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标题: gaussian 09新手遇到两个问题，恳请各位帮忙谢谢大家 [打印本页]

作者
Author: 小西瓜123 时间: 2017-11-30 10:44
标题: gaussian 09新手遇到两个问题，恳请各位帮忙谢谢大家
都是使用的两步计算法第一问题报401错误，401错误有什么关键词可以解决吗
输入文件
%chk=2
%nproc=4
%mem=8GB
# hf/3-21g SCRF=(solvent=Dichloromethane) opt=cartesian

3

0 1
C                -2.35019700 -3.99392100 1.56473200
C                -4.18104000 -1.80481800 1.54811200

.
.
.
C                -0.78821970 5.48924843 -2.92704357
H                -0.46891007 5.39519799 -1.89407474
Cl             -0.41122606 3.95624811 -3.76044193
Cl             -2.55337135 5.80952507 -2.90912143
Cl                0.11477934 6.86676043 -3.63739960

--link1--
%chk=3
%nproc=4
%mem=8GB
%nosave
# b3lyp/6-31g* EmpiricalDispersion=GD3 geom=check guess=read SCRF=(solvent=Dichloromethane) opt=cartesian

3

0 1

然后输出文件报错
Model             : PCM (using non-symmetric T matrix).
Atomic radii       : UFF (Universal Force Field).
Polarization charges : Total charges.
Charge compensation  : None.
Solution method    : On-the-fly selection.
Cavity type       : Scaled VdW (van der Waals Surface) (Alpha=1.100).
Cavity algorithm    : GePol (No added spheres)
                     Default sphere list used, NSphG= 64.
                     Lebedev-Laikov grids with approx.  5.0 points / Ang**2.
                     Smoothing algorithm: York/Karplus (Gamma=1.0000).
                     Polarization charges: spherical gaussians, with
                                          point-specific exponents (IZeta= 3).
                     Self-potential: point-specific (ISelfS= 7).
                     Self-field : sphere-specific E.n sum rule (ISelfD= 2).
1st derivatives    : Analytical E(r).r(x)/FMM algorithm (CHGder, D1EAlg=3).
                     Cavity 1st derivative terms included.
Solvent             : Dichloromethane, Eps= 8.930000 Eps(inf)= 2.028346
------------------------------------------------------------------------------
One-electron integrals computed using PRISM.
NBasis= 516 RedAO= T EigKep=  1.06D-03  NBF= 516
NBsUse= 516 1.00D-06 EigRej= -1.00D+00 NBFU= 516
Initial guess from the checkpoint file:  "2.chk"
NInts<0 in InToWP.
Error termination via Lnk1e in /share/apps/gaussian/g09E01/g09/l401.exe at Wed Nov 29 11:38:24 2017.
Job cpu time:    0 days  1 hours 23 minutes 14.3 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF= 1442 Int=    0 D2E=    0 Chk=    45 Scr=    1

然后第二个问题为，输入文件和第一个相似，计算的分子不一样，但是报的错为 One-electron integrals computed using PRISM.
NBasis= 472 RedAO= T EigKep=  1.07D-03  NBF= 472
NBsUse= 472 1.00D-06 EigRej= -1.00D+00 NBFU= 472
Lowest energy guess from the checkpoint file:  "2.chk"
extended by 1073737728 -1
File extend in NtrEx1 failed.
You are probably out of disk space.
File extend in NtrEx1 failed; probably out of disk space.

恳请各位大神帮忙，谢谢大家

作者
Author: Mikasa 时间: 2017-11-30 11:14
看Gaussian FAQ
http://bbs.keinsci.com/forum.php ... ;highlight=gaussian

作者
Author: 小西瓜123 时间: 2017-11-30 11:22

Mikasa 发表于 2017-11-30 11:14
看Gaussian FAQ
http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=4829&highlight=gaussian

我看过了，没有提到这两个问题的解决方案呀

作者
Author: 冰释之川 时间: 2017-11-30 11:23
（1）使用geom=check guess=read 这些关键词要注意%chk后面的文件名是否存在于当前目录（对于当前例子，你应该改成%chk=2，因为第一步计算算出来的chk文件名是2.chk，并非是3.chk）

（2）磁盘空间已耗尽。

作者
Author: 小西瓜123 时间: 2017-11-30 11:37

冰释之川发表于 2017-11-30 11:23
（1）使用geom=check guess=read 这些关键词要注意%chk后面的文件名是否存在于当前目录（对于当前例子，你 ...

谢谢你，第一个问题我粗心了，那请问第二个问题，磁盘空间耗尽，这是我们集群的问题吗？我只有等着磁盘空的多的时候再提交吗

作者
Author: sobereva 时间: 2017-11-30 14:26

小西瓜123 发表于 2017-11-30 11:37
谢谢你，第一个问题我粗心了，那请问第二个问题，磁盘空间耗尽，这是我们集群的问题吗？我只有等着磁盘空 ...

删除硬盘里垃圾文件腾空间
空余硬盘空间不会自动冒出来

作者
Author: 小西瓜123 时间: 2017-11-30 15:36

sobereva 发表于 2017-11-30 14:26
删除硬盘里垃圾文件腾空间
空余硬盘空间不会自动冒出来

好的，谢谢啦

作者
Author: 小西瓜123 时间: 2017-11-30 15:41

小西瓜123 发表于 2017-11-30 15:36
好的，谢谢啦

会不会是我给的内存不够呀

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