计算化学公社

标题: 找CH2OO（自由基）+H2SO4过渡态的问题 [打印本页]

作者
Author: moonlight2690 时间: 2017-10-8 22:14
标题: 找CH2OO（自由基）+H2SO4过渡态的问题
老师，您好，请教过渡态的问题，输入文件和输出文件分别如下，反应物为CH2OO（自由基）+H2SO4，反应过程为CH2OO中的C和H2SO4中的一个O原子成键，H2SO4中的一个H原子给CH2OO中的一个O，最终形成HOOCH2OSO3H，但是跑完ts后输出文件中显示l9999错误，且结构已经是生成物了，请问这种情况下如何处理以便找到正确的过渡态？

作者
Author: sobereva 时间: 2017-10-9 00:26
两个过程应当不是一步完成的，先找出其中一步的TS再找另外一步
过渡态初猜不合适会导致优化到极小点去。你的初猜就不甚合理，要与O成键的C旁边的氢应当往旁边掰一点，有助于收敛到过渡态。也可以借助C-O的柔性扫描帮助确定过渡态初猜结构。而且要发生氢转移，O-H的键长也应该拉长才对（比平衡键长长1/3左右通常比较合适）
找过渡态绝对不是把两个单体摆的位置大致合适就完了，内部变量照样也得调整，使之介于反应物和产物结构之间。

作者
Author: xujian 时间: 2017-10-9 11:04
或者你还可以先优化出最终产物，然后找其分解成两个反应物的过渡态

作者
Author: liuyjhx 时间: 2019-6-10 23:03

xujian 发表于 2017-10-9 11:04
或者你还可以先优化出最终产物，然后找其分解成两个反应物的过渡态

我就是按照这种方法找，但是我发现找不到啊，我用柔性扫描也是能量一直在降，感觉应该是有过渡态的存在

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)