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标题: amber中分析两个组分之间interaction的问题 [打印本页]

作者
Author: lujun 时间: 2017-10-17 15:35
标题: amber中分析两个组分之间interaction的问题
各位大神，
有谁知道amber中分析两个片段之间的interaction的energy，比如A和B的vdw和静电相互作用，随着时间的演化。
谢谢大家！

作者
Author: lijiayisjtu 时间: 2018-9-5 09:05
感觉就是看文献如何分析pro 和ligand 之间的interaction 才是比较好的

作者
Author: sobereva 时间: 2018-9-5 09:08
如果是不同分子，可以用mmpbsa

如果改用gromacs，直接定义能量组皆可，非常方便

作者
Author: lonemen 时间: 2018-9-9 16:52
请问sob老师，不同分子无法使用mmpbsa吗？

作者
Author: sobereva 时间: 2018-9-10 04:18

lonemen 发表于 2018-9-9 16:52
请问sob老师，不同分子无法使用mmpbsa吗？

可以用啊

作者
Author: lonemen 时间: 2018-9-11 09:41

sobereva 发表于 2018-9-10 04:18
可以用啊

好的，谢谢sob老师解答！

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