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标题: 请问这样一个分子的激发态的优化和频率计算大概得几天啊 [打印本页]
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Author: bomsaude    时间: 2015-2-13 20:12
标题: 请问这样一个分子的激发态的优化和频率计算大概得几天啊
本帖最后由 bomsaude 于 2015-2-13 12:23 编辑

想试一个分子的激发态的优化和频率计算，双核CPU运算快两天了（大约5000分钟了），不知道何时能完？

分子是3个苯环连在一起的那个分子，但不是蒽，叫啥名字忘了，计算的的一些信息如下：

  1. -----------------------------------------------------------
  2. #p td b3lyp/6-31g(d) opt freq=saveNM scrf=(solvent=ethanol)
  3. -----------------------------------------------------------
  4. 1/14=-1,18=20,19=15,26=3,38=1/1,3;
  5. 2/9=110,12=2,17=6,18=5,40=1/2;
  6. 3/5=1,6=6,7=1,11=2,16=1,25=1,30=1,70=2201,71=1,72=4,74=-5/1,2,8,3;
  7. 4//1;
  8. 5/5=2,38=5,53=4/2;
  9. 8/6=1,10=2/1;
  10. 9/15=2,42=1/14;
  11. 10/5=4/2;
  12. 6/7=2,8=2,9=2,10=2/1;
  13. 7/12=6,13=5,92=1/1,2,3,16;
  14. 1/14=-1,18=20,19=15/3(2);
  15. 2/9=110/2;
  16. 99//99;
  17. 2/9=110/2;
  18. 3/5=1,6=6,7=1,11=2,16=1,25=1,30=1,70=2205,71=1,72=4,74=-5/1,2,8,3;
  19. 4/5=5,16=3/1;
  20. 5/5=2,38=5,53=4/2;
  21. 8/6=1,10=2/1;
  22. 9/15=2,42=1,49=4/14;
  23. 10/5=4/2;
  24. 7/12=6,13=5,92=1/1,2,3,16;
  25. 1/14=-1,18=20,19=15/3(-8);
  26. 2/9=110/2;
  27. 6/7=2,8=2,9=2,10=2/1;
  28. 99//99;
  29. Leave Link    1 at Wed Feb 11 18:30:55 2015, MaxMem=          0 cpu:       0.1
  30. ------------------
  31. excited state
  32. ------------------
  33. Symbolic Z-matrix:
  34. Charge =  0 Multiplicity = 1
  35. C                    -5.30517  -3.35493  -0.00395
  36. C                    -3.94824  -3.38606  -0.00518
  37. C                    -3.22148  -2.18978  -0.00375
  38. C                    -3.90238  -0.97132  -0.00106
  39. C                    -5.30167  -0.95781   0.00017
  40. C                    -5.98931  -2.12758  -0.00125
  41. C                    -1.81836  -2.21165  -0.005
  42. C                    -3.17801   0.22397   0.00037
  43. C                    -1.78277   0.18424  -0.0009
  44. C                    -1.11405  -1.04946  -0.00361
  45. C                    -1.05862   1.3821    0.00054
  46. H                     0.01117   1.36088  -0.00042
  47. C                    -1.71417   2.57058   0.00315
  48. C                    -3.11879   2.60906   0.00444
  49. C                    -3.83754   1.45815   0.00307
  50. H                    -1.30052  -3.14799  -0.00706
  51. H                    -5.85769  -4.27124  -0.00505
  52. H                    -3.43435  -4.32458  -0.00724
  53. H                    -5.82855  -0.02653   0.00223
  54. H                    -7.05924  -2.11532  -0.0003
  55. H                    -0.04436  -1.07521  -0.00457
  56. H                    -1.15758   3.48442   0.00425
  57. H                    -3.6248    3.55185   0.0065
  58. H                    -4.90693   1.49423   0.00406

  60. NAtoms=     24 NQM=     24 NQMF=      0 NMic=      0 NMicF=      0 NTot=     24.
  61.                     Isotopes and Nuclear Properties:
  62. (Nuclear quadrupole moments (NQMom) in fm**2, nuclear magnetic moments (NMagM)
  63.   in nuclear magnetons)

