计算化学公社

标题: 过渡态的能垒异常 [打印本页]

作者
Author:
kyuan    时间: 2015-1-29 21:13
标题: 过渡态的能垒异常
本帖最后由 kyuan 于 2015-1-29 21:20 编辑

过渡态能垒异常的具体情况是:反应分为两步,第一步的过渡态(ts1)和产物(也就是中间体)的能垒相差只有0.05kcal/mol,从活化能的大小(27kcal/mol)来看,中间体不是很稳定;而第二步的过渡态(ts2)和中间体的能垒也基本不变,只有0.2kcal/mol的差距,而且过渡态的能垒比中间体的低(我用的方法是b3lyp/6-31+g(d) )。我想请教的是,1.为什么会出现这种情况? 2.如果存在这样的情况,那么这算不算是无能垒反应?另外,我要怎么在文章中解释这种现象呢?谢谢!

作者
Author:
sobereva    时间: 2015-1-30 00:35
你的情况是
反应物-TS1-中间体-TS2-产物,
并且TS1和中间体能量相差0.05kcal/mol,中间体和TS2能量也只有0.2kcal/mol?

如果是上面的情况,最好再用其它泛函验证验证,比如用M062x/6-311G**。DFT的计算精度实际上根本达不到能合理预测那么小的能量差异。而且若是上面的情况,中间体是否确实存在都有点可疑,没准儿只是当前计算方法下出现的artifical的中间体。

“过渡态的能垒比中间体的低”这句话有问题,能垒和某个结构的能量没法比。
作者
Author:
kyuan    时间: 2015-1-30 10:35
sobereva 发表于 2015-1-30 00:35
你的情况是
反应物-TS1-中间体-TS2-产物,
并且TS1和中间体能量相差0.05kcal/mol,中间体和TS2能量也只有 ...

非常感谢sob老师的指导,我再验证一下试试。
作者
Author:
jackieiii    时间: 2018-6-17 09:18
sobereva 发表于 2015-1-30 00:35
你的情况是
反应物-TS1-中间体-TS2-产物,
并且TS1和中间体能量相差0.05kcal/mol,中间体和TS2能量也只有 ...

卢老师,你好,我也遇到了这个问题,一开始用的是b3lyp/6-311++G(2d,2p),TS-IM=0.5kcal/mol,看到你说的,我又用了m062x/6-311++G(2d,2p)去计算单点能,TS-IM=0.07kcal/mol。想请教一下你说的这个artifical的中间体,我已经优化了中间体,而且irc跑向是对的,这也有可能不存在中间体吗?
另外还有一个信息,如果我加上ZPE,那我过渡态TS的能量比中间体IM的低,这应该怎么解释呢?
作者
Author:
Accelerator    时间: 2018-6-17 11:57
这么小的能量变化
确定不是把Hartree当成kcal/mol了吗
作者
Author:
sobereva    时间: 2018-6-17 12:52
jackieiii 发表于 2018-6-17 09:18
卢老师,你好,我也遇到了这个问题,一开始用的是b3lyp/6-311++G(2d,2p),TS-IM=0.5kcal/mol,看到你说的 ...


普通泛函计算精度根本达不到1kcal/mol,用双杂化计算进行验证到底是否存在过渡态

过渡态有一个虚频,对ZPE贡献为零,因此此时ZPE小于极小点,对于电子能垒很低的情况很容易导致当前情况,很正常。论坛里以前也讨论过多次
作者
Author:
Pobb    时间: 2024-10-27 10:09
你好,你的问题解决了吗




欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3