计算化学公社

标题: 集群上提交任务排队异常请问什么原因 [打印本页]

作者
Author: 万卷书万里路 时间: 2017-10-10 21:42
标题: 集群上提交任务排队异常请问什么原因
最近发现我的账号在集群上提交多个任务时只能运算第一个，从第二个开始就一直排队，即使当前集群上有很多空节点和足够多的内存，并且，第一个任务算完以后，第二个以及以后的那些在排队的仍然不会给算，还是在排队。
我试了下，如果我不管他们，他们会一直在排队，也不计算。但是我如果在第一个任务算完以后，再提交一个任务，这个新提交的就会给算；如果新提交多个任务，会发生同样的现象：只算这些任务中的第一个。其余仍然一直排队。所有计算输入文件均没有错误。
问了管理员你，都搞不清是什么原因，希望有老师和大神能指点下~
（为了便于理解，贴图说明）（在公社qq群里问过，但是没有回复，我觉得是我没贴图，没能让人理解）
十分感谢！

作者
Author: limaolin0 时间: 2017-10-10 22:23
是不是和定义的队列属性有关？每个人每个群组每个队列至多能提交的任务数被限制了。

作者
Author: bluewhale 时间: 2017-10-11 08:28
安装了maui吗？ Torque版本？

作者
Author: abdoman 时间: 2017-10-11 08:59
是不是设置了你的帐户属性不对。比如每次只能有1个running job。

作者
Author: kyuu 时间: 2017-10-16 09:43
系统里有一个queueing formula，管理员有实力可以改，另计划任务是有预见性的，需要在一定周期内达到资源可足够分配才能分配资源，这不意味着你所看到资源可用即可分配

作者
Author: 万卷书万里路 时间: 2017-10-16 20:39
谢谢各位老师的回复！
我观察了这几天, 却又有的时候可以跑3、4个任务，有的时候只能跑一个，也不是账户属性的设置，可能是kyuu老师说的“不一定看到的资源可用即可分配”

作者
Author: kyuu 时间: 2017-10-16 23:04
本帖最后由 kyuu 于 2017-10-16 23:12 编辑

万卷书万里路发表于 2017-10-16 20:39
谢谢各位老师的回复！
我观察了这几天, 却又有的时候可以跑3、4个任务，有的时候只能跑一个，也不是账户属 ...

影响排队时间的几个主要因子：节点数、CPU核数、wall time、GPU数量、内存，
你把任务的size缩小，一定能快速排上队，如果只是为了测试任务脚本，1，用一到两个cpu，wall time别设几百个小时，几个小时即可， 2，使用互动模式， 3，如果任务足够快，几分钟内可结束，登录节点直接算没问题（尽量使用2），一定要学会合理的预估计算资源规模，有利于减少排队时间

作者
Author: 万卷书万里路 时间: 2017-10-17 09:05

kyuu 发表于 2017-10-16 23:04
影响排队时间的几个主要因子：节点数、CPU核数、wall time、GPU数量、内存，
你把任务的size缩小，一定 ...

好的，学到啦

谢谢老师！

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