  65.   Atom         1           2           3           4           5           6           7           8           9          10
  66. IAtWgt=          12          12          12          12          12          12          12          12          12          12
  67. AtmWgt=  12.0000000  12.0000000  12.0000000  12.0000000  12.0000000  12.0000000  12.0000000  12.0000000  12.0000000  12.0000000
  68. NucSpn=           0           0           0           0           0           0           0           0           0           0
  69. AtZEff=   0.0000000   0.0000000   0.0000000   0.0000000   0.0000000   0.0000000   0.0000000   0.0000000   0.0000000   0.0000000
  70. NQMom=    0.0000000   0.0000000   0.0000000   0.0000000   0.0000000   0.0000000   0.0000000   0.0000000   0.0000000   0.0000000
  71. NMagM=    0.0000000   0.0000000   0.0000000   0.0000000   0.0000000   0.0000000   0.0000000   0.0000000   0.0000000   0.0000000

  73.   Atom        11          12          13          14          15          16          17          18          19          20
  74. IAtWgt=          12           1          12          12          12           1           1           1           1           1
  75. AtmWgt=  12.0000000   1.0078250  12.0000000  12.0000000  12.0000000   1.0078250   1.0078250   1.0078250   1.0078250   1.0078250
  76. NucSpn=           0           1           0           0           0           1           1           1           1           1
  77. AtZEff=   0.0000000   0.0000000   0.0000000   0.0000000   0.0000000   0.0000000   0.0000000   0.0000000   0.0000000   0.0000000
  78. NQMom=    0.0000000   0.0000000   0.0000000   0.0000000   0.0000000   0.0000000   0.0000000   0.0000000   0.0000000   0.0000000
  79. NMagM=    0.0000000   2.7928460   0.0000000   0.0000000   0.0000000   2.7928460   2.7928460   2.7928460   2.7928460   2.7928460

  81.   Atom        21          22          23          24
  82. IAtWgt=           1           1           1           1
  83. AtmWgt=   1.0078250   1.0078250   1.0078250   1.0078250
  84. NucSpn=           1           1           1           1
  85. AtZEff=   0.0000000   0.0000000   0.0000000   0.0000000
  86. NQMom=    0.0000000   0.0000000   0.0000000   0.0000000
  87. NMagM=    2.7928460   2.7928460   2.7928460   2.7928460
  88. Leave Link  101 at Wed Feb 11 18:30:55 2015, MaxMem=  655360000 cpu:       0.3


