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标题: gaussian中非l502,l703等模块运行速度特慢,求助解决(已经解决) [打印本页]

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tjchkj    时间: 2017-12-1 02:21
标题: gaussian中非l502,l703等模块运行速度特慢,求助解决(已经解决)
本帖最后由 tjchkj 于 2017-12-1 21:00 编辑

最近遇到一个问题。求大师们指点。版本:gaussian 16 A.03 win64 .
在win7平台下,我用I5 和I7的电脑运行计算,除了l502,l703,l401等这几个模块你还能看到是在做什么,其他各个模块基本上是秒过。

但是在windows 10平台下,双路e5-2696v4.工作站上,完全一样的输入文件,运行后,除了上述几个模块以外,其他的模块都运行很慢才开始下一个,比如我记录下一个过程,
l1,101,l103,l202,l301,l302,l303,l401,l502,l601,l701,l702,l703,l716,l103,l202......等这样后续循环过程。
在I5 和I7这样普通的机器上,这些非502,703等模块,几乎你都看不见一闪就完成了,但这个多路机器上,多数都要运行10多秒甚至一分钟。这是为什么?l502模块支持多核心处理,l703也是可以支持多核心运算。但其他模块似乎就只会用到一个核心。但在那些台式机上,这些模块运行的飞快,几乎都是秒过就完成到下一步这些耗时的模块上了,甚至你连看他是在执行什么模块 都没看清就结束了。说明这些模块处理的非常快。不知道为啥在更强的工作站上就费劲了。
      请有类似相近的双路工作站的且装了windows平台gaussian 16 的老师们,看看是否遇到过同样的问题,问题可能出在什么方面?怎么能解决呢?前提是不要换linux,我也没有linux版的gaussian,也不会linux。恭候各位指点迷津!!!



该问题已经自行研究解决了。谢谢诸位关注!

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tjchkj    时间: 2017-12-1 10:29
而且用asda测试稳定性的时候,温度时间图卡住没法看变化,说明系统有问题。换成win7试试了。
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sobereva    时间: 2017-12-1 12:37
你设的几核并行?有没有和其它i5/i7机子对简单体系对比过windows版运行总耗时?(并行核数相同情况下)
Gaussian Windows版在把输出文件里的信息输出到GUI界面的时候往往有明显延迟,可能你看似很慢,但实际耗时并没问题。

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tjchkj    时间: 2017-12-1 15:23
本帖最后由 tjchkj 于 2017-12-1 15:32 编辑
sobereva 发表于 2017-12-1 12:37
你设的几核并行?有没有和其它i5/i7机子对简单体系对比过windows版运行总耗时?(并行核数相同情况下)
Ga ...

都是单开gaussian16,都是使用4核心,%CPU=0,1,2,3 内存使用的默认。2696v4花了16分21秒,job cpu time 26分52秒。I5 4440 台式机,13分55.6秒,job cpu time 13分57秒。前面那个时间是elapsed time 。可以看出,因为I5机器上,几乎都是看到l502在费时间,其他的都是一闪就算完,基本上10秒就进入502.所以最后的时间里,elapsed time 和job cpu time相差很小。但是在2696v4机器上,整个每个模块都看得到,而且现在内容窗口底部能看到每个模块是干什么的,是在做什么。时间少的也有几秒,多的会几十秒以上到几分钟。进入502模块要好几分钟后才进入。同时看到任务管理器里,只有一个逻辑处理器在100%状态。而用I5或者I7的台式机,这些除去502和703,401等模块,其他的模块都是秒过,你几乎难以看见哪个模块在干什么,就是换到502,703或者401(mo)了。
另外因为I5 4440主频比2696v4高,CPU主频:3.1GHz  ,最大睿频:3.3GHz   ,所以如果用同样的cpu去算一个东西,肯定是I5的快,这样看I5比2696v4快相差2分多钟是正常的。在2696v4上我使用shared=40来计算,结果是 job cpu time 15分,elapsed time 是4分37秒。所以主要是这些非l502模块在2696v4这里耽误了时间,我会在另外一个帖子里分析一下所谓的并行效率问题。目前这个非l502模块处理慢肯定是不正常的了。我必须先去处理下,否则机器就废了。
  关于你说的windows gaussian处理输出的结果到GUI界面的那个延迟,因为在同样平台里的I5 I7机器里都不会有延迟,所以这里也不会有,因为我在这些I5I7机器上都计算了不下几千次了,买这个机器是针对10万个计算量级才要用的。因为任务体系都不大,所以一个任务在I5机器跑3小时吧,所以已经做了很多,只有在2696v4这个机器上,才突然发现,以前在台式机上根本看不到的模块居然这么缓慢,以前那些模块都是秒过,没来得及看清就过去了。

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lanthanum    时间: 2022-6-28 15:48
tjchkj 发表于 2017-12-1 15:23
都是单开gaussian16,都是使用4核心,%CPU=0,1,2,3 内存使用的默认。2696v4花了16分21秒,job cpu tim ...

确实有这个现象,请问楼主怎么解决的?




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