计算化学公社

标题: 大分子sobMECP计算请教 [打印本页]

作者
Author: xyyan1207 时间: 2017-12-6 11:34
标题: 大分子sobMECP计算请教
老师好，
我想计算大分子（130左右个原子数）的MECP应该具体怎么实施呢？我有看到博文http://sobereva.com/286，尝试例子后发现程序适合在主节点上交作业，适合算较小的体系，我如果要算大的体系的话，应该用大核数，怎样更改程序中的设置，实现队列作业呢？

作者
Author: sobereva 时间: 2017-12-6 13:19
sobMECP本身用不着做什么修改，只是根据实际情况，在提交方式上做恰当考虑就够了

本身sobMECP对于体系大小没有任何限制。

作者
Author: xyyan1207 时间: 2017-12-6 15:21

sobereva 发表于 2017-12-6 13:19
sobMECP本身用不着做什么修改，只是根据实际情况，在提交方式上做恰当考虑就够了

本身sobMECP对于体系大 ...

嗯，是的，这就是我想表达的问题，可是不知道怎么实现这种提交方式？sob大人可不可以举个例子呢

作者
Author: sobereva 时间: 2017-12-6 17:43

xyyan1207 发表于 2017-12-6 15:21
嗯，是的，这就是我想表达的问题，可是不知道怎么实现这种提交方式？sob大人可不可以举个例子呢

我对提交相关的事不清楚，我跑计算的机子都是我自己的

作者
Author: wolfbing 时间: 2017-12-7 23:20
主节点一般是不提交计算任务的，有些系统设置会自动杀死在主节点运行超过几分钟的任务。我如果是你们机器的系统管理员，发现后就封你一个月不能用机器。

作者
Author: xyyan1207 时间: 2017-12-8 14:58

wolfbing 发表于 2017-12-7 23:20
主节点一般是不提交计算任务的，有些系统设置会自动杀死在主节点运行超过几分钟的任务。我如果是你们机器的 ...

是啊，只敢算特别小的分子，这种大分子的只能交队列作业，所以发愁怎样改sobMECP这种程序设置成队列作业

作者
Author: 三迩- 时间: 2019-8-18 01:14

xyyan1207 发表于 2017-12-8 14:58
是啊，只敢算特别小的分子，这种大分子的只能交队列作业，所以发愁怎样改sobMECP这种程序设置成队列作业

请问如何解决的？

作者
Author: 小范范1989 时间: 2019-8-18 09:38

三迩- 发表于 2019-8-18 01:14
请问如何解决的？

我觉得这个不难吧，你用你的脚本提交上去不就行了？知识运行fortran程序，
比如你把你提交高斯的脚本，改为相应sobmecp的执行的指令，就行吧，我就是这么干的

作者
Author: wang7344412 时间: 2019-8-26 15:34

小范范1989 发表于 2019-8-18 09:38
我觉得这个不难吧，你用你的脚本提交上去不就行了？知识运行fortran程序，
比如你把你提交高斯的脚本， ...

你好，能详细举例说明一下么？你是怎么改提交高斯的脚本的？我学习一下,谢谢了！

作者
Author: 三与三十万 时间: 2022-11-24 17:24

wang7344412 发表于 2019-8-26 15:34
你好，能详细举例说明一下么？你是怎么改提交高斯的脚本的？我学习一下,谢谢了！

你好，你的问题解决了吗

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)