  91. GradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGrad
  92. Berny optimization.
  93. Initialization pass.
  94.                            ----------------------------
  95.                            !    Initial Parameters    !
  96.                            ! (Angstroms and Degrees)  !
  97. --------------------------                            --------------------------
  98. ! Name  Definition              Value          Derivative Info.                !
  99. --------------------------------------------------------------------------------
  100. ! R1    R(1,2)                  1.3573         estimate D2E/DX2                !
  101. ! R2    R(1,6)                  1.4051         estimate D2E/DX2                !
  102. ! R3    R(1,17)                 1.07           estimate D2E/DX2                !
  103. ! R4    R(2,3)                  1.3997         estimate D2E/DX2                !
  104. ! R5    R(2,18)                 1.07           estimate D2E/DX2                !
  105. ! R6    R(3,4)                  1.3958         estimate D2E/DX2                !
  106. ! R7    R(3,7)                  1.4033         estimate D2E/DX2                !
  107. ! R8    R(4,5)                  1.3994         estimate D2E/DX2                !
  108. ! R9    R(4,8)                  1.3977         estimate D2E/DX2                !
  109. ! R10   R(5,6)                  1.3569         estimate D2E/DX2                !
  110. ! R11   R(5,19)                 1.07           estimate D2E/DX2                !
  111. ! R12   R(6,20)                 1.07           estimate D2E/DX2                !
  112. ! R13   R(7,10)                 1.3589         estimate D2E/DX2                !
  113. ! R14   R(7,16)                 1.07           estimate D2E/DX2                !
  114. ! R15   R(8,9)                  1.3958         estimate D2E/DX2                !
  115. ! R16   R(8,15)                 1.3994         estimate D2E/DX2                !
  116. ! R17   R(9,10)                 1.4033         estimate D2E/DX2                !
  117. ! R18   R(9,11)                 1.3997         estimate D2E/DX2                !
  118. ! R19   R(10,21)                1.07           estimate D2E/DX2                !
  119. ! R20   R(11,12)                1.07           estimate D2E/DX2                !
  120. ! R21   R(11,13)                1.3573         estimate D2E/DX2                !
  121. ! R22   R(13,14)                1.4051         estimate D2E/DX2                !
  122. ! R23   R(13,22)                1.07           estimate D2E/DX2                !
  123. ! R24   R(14,15)                1.3569         estimate D2E/DX2                !
  124. ! R25   R(14,23)                1.07           estimate D2E/DX2                !
  125. ! R26   R(15,24)                1.07           estimate D2E/DX2                !
  126. ! A1    A(2,1,6)              120.4502         estimate D2E/DX2                !
  127. ! A2    A(2,1,17)             119.7749         estimate D2E/DX2                !
  128. ! A3    A(6,1,17)             119.7749         estimate D2E/DX2                !
  129. ! A4    A(1,2,3)              119.9649         estimate D2E/DX2                !
  130. ! A5    A(1,2,18)             120.0176         estimate D2E/DX2                !
  131. ! A6    A(3,2,18)             120.0176         estimate D2E/DX2                !
  132. ! A7    A(2,3,4)              119.5236         estimate D2E/DX2                !
  133. ! A8    A(2,3,7)              120.3859         estimate D2E/DX2                !
  134. ! A9    A(4,3,7)              120.0905         estimate D2E/DX2                !
  135. ! A10   A(3,4,5)              119.7503         estimate D2E/DX2                !
  136. ! A11   A(3,4,8)              119.586          estimate D2E/DX2                !
  137. ! A12   A(5,4,8)              120.6637         estimate D2E/DX2                !
  138. ! A13   A(4,5,6)              119.8958         estimate D2E/DX2                !
  139. ! A14   A(4,5,19)             120.0521         estimate D2E/DX2                !
  140. ! A15   A(6,5,19)             120.0521         estimate D2E/DX2                !
