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标题: 大体系SCF计算过程非常慢 [打印本页]

作者
Author: happyrabbit 时间: 2015-2-2 10:12
标题: 大体系SCF计算过程非常慢
最近计算含有弱相互作用的两个大体系在不同温度下的相对稳定性，体系有216个原子，只是CHO元素。开始时用G09算，用M062X/6-31+G*方法，基组总共有3016个基函数，用8核10GB内存算得非常慢，基本不动，所以该用ORCA计算，计算方法是BLYP D3 GCP(DFT/SVP) def2-SVP def2-SVP/J RIJCOSX，用8核计算，每个核指定4500MB，开始时很快，但是到SCF过程就非常慢，几十个小时过去了都没有任何变化，运算过程中查看了内存使用，发现每核内存只用了0.1%（一个节点是64GB）。ORCA是最新版本V3_0_3。现在有这几个问题想请教一下大家帮我看看这个什么原因造成的：
1、这个是计算体系引起的吗？我用orca计算几十个原子的体系计算的是很快的，但是超过一百五十个原子的体系（含多个过渡金属元素）就发现单点计算都很慢。
2、是环境变量没有设好吗？是在超算中心在自己的计算目录下安装orca，
# ORCA setting
export MPI_HOME=/usr/mpi/gcc/openmpi-1.6.5
export PATH=$PATH:$MPI_HOME/bin
export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:$MPI_HOME/lib

export orca=/share/home/hm/ORCA
export PATH=$ORCA:$PATH
3、是脚本文件的问题吗？
#BSUB -q medium
#BSUB -o %J.out
#BSUB -e %J.err
#BSUB -n 8

WORKDIR=/share/home/hm/thermo
cd $WORKDIR

/share/home/hm/ORCA/orca /share/home/hm/thermo/hl.inp > hl.out

请大拿帮忙分析一下原因，非常感谢！！！

作者
Author: chrinide 时间: 2015-2-2 12:32
BLYP D3 GCP(DFT/SVP) def2-SVP def2-SVP/J RIJCOSX

纯泛函计算为啥加 RIJCOSX? 去掉之应该可以正常计算了

RIJCOSX是用半数值的方法计算HF的如果使用杂化泛函的话就加上纯泛函不用加自动进行RI计算

作者
Author: lao7 时间: 2015-2-2 13:24
1)去掉RIJCOSX
2）如果计算机是8核10Gb, 建议用4-5个核心，每个核心分配1G内存即可。如果是8核心CPU，每个核心分1G内存，运行起来这么大体系估计至少要40G内存才能运行流畅。

作者
Author: happyrabbit 时间: 2015-2-2 14:45
谢谢chrinide和lao7，我按照你们的建议再试一下

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