉及的要优化的参数很少。
相对来说,我建议看看TIP3P-FB的原文J. Phys. Chem. Lett. 2014, 5, 1885−1891,用到的优化参数的方法系统性、普适性较强。而且作者还专门提供了一个优化参数的程序可以下载。TIP5P比较烂,不仅用了五点模型,诸多性质模拟结果还不如TIP3P-FB好。

作者
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jase20    时间: 2017-10-8 21:06
sobereva 发表于 2017-10-7 19:48
不同体系涉及的力场参数拟合的策略差异是比较大的,一般体系的力场参数的获取,用水的策略作为参考没有太大 ...

谢谢Sob老师
作者
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aken5555    时间: 2019-10-19 23:48
谢谢Sob老师
作者
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Fmu    时间: 2021-2-28 15:35
新手上路,求问用Gromacs模拟时提示没有TIP4P-ew,怎么处理?
作者
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sobereva    时间: 2021-3-2 02:10
Fmu 发表于 2021-2-28 15:35
新手上路,求问用Gromacs模拟时提示没有TIP4P-ew,怎么处理?

操作不对,说清楚怎么做的,直接贴报错
tip4pew.itp在gmx的top的一些力场目录下直接自带了,include就完了




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