计算化学公社

标题: pop(nbo,full)这个关键字是什么意思? [打印本页]

作者
Author:
DUNING    时间: 2017-10-12 11:12
标题: pop(nbo,full)这个关键字是什么意思?
加了这个关键词之后,用得到的fchk文件做出的分子轨道图是正则分子轨道还是定域分子轨道呢?
作者
Author:
zjxitcc    时间: 2017-10-12 12:05
(1)两个词什么意思,说明书里写的很清楚;
(2)有无full与用fchk文件看轨道没有关系;
(3)想看结果是正则轨道或是自然键轨道,自己算一个甲烷或者苯的单点计算,打开fchk对比就知道了。
作者
Author:
sobereva    时间: 2017-10-12 12:31
nbo,full只影响输出信息,不影响chk里记录的轨道。怎么看NBO轨道看
使用Multiwfn绘制NBO及相关轨道
http://sobereva.com/134

此类问题找个简单体系对比测试一下便知。

另外,NBO轨道也不叫定域分子轨道(或定域化分子轨道),而只能说是高定域性的轨道,看此文了解基础
Multiwfn的轨道定域化功能的使用以及与NBO、AdNDP分析的对比
http://sobereva.com/380
作者
Author:
DUNING    时间: 2017-10-12 16:09
本帖最后由 DUNING 于 2017-10-12 16:33 编辑
sobereva 发表于 2017-10-12 12:31
nbo,full只影响输出信息,不影响chk里记录的轨道。怎么看NBO轨道看
使用Multiwfn绘制NBO及相关轨道
http: ...

谢谢老师,那意思是我用pop(nbo,full)时得到的还是正则分子轨道,只不过输出文件是作了NBO分析的。用pop(nbo,savenbo)关键词时,就是把nbo轨道写入chk文件,最后画出的轨道就是NBO轨道。这样理解合适吗?
作者
Author:
DUNING    时间: 2017-10-12 16:20
zjxitcc 发表于 2017-10-12 12:05
(1)两个词什么意思,说明书里写的很清楚;
(2)有无full与用fchk文件看轨道没有关系;
(3)想看结果 ...

谢谢老师,我之前用甲烷做过轨道。当用 pop(nbo,full)这个关键字时,得到的轨道我感觉是正则分子轨道,用 pop(nbo,savenbo)这个关键字时,好像得到的又是自然键轨道。但是pop=nbo不就是为了得到高定域性的轨道吗?
作者
Author:
sobereva    时间: 2017-10-12 17:09
DUNING 发表于 2017-10-12 16:20
谢谢老师,我之前用甲烷做过轨道。当用 pop(nbo,full)这个关键字时,得到的轨道我感觉是正则分子轨道,用 ...

你用savenbo的时候程序才会把NBO轨道代替正则分子轨道存到chk里
pop=nbo会做一堆分析,不仅仅是产生NBO轨道
作者
Author:
DUNING    时间: 2017-10-12 17:39
sobereva 发表于 2017-10-12 17:09
你用savenbo的时候程序才会把NBO轨道代替正则分子轨道存到chk里
pop=nbo会做一堆分析,不仅仅是产生NBO ...

好的,谢谢老师。那有没有可能有的正则分子轨道定域性比较高,可以从中看出一些成键信息?
作者
Author:
sobereva    时间: 2017-10-12 17:49
DUNING 发表于 2017-10-12 17:39
好的,谢谢老师。那有没有可能有的正则分子轨道定域性比较高,可以从中看出一些成键信息?

这种情况很少,多原子体系的MO大部分都有较强离域性,不对应于任何一个键,做轨道定域化明显好得多
如果非要基于MO讨论,用Multiwfn可以计算每个MO对指定原子间成键的贡献(重叠布居,也叫Mulliken键级),结合图形考察,这样有一定帮助,也可以同时做OPDOS图考察。
作者
Author:
DUNING    时间: 2017-10-12 18:17
sobereva 发表于 2017-10-12 17:49
这种情况很少,多原子体系的MO大部分都有较强离域性,不对应于任何一个键,做轨道定域化明显好得多
如果 ...

那老师如果我加的关键字是pop(nbo,full),最后画出来的轨道也还是看不出这些信息吗?
作者
Author:
sobereva    时间: 2017-10-12 22:54
DUNING 发表于 2017-10-12 18:17
那老师如果我加的关键字是pop(nbo,full),最后画出来的轨道也还是看不出这些信息吗?


你这得到的chk里记录的就是正则分子轨道,之后用Multiwfn、gview直接看到的也是正则分子轨道。




欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3