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标题: MOPAC2012要密码,如何获取? [打印本页]

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lao7    时间: 2015-1-28 10:56
标题: MOPAC2012要密码,如何获取?
linux版本的MOPAC2012要密码,如何获取呢?官网找不到索取密码的链接了,先前要了没有给。

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sobereva    时间: 2015-1-28 11:11
密码可以用这个:1591535a16518252

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lao7    时间: 2015-1-28 11:33
谢谢 刚才翻看到你的先前的帖子,我安装了一下,还没有安装上。再试试!谢谢
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lao7    时间: 2015-1-28 11:49
按照您提供的先前的方法安装了,但到了MOPAC2012 [license]这一步运行的时候,总出现  /home/mopac/MOPAC2012.exe: permission denied报错,mopac已经给了chmod 777的权限了。不知道哪些除了问题?
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lao7    时间: 2015-1-28 11:49
sobereva 发表于 2015-1-28 11:11
密码可以用这个:1591535a16518252

按照您提供的先前的方法安装了,但到了MOPAC2012 [license]这一步运行的时候,总出现  /home/mopac/MOPAC2012.exe: permission denied报错,mopac已经给了chmod 777的权限了。不知道哪些除了问题?
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sobereva    时间: 2015-1-28 11:58
你用ls -l查看一下,到底是否是777了。
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lao7    时间: 2015-1-28 12:15
应该是777,见图片。倒数第二行,是安装所在文件夹。我用的centos 6.5
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lao7    时间: 2015-1-28 12:16
sobereva 发表于 2015-1-28 11:58
你用ls -l查看一下,到底是否是777了。

会了 帮我看看什么问题,谢谢。是否linux不认exe文件?
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sobereva    时间: 2015-1-28 12:50
明显没有可执行权限,MOPAC2012.exe权限是rw-rw-r,没x。
应当用chmod +x MOPAC2012.exe给它增加可执行权限
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lao7    时间: 2015-1-28 13:01
本帖最后由 lao7 于 2015-1-28 13:26 编辑

按照Chmod -x不报权限的错误了,不过还要经过实践检验,再请教,谢谢

license已经安装上了,再次请教一下:mopac2012多核并行是默认的吗?谢谢!能否给我一个你做过的链接,让我看看如何做输入文件?谢谢


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lao7    时间: 2015-1-28 13:46
sobereva 发表于 2015-1-28 12:50
明显没有可执行权限,MOPAC2012.exe权限是rw-rw-r,没x。
应当用chmod +x MOPAC2012.exe给它增加可执行权 ...

Sob,请教一个问题:
你以前的贴在“大体系弱相互作用解决之道”,牵涉大MOPAC2012的使用,下面的例子:
。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。
PM7 CHARGE=-10 MOZYME
molecule
All coordinates are Cartesian
O       4.71271832 0   9.26971072 0  -7.55066164 0
C       4.13662696 0   9.48826045 0  -8.82968461 0
C       2.75025629 0   8.84701245 0  -8.99475234 0
...(剩余的坐标)
。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。
请问:
1)这里面, CHARGE=-10,如何知道一个体系带的电荷呢?比如用Gview输出一个笛卡尔坐标,哪一行是体系电荷?
2)如果优化结构,是不是要加Opt关键词?(要挨个写1?几百个原子)
3)生成什么样的文件,能用你的波函数分析软件打开?进行reduced density gradient分析(弱力的等作用面)?谢谢。
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sobereva    时间: 2015-1-28 14:12
1 根据化学知识和实际情况判断带多少电荷。笛卡尔坐标和电荷无关。
2 用ultraedit的列编辑模式很简单就能插入一列1。如果只写坐标不写0或1,也默认是优化所有原子。
3 Multiwfn不支持mopac产生的波函数。Multiwfn可以在promolecular近似下做RDG分析,只需要提供原子坐标就够了,此帖有说明
使用Multiwfn图形化研究弱相互作用
http://sobereva.com/68




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