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标题: 能量最小化时核心已转储问题 [打印本页]

作者
Author: zdwssg123 时间: 2017-12-20 15:04
标题: 能量最小化时核心已转储问题
我在一个10×10×40的盒子，里面有12万多个分子，然后在能量最小化的时候，电脑无法运行下去了，出现了Segmentation fault (core dumped)，该如何解决，求大神指导！感激不尽！

作者
Author: sobereva 时间: 2017-12-20 16:16
可能性很多，就跟电脑死机一样。
一般情况无外乎就是初始结构不好，或者参数不合理，或者mdp写得有致命缺陷。也有个别情况可能是程序编译有问题（但其它任务都跑得正常的话就不太可能是这个原因）。
一般解决思路就是反复检查，怎么检查都没问题，那就只能不断简化体系，诸如混合体系先跑个纯物质的情况看看。或者也可以用双精度gmx版本跑一下试试

作者
Author: 计算小菜鸡 时间: 2020-11-17 09:46
兄弟，你这个问题是怎么解决的？

作者
Author: wzkchem5 时间: 2020-11-17 13:21

计算小菜鸡发表于 2020-11-17 09:46
兄弟，你这个问题是怎么解决的？

Segmentation fault (core dumped)的触发条件多如牛毛，等价于windows下的“xxx程序已停止运行”对话框
所以他的解决方案对你奏效的概率很低。。。

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