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标题: 请问老师这个结构有弱相互作用吗 [打印本页]

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长颈鹿先森    时间: 2017-11-5 14:50
标题: 请问老师这个结构有弱相互作用吗
1. (CF3)2CF-CN,这个分子在电场作用下与H2O或者O2反应,可能会产生:CF3OH、CF3CFHCN、CH2FCN、HOCN、NC-CN、CF3CN、HF等,会涉及到弱相互作用(色散、碳键、卤键)吗?我看了关于卤键和碳键的文章,有些看不懂;2. 并且看到sob老师以前说过的,用M062x计算涉及弱相互作用的有机反应比较好,但是如果不涉及弱相互作用的话,用B3LYP要比mo62x准确些,并且省时间,我为了与单点能计算保持泛函同一性,所以用的是m62x,以前没有考虑是否有弱相互作用,现在想起这个问题,不知道怎么办了,请各位给解惑下,感谢了


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liyuanhe211    时间: 2017-11-5 20:58
哈?没有弱相互作用B3LYP有机反应单点比M06-2X好?
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长颈鹿先森    时间: 2017-11-5 22:26
1.抱歉我表达的不清楚,说的是几何优化,我记得sob老师说过普通有机分子不牵扯弱相互作用时,B3LYP优化算频率就可以了,除非涉及弱相互作用,否则m062x优化结构结果并不比b3lyp好。
2.我看不太懂弱相互作用,但是我计算(CF3)2CF-CN以及与水的反应产物时的单点能计算用的是m062x,优化也用的m062x,今天看到sob老师说的,突然想起优化结构时我没有考虑是否涉及弱相互作用,那么我这个是是否涉及呢?
3.我用m062x优化是怕别人问为什么单点能与优化既然都用DFT了,为什么不统一;所以想问如果我这个涉及弱相互作用,用m062x应该也没问题吧
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airyang    时间: 2017-11-5 23:35
长颈鹿先森 发表于 2017-11-5 22:26
1.抱歉我表达的不清楚,说的是几何优化,我记得sob老师说过普通有机分子不牵扯弱相互作用时,B3LYP优化算 ...

1.优化结构M06-2X不会比B3LYP差,如果是算热力学数据,只要结合了适当的频率校正因子,这两个泛函算出的Thermal correction to XXX区别也不大。至于推荐了B3LYP很大程度是因为M06-2X需要ultrafine的积分格点,B3LYP有耗时优势。

2.我自己的经验,M06-2X优化加不加D3对势能面影响十分有限,优化出来的结构区别不大。只要最后单点能用了合适的方法就行。

3.优化与单点能的方法不需要统一。难道单点CCSD(T)算的优化也要CCSD(T)么?M06-2X就可以。
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sobereva    时间: 2017-11-6 00:03
我从来不记得我说过“但是如果不涉及弱相互作用的话,用B3LYP要比mo62x准确些”。即便是不涉及弱相互作用的有机体系,优化结构时M06-2X精度也比B3LYP略高一丝,JCTC上之前有测试表明过这点。如果单点用M06-2X,那么优化也用M06-2X省得招致审稿人吐槽。




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