计算化学公社

标题: 如何将27号甲基优化到20号N的附近 [打印本页]

作者
Author: 胡姐姐 时间: 2017-12-5 09:13
标题: 如何将27号甲基优化到20号N的附近
%nprocshared=16
%mem=11900MB
%chk=dan2.chk
#p #p opt=calcall b3lyp/6-31g(d)
优化时用的笛卡尔坐标。
请问我该如何让27号甲基优化到20号N的附近~是我的初始构型有问题吗？还是什么原因？

作者
Author: sobereva 时间: 2017-12-5 17:09
如果你认为存在C-H...N弱氢键作用，导致甲基能粘在N20附近，一方面初始结构需恰当摆放，另一方面要用恰当的计算级别，必须能合理描述弱相互作用，B3LYP众所周知做不到，仔细阅读此文
乱谈DFT-D
http://sobereva.com/83
最起码加上DFT-D3校正。基组也最好改为6-31+G**。

作者
Author: 望月凝香 时间: 2017-12-6 06:08
楼上sob老师+1
顺便你者结构，怎么看都是二甲胺和二酰胺的氢成N-H...N氢键的倾向大于C-H...N弱氢键来着。

作者
Author: 胡姐姐 时间: 2017-12-6 10:17

sobereva 发表于 2017-12-5 17:09
如果你认为存在C-H...N弱氢键作用，导致甲基能粘在N20附近，一方面初始结构需恰当摆放，另一方面要用恰当的 ...

蟹蟹老师，我会好好看看的

作者
Author: 胡姐姐 时间: 2017-12-6 10:26

望月凝香发表于 2017-12-6 06:08
楼上sob老师+1
顺便你者结构，怎么看都是二甲胺和二酰胺的氢成N-H...N氢键的倾向大于C-H...N弱氢键来着。

晕晕的，我再好好想想，蟹蟹

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)