  141. ! A16   A(1,6,5)              120.4153         estimate D2E/DX2                !
  142. ! A17   A(1,6,20)             119.7924         estimate D2E/DX2                !
  143. ! A18   A(5,6,20)             119.7924         estimate D2E/DX2                !
  144. ! A19   A(3,7,10)             120.3235         estimate D2E/DX2                !
  145. ! A20   A(3,7,16)             119.8382         estimate D2E/DX2                !
  146. ! A21   A(10,7,16)            119.8382         estimate D2E/DX2                !
  147. ! A22   A(4,8,9)              119.586          estimate D2E/DX2                !
  148. ! A23   A(4,8,15)             120.6637         estimate D2E/DX2                !
  149. ! A24   A(9,8,15)             119.7503         estimate D2E/DX2                !
  150. ! A25   A(8,9,10)             120.0905         estimate D2E/DX2                !
  151. ! A26   A(8,9,11)             119.5236         estimate D2E/DX2                !
  152. ! A27   A(10,9,11)            120.3859         estimate D2E/DX2                !
  153. ! A28   A(7,10,9)             120.3235         estimate D2E/DX2                !
  154. ! A29   A(7,10,21)            119.8382         estimate D2E/DX2                !
  155. ! A30   A(9,10,21)            119.8382         estimate D2E/DX2                !
  156. ! A31   A(9,11,12)            120.0176         estimate D2E/DX2                !
  157. ! A32   A(9,11,13)            119.9649         estimate D2E/DX2                !
  158. ! A33   A(12,11,13)           120.0176         estimate D2E/DX2                !
  159. ! A34   A(11,13,14)           120.4502         estimate D2E/DX2                !
  160. ! A35   A(11,13,22)           119.7749         estimate D2E/DX2                !
  161. ! A36   A(14,13,22)           119.7749         estimate D2E/DX2                !
  162. ! A37   A(13,14,15)           120.4153         estimate D2E/DX2                !
  163. ! A38   A(13,14,23)           119.7924         estimate D2E/DX2                !
  164. ! A39   A(15,14,23)           119.7924         estimate D2E/DX2                !
  165. ! A40   A(8,15,14)            119.8958         estimate D2E/DX2                !
  166. ! A41   A(8,15,24)            120.0521         estimate D2E/DX2                !
  167. ! A42   A(14,15,24)           120.0521         estimate D2E/DX2                !
  168. ! D1    D(6,1,2,3)             -0.0002         estimate D2E/DX2                !
  169. ! D2    D(6,1,2,18)           179.9998         estimate D2E/DX2                !
  170. ! D3    D(17,1,2,3)           179.9999         estimate D2E/DX2                !
  171. ! D4    D(17,1,2,18)           -0.0001         estimate D2E/DX2                !
  172. ! D5    D(2,1,6,5)              0.0003         estimate D2E/DX2                !
  173. ! D6    D(2,1,6,20)          -179.9998         estimate D2E/DX2                !
  174. ! D7    D(17,1,6,5)          -179.9998         estimate D2E/DX2                !
  175. ! D8    D(17,1,6,20)            0.0002         estimate D2E/DX2                !
  176. ! D9    D(1,2,3,4)              0.0            estimate D2E/DX2                !
  177. ! D10   D(1,2,3,7)            179.9998         estimate D2E/DX2                !
  178. ! D11   D(18,2,3,4)           180.0            estimate D2E/DX2                !
  179. ! D12   D(18,2,3,7)            -0.0001         estimate D2E/DX2                !
  180. ! D13   D(2,3,4,5)              0.0001         estimate D2E/DX2                !
  181. ! D14   D(2,3,4,8)            179.9999         estimate D2E/DX2                !
  182. ! D15   D(7,3,4,5)           -179.9998         estimate D2E/DX2                !
  183. ! D16   D(7,3,4,8)              0.0            estimate D2E/DX2                !
  184. ! D17   D(2,3,7,10)          -179.9999         estimate D2E/DX2                !
  185. ! D18   D(2,3,7,16)             0.0            estimate D2E/DX2                !
  186. ! D19   D(4,3,7,10)            -0.0001         estimate D2E/DX2                !
  187. ! D20   D(4,3,7,16)           179.9999         estimate D2E/DX2                !
