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标题: 搭构型时分子之间的相互作用考虑问题 [打印本页]

作者
Author: 胡姐姐 时间: 2017-12-12 17:45
标题: 搭构型时分子之间的相互作用考虑问题
大家可以帮我分析一下他们的相互作用都有什么吗?我在想如何真确的搭建构型？大家有什么建议吗

作者
Author: sobereva 时间: 2017-12-12 19:41
氢键是必然有的。
不确定怎么摆合适就用genmer自动生成各种可能的二聚体初始构型、批量优化，来找最稳定的二聚体构型，仔细阅读
genmer：生成团簇初始构型的超便捷工具
http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=2369
使用molclus程序做团簇构型搜索和分子构象搜索
http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=577

找到最稳定构型后，用Multiwfn分析，就更具体了解弱相互作用特点了
Multiwfn支持的弱相互作用的分析方法概览
http://sobereva.com/252

作者
Author: 三石草祭 时间: 2017-12-12 21:10

sobereva 发表于 2017-12-12 19:41
氢键是必然有的。
不确定怎么摆合适就用genmer自动生成各种可能的二聚体初始构型、批量优化，来找最稳定的 ...

sob老师，我想咨询下关于二聚体光谱的计算问题，对于单个分子可以用高斯优化并得到它对应的吸收和发射光谱，对于二聚体该怎么处理呢，放在一起优化后的对应的光谱？这里面应该是考虑了分子间相互作用后的结果吧

作者
Author: sobereva 时间: 2017-12-12 21:51

三石草祭发表于 2017-12-12 21:10
sob老师，我想咨询下关于二聚体光谱的计算问题，对于单个分子可以用高斯优化并得到它对应的吸收和发射光 ...

是

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