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标题: 关于使用ADMP研究TNT的热解反应过程 [打印本页]

作者
Author: 杜黎小松 时间: 2018-1-5 11:17
标题: 关于使用ADMP研究TNT的热解反应过程
问题描述：研究TNT的热分解反应机理（如DSC分析为实验方法），通常认为TNT的热解是从苯环上的硝基断裂开始的，本人通过IRC验证了，因此想采用分子动力学的方法来研究其热解过程中分解结构的变化，查阅g09手册和其他分子动力学方法，ADMP方法貌似可以使用，而查阅资料后不是很明白ADMP的分析方法，可否给出势能面以及其他一些信息？本人此前没用采用过分子动力学方法，因此想借这个帖子想各位大神求助，可否给一篇比较好的使用ADMP方法研究反应过程的文献（网上文献忽高忽低，高的看不懂，低的看不明白，不清晰），是否需要些后处理方法？输出文件的读取和结果分析？再此本人非常真诚的向坛友请教,

！

作者
Author: sobereva 时间: 2018-1-6 07:02
话题偏大，google搜搜heat decomposition AIMD能找到很多此类文章

ADMP细节原理不用弄得太深，知道关键词怎么用就够了。MD就相当于由于热的驱动而令体系结构在势能面上不断地运动。

后处理没什么，用gview就可以看ADMP轨迹，而且还可以直接对轨迹中的几何变量随时间变化作图。
如果利用下面的程序，还可以把轨迹转成pdb，然后利用灵活强大的VMD做更多轨迹分析。
将Gaussian从头算动力学轨迹转换为pdb轨迹的程序GauMDconv
http://sobereva.com/126

作者
Author: 杜黎小松 时间: 2018-1-6 21:19

sobereva 发表于 2018-1-6 07:02
话题偏大，google搜搜heat decomposition AIMD能找到很多此类文章

ADMP细节原理不用弄得太深，知道关键 ...

谢谢sob老师，我去按照你的方法去搜搜精品文献！

作者
Author: zhang1992 时间: 2019-7-9 10:55

杜黎小松发表于 2018-1-6 21:19
谢谢sob老师，我去按照你的方法去搜搜精品文献！

您好，我想问一下，TNT的热解是直接给出了产物计算的吗？

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