  188. ! D21   D(3,4,5,6)              0.0            estimate D2E/DX2                !
  189. ! D22   D(3,4,5,19)           179.9998         estimate D2E/DX2                !
  190. ! D23   D(8,4,5,6)           -179.9998         estimate D2E/DX2                !
  191. ! D24   D(8,4,5,19)             0.0            estimate D2E/DX2                !
  192. ! D25   D(3,4,8,9)              0.0            estimate D2E/DX2                !
  193. ! D26   D(3,4,8,15)          -179.9997         estimate D2E/DX2                !
  194. ! D27   D(5,4,8,9)            179.9998         estimate D2E/DX2                !
  195. ! D28   D(5,4,8,15)             0.0001         estimate D2E/DX2                !
  196. ! D29   D(4,5,6,1)             -0.0002         estimate D2E/DX2                !
  197. ! D30   D(4,5,6,20)           179.9999         estimate D2E/DX2                !
  198. ! D31   D(19,5,6,1)          -179.9999         estimate D2E/DX2                !
  199. ! D32   D(19,5,6,20)            0.0001         estimate D2E/DX2                !
  200. ! D33   D(3,7,10,9)             0.0001         estimate D2E/DX2                !
  201. ! D34   D(3,7,10,21)          180.0            estimate D2E/DX2                !
  202. ! D35   D(16,7,10,9)         -179.9999         estimate D2E/DX2                !
  203. ! D36   D(16,7,10,21)           0.0            estimate D2E/DX2                !
  204. ! D37   D(4,8,9,10)             0.0            estimate D2E/DX2                !
  205. ! D38   D(4,8,9,11)          -179.9998         estimate D2E/DX2                !
  206. ! D39   D(15,8,9,10)          179.9998         estimate D2E/DX2                !
  207. ! D40   D(15,8,9,11)           -0.0001         estimate D2E/DX2                !
  208. ! D41   D(4,8,15,14)          179.9997         estimate D2E/DX2                !
  209. ! D42   D(4,8,15,24)           -0.0001         estimate D2E/DX2                !
  210. ! D43   D(9,8,15,14)            0.0            estimate D2E/DX2                !
  211. ! D44   D(9,8,15,24)         -179.9998         estimate D2E/DX2                !
  212. ! D45   D(8,9,10,7)            -0.0001         estimate D2E/DX2                !
  213. ! D46   D(8,9,10,21)         -179.9999         estimate D2E/DX2                !
  214. ! D47   D(11,9,10,7)          179.9998         estimate D2E/DX2                !
  215. ! D48   D(11,9,10,21)          -0.0001         estimate D2E/DX2                !
  216. ! D49   D(8,9,11,12)          179.9999         estimate D2E/DX2                !
  217. ! D50   D(8,9,11,13)            0.0            estimate D2E/DX2                !
  218. ! D51   D(10,9,11,12)           0.0001         estimate D2E/DX2                !
  219. ! D52   D(10,9,11,13)        -179.9999         estimate D2E/DX2                !
  220. ! D53   D(9,11,13,14)           0.0002         estimate D2E/DX2                !
  221. ! D54   D(9,11,13,22)        -179.9999         estimate D2E/DX2                !
  222. ! D55   D(12,11,13,14)       -179.9997         estimate D2E/DX2                !
  223. ! D56   D(12,11,13,22)          0.0002         estimate D2E/DX2                !
  224. ! D57   D(11,13,14,15)         -0.0003         estimate D2E/DX2                !
  225. ! D58   D(11,13,14,23)        179.9997         estimate D2E/DX2                !
  226. ! D59   D(22,13,14,15)        179.9998         estimate D2E/DX2                !
  227. ! D60   D(22,13,14,23)         -0.0002         estimate D2E/DX2                !
  228. ! D61   D(13,14,15,8)           0.0002         estimate D2E/DX2                !
  229. ! D62   D(13,14,15,24)        180.0            estimate D2E/DX2                !
  230. ! D63   D(23,14,15,8)        -179.9998         estimate D2E/DX2                !
  231. ! D64   D(23,14,15,24)          0.0            estimate D2E/DX2                !
  232. --------------------------------------------------------------------------------
  233. Trust Radius=3.00D-01 FncErr=1.00D-07 GrdErr=1.00D-06
  234. Number of steps in this run=    142 maximum allowed number of steps=    144.
  235. GradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGrad

