计算化学公社

标题: 过渡金属配合物的抓氢键和核磁谱计算问题 [打印本页]

作者
Author: 望月凝香 时间: 2017-12-12 14:27
标题: 过渡金属配合物的抓氢键和核磁谱计算问题
目前手上有一个Ni(I)的配合物，希望对其进行计算模拟。有两个问题想问一下。一，这是一个有抓氢键(agostic interaction)的配合物。计算模拟中就要模拟agostic bond。请问一下这种情况下是不是应当对可能有agostic interaction的氢加额外的极化和/或弥散？
二，这是一个顺磁性的分子。在写输入文件的时候有需要或者可能定义Ni的核自旋和/或氧化态么？如果我想要模拟其核磁谱图是否困难？有何要点？以及对EPR的模拟高斯能比较顺利得做么？

作者
Author: sobereva 时间: 2017-12-12 20:12
1 氢的弥散不需要加，此时极化得加
2 没法定义。关于量化计算里氧化态的概念看此文
使用Multiwfn通过LOBA方法计算氧化态
http://sobereva.com/362
具体要点，看具体算什么元素的，比如计算配合物的配体原子的，看这些
谈谈如何又好又快地计算NMR化学位移
http://sobereva.com/354

作者
Author: 望月凝香 时间: 2017-12-13 02:03

sobereva 发表于 2017-12-12 20:12
1 氢的弥散不需要加，此时极化得加
2 没法定义。关于量化计算里氧化态的概念看此文
使用Multiwfn通过LOBA ...

谢谢sob老师。
主要是顺磁样品的核磁和普通的反磁性样品长得非常不一样，其中要考虑到额外的磁矩。我想知道的是在计算核心顺磁性过渡金属周围氢原子化学位移的时候是否可以/需要定义金属原子的电子态来模拟这个条件。对于Ni(I)这种d9排布的只有一个态，但是对于d4-d7排布的，还有高低自旋带来的不同……

作者
Author: sobereva 时间: 2017-12-13 02:47

望月凝香发表于 2017-12-13 02:03
谢谢sob老师。
主要是顺磁样品的核磁和普通的反磁性样品长得非常不一样，其中要考虑到额外的磁矩。我想 ...

量化里没法定义原子所处的价态/电子结构（除非用CDFT，非主流方法，见下），只能对整个体系来定义，这点在LOBA博文里详细讨论了。
谈谈约束性DFT (CDFT)
http://sobereva.com/271

作者
Author: 望月凝香 时间: 2017-12-13 04:12

sobereva 发表于 2017-12-13 02:47
量化里没法定义原子所处的价态/电子结构（除非用CDFT，非主流方法，见下），只能对整个体系来定义，这 ...

谢谢！

作者
Author: wangxiaofeng 时间: 2022-12-8 21:06

sobereva 发表于 2017-12-12 20:12
1 氢的弥散不需要加，此时极化得加
2 没法定义。关于量化计算里氧化态的概念看此文
使用Multiwfn通过LOBA ...

老师，您好！请问抓氢键的强弱可以通过什么指标来衡量？

作者
Author: sobereva 时间: 2022-12-9 05:23

wangxiaofeng 发表于 2022-12-8 21:06
老师，您好！请问抓氢键的强弱可以通过什么指标来衡量？

对于同类抓氢键的横向对比可以用Multiwfn做AIM拓扑分析、键级考察，看《Multiwfn支持的分析化学键的方法一览》（http://sobereva.com/471）。也可以考虑用柔性键力常数，看下文
通过柔性力常数考察键的强度
http://sobereva.com/364（http://bbs.keinsci.com/thread-5175-1-1.html）

作者
Author: wangxiaofeng 时间: 2022-12-9 20:40

sobereva 发表于 2022-12-9 05:23
对于同类抓氢键的横向对比可以用Multiwfn做AIM拓扑分析、键级考察，看《Multiwfn支持的分析化学键的方法 ...

好的，谢谢老师

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