计算化学公社

标题: 配GPU就不需要CPU配置很好了吗? [打印本页]

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linda091021    时间: 2017-11-23 18:13
标题: 配GPU就不需要CPU配置很好了吗?
如题,跑gromacs分子动力学模拟,配1080TI,CPU有必要配22核心吗,还是10核心就够了。机器的性能与cpu性能有多大关系?

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ChaosChiao    时间: 2017-11-24 10:35
我觉得没太大关系,CPU主频比核心数更重要。

作者
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hanshan    时间: 2017-11-24 13:40
主频乘以核心数最重要
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linda091021    时间: 2017-11-24 13:41
hanshan 发表于 2017-11-24 13:40
主频乘以核心数最重要

我现在按照相乘大于40,要求供货的,但是根据之前的测试,cpu性能好到一定程度,GPU加速不明显了,我在想还有必要配gpu吗。


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sobereva    时间: 2017-11-25 12:25
就一个1080Ti,单路2696v3/v4足矣
GPU加速跑MD远比用CPU性价比高得多

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sobereva    时间: 2017-11-25 12:28
ChaosChiao 发表于 2017-11-24 10:35
我觉得没太大关系,CPU主频比核心数更重要。


在“主频乘以核心数”大致相同的情况下,主频才更重要。
高频CPU溢价极高,用高频但核心数少的CPU会吃亏巨大。

作者
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linda091021    时间: 2017-11-25 22:26
sobereva 发表于 2017-11-25 12:25
就一个1080Ti,单路2696v3/v4足矣
GPU加速跑MD远比用CPU性价比高得多

好的,所以可以2个1080ti配两路2696?
作者
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linda091021    时间: 2017-11-25 22:27
sobereva 发表于 2017-11-25 12:28
在“主频乘以核心数”大致相同的情况下,主频才更重要。
高频CPU溢价极高,用高频但核心数少的CPU会吃 ...

学习了~
谢谢sob大大!
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sobereva    时间: 2017-11-26 11:37
linda091021 发表于 2017-11-25 22:26
好的,所以可以2个1080ti配两路2696?

可以
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beyond    时间: 2017-11-26 20:28
如果是用Gromacs跑MD的话,cpu还是有影响的,因为MD过程中,有一部分还是用cpu计算的(nonbonded interactions),我每次用1个GPU,都要再用6-12个cpu同时计算。听说他们也在计划把cpu计算的这部分挪到GPU上去。而amber就是全部用GPU计算的。
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linda091021    时间: 2017-11-28 11:37
beyond 发表于 2017-11-26 20:28
如果是用Gromacs跑MD的话,cpu还是有影响的,因为MD过程中,有一部分还是用cpu计算的(nonbonded interacti ...

我一直都有这个疑问,太感谢了!解决了长久以来的困惑!
作者
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plus    时间: 2017-12-6 10:22
amber 的测试,和cpu关系不大
Exxact AMBER Certified 2U GPU Workstation
CPU = Dual x 8 Core Intel E5-2640v4 (2.2GHz), 64 GB DDR4 Ram
(note the cheaper E5-2620v4 CPUs would also give the same performance for GPU runs)

http://ambermd.org/gpus/benchmarks.htm





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