  237. Leave Link  103 at Wed Feb 11 18:30:55 2015, MaxMem=  655360000 cpu:       0.0

  239.                           Input orientation:                          
  240. ---------------------------------------------------------------------
  241. Center     Atomic      Atomic             Coordinates (Angstroms)
  242. Number     Number       Type             X           Y           Z
  243. ---------------------------------------------------------------------
  244.       1          6           0       -5.305170   -3.354929   -0.003954
  245.       2          6           0       -3.948242   -3.386060   -0.005181
  246.       3          6           0       -3.221484   -2.189778   -0.003751
  247.       4          6           0       -3.902380   -0.971321   -0.001065
  248.       5          6           0       -5.301670   -0.957815    0.000171
  249.       6          6           0       -5.989310   -2.127581   -0.001246
  250.       7          6           0       -1.818362   -2.211654   -0.005000
  251.       8          6           0       -3.178008    0.223965    0.000369
  252.       9          6           0       -1.782772    0.184242   -0.000904
  253.      10          6           0       -1.114048   -1.049464   -0.003607
  254.      11          6           0       -1.058622    1.382104    0.000537
  255.      12          1           0        0.011167    1.360876   -0.000421
  256.      13          6           0       -1.714173    2.570578    0.003154
  257.      14          6           0       -3.118793    2.609063    0.004436
  258.      15          6           0       -3.837540    1.458148    0.003069
  259.      16          1           0       -1.300516   -3.147993   -0.007058
  260.      17          1           0       -5.857688   -4.271238   -0.005055
  261.      18          1           0       -3.434350   -4.324575   -0.007242
  262.      19          1           0       -5.828547   -0.026527    0.002234
  263.      20          1           0       -7.059240   -2.115323   -0.000295
  264.      21          1           0       -0.044358   -1.075206   -0.004574
  265.      22          1           0       -1.157579    3.484417    0.004248
  266.      23          1           0       -3.624798    3.551854    0.006503
  267.      24          1           0       -4.906930    1.494233    0.004057
  268. ---------------------------------------------------------------------
  269.                     Distance matrix (angstroms):
  270.                     1          2          3          4          5
  271.      1  C    0.000000
  272.      2  C    1.357286   0.000000
  273.      3  C    2.387325   1.399739   0.000000
  274.      4  C    2.765757   2.415177   1.395802   0.000000
  275.      5  C    2.397120   2.779959   2.417627   1.399356   0.000000
  276.      6  C    1.405147   2.397862   2.768526   2.385836   1.356910
  277.      7  C    3.669456   2.432204   1.403293   2.425195   3.702104
  278.      8  C    4.163330   3.691283   2.414138   1.397650   2.430338
  279.      9  C    4.993298   4.175683   2.775945   2.414138   3.699586
  280.     10  C    4.783374   3.673191   2.396164   2.789427   4.188626
  281.     11  C    6.361813   5.575421   4.175683   3.691283   4.845480
  282.     12  H    7.106494   6.181451   4.801790   4.555764   5.796771
  283.     13  C    6.928704   6.361813   4.993298   4.163330   5.031868
  284.     14  C    6.352127   6.052237   4.799947   3.665132   4.181817
  285.     15  C    5.031868   4.845480   3.699586   2.430338   2.824989
  286.     16  H    4.009998   2.658407   2.146697   3.392290   4.561377
  287.     17  H    1.070000   2.104644   3.358876   3.835713   3.359755
  288.     18  H    2.107176   1.070000   2.145387   3.385764   3.849937
  289.     19  H    3.369305   3.849943   3.387693   2.145406   1.070000
  290.     20  H    2.147882   3.360521   3.838479   3.357753   2.104489
  291.     21  H    5.733522   4.536557   3.366957   3.859421   5.258624
  292.     22  H    7.998702   7.415615   6.037902   5.233313   6.075108
  293.     23  H    7.108264   6.945459   5.755789   4.531691   4.811346
  294.     24  H    4.865493   4.973572   4.051262   2.662349   2.483621
  295.                     6          7          8          9         10
  296.      6  C    0.000000
  297.      7  C    4.171797   0.000000
  298.      8  C    3.665132   2.789427   0.000000
  299.      9  C    4.799947   2.396164   1.395802   0.000000
  300.     10  C    4.993047   1.358950   2.425195   1.403293   0.000000
  301.     11  C    6.052237   3.673191   2.415177   1.399739   2.432204
  302.     12  H    6.940825   4.013747   3.385764   2.145387   2.660049
  303.     13  C    6.352127   4.783374   2.765757   2.387325   3.669456
  304.     14  C    5.538565   4.993047   2.385836   2.768526   4.171797
  305.     15  C    4.181817   4.188626   1.399356   2.417627   3.702104
  306.     16  H    4.798548   1.070000   3.859421   3.366957   2.106800
  307.     17  H    2.147697   4.534098   5.233313   6.037902   5.734278
  308.     18  H    3.369665   2.660048   4.555764   4.801790   4.013747
