计算化学公社

标题: 求问以过渡态做irc正常结束，但用Gaussview等可视化软件都打不开irc的log文件。 [打印本页]

作者
Author: chenzhiyong 时间: 2017-10-24 17:16
标题: 求问以过渡态做irc正常结束，但用Gaussview等可视化软件都打不开irc的log文件。
　

作者
Author: sobereva 时间: 2017-10-24 17:24
上传压缩后的输出文件。
如果gview太老而Gaussian较新，打不开也是正常的。

作者
Author: chenzhiyong 时间: 2017-10-24 19:10
@sobereva 这是输出的log文件，请帮忙看看，谢谢咯！

作者
Author: chenzhiyong 时间: 2017-10-24 19:21

sobereva 发表于 2017-10-24 17:24
上传压缩后的输出文件。
如果gview太老而Gaussian较新，打不开也是正常的。

附件是输出的log文件，请帮忙看看是什么问题，谢谢咯！

作者
Author: xujian 时间: 2017-10-24 19:36

chenzhiyong 发表于 2017-10-24 19:21
附件是输出的log文件，请帮忙看看是什么问题，谢谢咯！

用GV6.0打开后就是下图这样的，只有一个点，跑IRC关键词为何如此复杂，用你的算法和基组，感觉这样就够了#p m06l/def2SVP irc(forward,cal
cfc,stepsize=15)
(, 下载次数 Times of downloads: 23)

作者
Author: chenzhiyong 时间: 2017-10-24 20:04

xujian 发表于 2017-10-24 19:36
用GV6.0打开后就是下图这样的，只有一个点，跑IRC关键词为何如此复杂，用你的算法和基组，感觉这样就够 ...

GV6.0打开也是报错的，只是能看到结构比其他可视化软件厉害一点，但是也没有irc路径。从输出的log文件中可以明确看到是跑了10个点的，和正常能打开的irc是一样的。至于多的那些关键字只是习惯了每个输入文件都加，只是多输出一些结果，对计算没有印象。我现在就是想弄清楚为甚么看不到irc路径，到底是哪里出错了。

作者
Author: chenzhiyong 时间: 2017-10-24 22:13

xujian 发表于 2017-10-24 19:36
用GV6.0打开后就是下图这样的，只有一个点，跑IRC关键词为何如此复杂，用你的算法和基组，感觉这样就够 ...

非常感谢，我前都是喜欢通过读取过渡态的chk文件结构和波函数来进行irc计算，刚刚把过渡态结构取出来跑了irc，结构能打开了，是你给了我灵感，非常感谢。虽然我还是不知道为什么这几个irc的log文件GV打不开（都是，但是问题也算解决了。

作者
Author: sobereva 时间: 2017-10-25 12:28
8成是因为用了geom=check
写GFINPUT毫无用处，写IOP(6/7=3) 完全添乱，导致输出文件极度庞大

作者
Author: chenzhiyong 时间: 2017-10-25 14:14

sobereva 发表于 2017-10-25 12:28
8成是因为用了geom=check
写GFINPUT毫无用处，写IOP(6/7=3) 完全添乱，导致输出文件极度庞大

嗯嗯，谢谢sob老师，我想应该也是这样

作者
Author: amwfhv 时间: 2017-12-27 14:21

sobereva 发表于 2017-10-25 12:28
8成是因为用了geom=check
写GFINPUT毫无用处，写IOP(6/7=3) 完全添乱，导致输出文件极度庞大

卢老师，请问不使用geom=check还可以使用rcfc吗？是不是直接拷贝过渡态的原子坐标计算就可以解决这个打不开log文件的问题啊？

作者
Author: sobereva 时间: 2017-12-27 19:16

amwfhv 发表于 2017-12-27 14:21
卢老师，请问不使用geom=check还可以使用rcfc吗？是不是直接拷贝过渡态的原子坐标计算就可以解决这个打不 ...

可以，读取结构和读取力常数矩阵是两码事

只是自行修改输出文件还达不到目的，很难正好满足gview对格式的要求

作者
Author: amwfhv 时间: 2017-12-27 20:15

sobereva 发表于 2017-12-27 19:16
可以，读取结构和读取力常数矩阵是两码事

只是自行修改输出文件还达不到目的，很难正好满足gview对 ...

卢老师，晚上好，另外是否只加guess=read就可以结合rcfc使用了啊？

作者
Author: sobereva 时间: 2017-12-27 20:23

amwfhv 发表于 2017-12-27 20:15
卢老师，晚上好，另外是否只加guess=read就可以结合rcfc使用了啊？

这都不是一码事

读取初猜波函数
读取初猜结构
读取初始Hessian

这三条是彼此独立的，都用也行，都不用也行，只用任何一个或两个也行

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