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标题: A和B无过渡态形成复合物A-B,然后再经过过渡态形成物质C和D,请问反应速率怎么计算 [打印本页]

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长颈鹿先森    时间: 2017-12-7 22:32
标题: A和B无过渡态形成复合物A-B,然后再经过过渡态形成物质C和D,请问反应速率怎么计算
A和B无过渡态形成复合物A-B,然后再经过过渡态形成物质C和D,请问这个反应的总反应速率怎么计算?

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sobereva    时间: 2017-12-7 22:49
当成双分子反应考虑时,直接以G(TS)-G(A)-G(B)作为活化自由能垒代入TST
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长颈鹿先森    时间: 2017-12-8 17:01
谢谢sob老师
(1)那如果过渡态的能量TS比反应物A和B的总能量低的话,是不是就不能用您说的TST计算反应速率了;那该用什么办法呢
(2)还有个问题,我在优化复合物A-B时,用了两种方法,一是:直接在gaussview中画好复合物的结构,再优化;第二种是:在gaussview的同一文件中中将A和B分别画好,再优化;为什么优化出来的热力学数据不同,能量也不同
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长颈鹿先森    时间: 2017-12-10 14:15
有谁帮我解答一下问题吗?拜托
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sobereva    时间: 2017-12-10 18:39
长颈鹿先森 发表于 2017-12-8 17:01
谢谢sob老师
(1)那如果过渡态的能量TS比反应物A和B的总能量低的话,是不是就不能用您说的TST计算反应速 ...


1 如果A-B能形成稳定的复合物,作为的单分子反应考虑可以计算。
2 本来二聚体的可能构型就非常多,优化出的构型不同,显然能量也不同。复杂情况需要用molclus等程序做构型搜索
genmer:生成团簇初始构型的超便捷工具
http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=2369
使用molclus程序做团簇构型搜索和分子构象搜索
http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=577

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长颈鹿先森    时间: 2017-12-11 10:51
谢谢sob老师,如果A-B形成的复合物稳定的话,就可以用G(TS)-G(A-B复合物)代入到TST公式里面计算反应速率,作为整个反应的反应速率对吧
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sobereva    时间: 2017-12-11 14:35
长颈鹿先森 发表于 2017-12-11 10:51
谢谢sob老师,如果A-B形成的复合物稳定的话,就可以用G(TS)-G(A-B复合物)代入到TST公式里面计算反应速率, ...






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