  309.     19  H    2.107198   4.566882   2.662349   4.051262   4.824202
  310.     20  H    1.070000   5.241765   4.531691   5.755789   6.039980
  311.     21  H    6.037380   2.106799   3.392290   2.146697   1.070000
  312.     22  H    7.405416   5.734278   3.835713   3.358876   4.534098
  313.     23  H    6.151989   6.039980   3.357753   3.838479   5.241765
  314.     24  H    3.780094   4.824203   2.145406   3.387693   4.566882
  315.                    11         12         13         14         15
  316.     11  C    0.000000
  317.     12  H    1.070000   0.000000
  318.     13  C    1.357286   2.107176   0.000000
  319.     14  C    2.397862   3.369665   1.405147   0.000000
  320.     15  C    2.779959   3.849937   2.397120   1.356910   0.000000
  321.     16  H    4.536557   4.695791   5.733522   6.037380   5.258624
  322.     17  H    7.415615   8.134137   7.998702   7.405416   6.075108
  323.     18  H    6.181451   6.648006   7.106494   6.940825   5.796771
  324.     19  H    4.973572   6.002262   4.865493   3.780094   2.483621
  325.     20  H    6.945459   7.878743   7.108264   6.151989   4.811347
  326.     21  H    2.658408   2.436718   4.009998   4.798548   4.561378
  327.     22  H    2.104644   2.423926   1.070000   2.147697   3.359755
  328.     23  H    3.360521   4.245076   2.147882   1.070000   2.104489
  329.     24  H    3.849943   4.919907   3.369305   2.107198   1.070000
  330.                    16         17         18         19         20
  331.     16  H    0.000000
  332.     17  H    4.693560   0.000000
  333.     18  H    2.436718   2.423926   0.000000
  334.     19  H    5.499700   4.244817   4.919907   0.000000
  335.     20  H    5.850585   2.468141   4.245076   2.424392   0.000000
  336.     21  H    2.423713   6.633960   4.695791   5.878487   7.091574
  337.     22  H    6.633960   9.068699   8.134137   5.843344   8.135521
  338.     23  H    7.091574   8.135521   7.878743   4.202540   6.626638
  339.     24  H    5.878487   5.843344   6.002262   1.778227   4.202540
  340.                    21         22         23         24
  341.     21  H    0.000000
  342.     22  H    4.693560   0.000000
  343.     23  H    5.850586   2.468141   0.000000
  344.     24  H    5.499700   4.244817   2.424392   0.000000
  345. Stoichiometry    C14H10
  346. Framework group  C1[X(C14H10)]
  347. Deg. of freedom    66
  348. Full point group                 C1      NOp   1
  349. Largest Abelian subgroup         C1      NOp   1
  350. Largest concise Abelian subgroup C1      NOp   1
  351.                          Standard orientation:                        
  352. ---------------------------------------------------------------------
  353. Center     Atomic      Atomic             Coordinates (Angstroms)
  354. Number     Number       Type             X           Y           Z
  355. ---------------------------------------------------------------------
  356.       1          6           0        3.464350   -0.310528   -0.003045
  357.       2          6           0        2.787709    0.866069   -0.004273
  358.       3          6           0        1.387972    0.867596   -0.002842
  359.       4          6           0        0.698825   -0.346213   -0.000156
  360.       5          6           0        1.412494   -1.549904    0.001080
  361.       6          6           0        2.769281   -1.531719   -0.000337
  362.       7          6           0        0.679475    2.078902   -0.004091
  363.       8          6           0       -0.698825   -0.346210    0.001278
  364.       9          6           0       -1.387972    0.867601    0.000004
  365.      10          6           0       -0.679474    2.078904   -0.002698
  366.      11          6           0       -2.787709    0.866078    0.001446
  367.      12          1           0       -3.324001    1.791978    0.000488
  368.      13          6           0       -3.464350   -0.310516    0.004062
  369.      14          6           0       -2.769281   -1.531710    0.005345
  370.      15          6           0       -1.412494   -1.549899    0.003978
  371.      16          1           0        1.211856    3.007053   -0.006149
  372.      17          1           0        4.534347   -0.308147   -0.004146
  373.      18          1           0        3.324001    1.791967   -0.006333
  374.      19          1           0        0.889113   -2.483160    0.003143
  375.      20          1           0        3.313317   -2.453090    0.000614
  376.      21          1           0       -1.211856    3.007058   -0.003665
  377.      22          1           0       -4.534347   -0.308131    0.005157
  378.      23          1           0       -3.313317   -2.453079    0.007412
  379.      24          1           0       -0.889113   -2.483157    0.004966
  380. ---------------------------------------------------------------------
  381. Rotational constants (GHZ):      1.6387797      0.5836309      0.4303626
  382. Leave Link  202 at Wed Feb 11 18:30:55 2015, MaxMem=  655360000 cpu:       0.0

  384. Standard basis: 6-31G(d) (6D, 7F)
  385. Ernie: Thresh=  0.10000D-02 Tol=  0.10000D-05 Strict=F.
  386. There are   230 symmetry adapted basis functions of A   symmetry.
  387. Integral buffers will be    131072 words long.
  388. Raffenetti 2 integral format.
  389. Two-electron integral symmetry is turned on.
  390.    230 basis functions,   432 primitive gaussians,   230 cartesian basis functions
  391.     47 alpha electrons       47 beta electrons
复制代码

这个计算大概得几天啊？谢谢！

作者
Author: sobereva    时间: 2015-2-13 21:48
计算条件实在不佳...

你先看看算到哪了，是还在优化，还是正在弄算频率
作者
Author: bomsaude    时间: 2015-2-13 22:31
sobereva 发表于 2015-2-13 13:48
计算条件实在不佳...

你先看看算到哪了，是还在优化，还是正在弄算频率

第一步不到5小时
Leave Link 9999 at Wed Feb 11 20:59:49 2015, MaxMem=  655360000 cpu:       0.1
Job cpu time:  0 days  4 hours 53 minutes 52.5 seconds.

现在快90小时了，还在算。。。

谢谢！
作者
Author: sobereva    时间: 2015-2-13 23:46
bomsaude 发表于 2015-2-13 22:31
第一步不到5小时
Leave Link 9999 at Wed Feb 11 20:59:49 2015, MaxMem=  655360000 cpu:       0.1
  ...

输出文件如果压缩后不大就发上来吧，否则没法说清楚
作者
Author: bomsaude    时间: 2015-2-14 01:47
sobereva 发表于 2015-2-13 15:46
输出文件如果压缩后不大就发上来吧，否则没法说清楚

第一步很快就完成了，这一步一个maximum force的结果也没有。试一下也不知道何时能结束？

(, 下载次数 Times of downloads: 8)
作者
Author: sobereva    时间: 2015-2-14 02:57
优化已经算完了，现在正在算频率。
TDDFT不支持解析二阶导数，需要在一阶解析导数上做有限差分得到，所以算频率非常慢，相当于做6N步TDDFT几何优化的耗时。

既然是双核，应该用nprocs=2啊。
目前情况，大概一步1个小时，估计整个任务总耗时为150小时左右，约6天。
作者
Author: bomsaude    时间: 2015-2-20 00:04
sobereva 发表于 2015-2-13 18:57
优化已经算完了，现在正在算频率。
TDDFT不支持解析二阶导数，需要在一阶解析导数上做有限差分得到，所以 ...

我这个优化和频率计算都结束了，吸收和发射光谱也计算完了。正像你说的，要花费6天时间，具体的时间是：

结构优化 CPU time 大约5小时，频率：CPU time 大约12天19小时，因为是双核，实际时间大约是一半的样子，6天半。

我这个电脑是个人台式机，我设置了Default.Route中 -P- 2，这和输入文件中设置%nprocs=2，原先我原以为是一样的。但我在输入文件中这样设置后，用一个文件试了一下，用时似乎是一样的。这两种设置到底是怎么控制计算的？

另外，您估计说需要6天，也是实际时间吗（非CPU时间）？那个6N步优化的时间推出大约150个小时，是如何推算的？谢谢了！

吸收和发光光谱如下：

(, 下载次数 Times of downloads: 31)

文献找到一个它的吸收和发射图，但溶剂不一样：

(, 下载次数 Times of downloads: 45)
作者
Author: sobereva    时间: 2015-2-20 06:11
我说的就是实际时间，也即wall clock时间。

-P- 2和nprocs=2效果是完全一样的，都是利用双核。

从你的优化过程的实际耗时（离开最后的link的时间减去最开始进入link的时间之差）除以优化过程的步数就可以推断每一次SCF+受力计算需要将近一个小时。基于有限差分进行频率计算总共要在6N个结构下做SCF+受力计算，于是总时间就很容易得出了。
作者
Author: bomsaude    时间: 2015-2-20 17:29
sobereva 发表于 2015-2-19 22:11
我说的就是实际时间，也即wall clock时间。

-P- 2和nprocs=2效果是完全一样的，都是利用双核。

非常感谢您的解惑！祝春节快乐！
作者
Author: 万卷书万里路    时间: 2015-12-11 14:43
bomsaude 发表于 2015-2-20 00:04
我这个优化和频率计算都结束了，吸收和发射光谱也计算完了。正像你说的，要花费6天时间，具体的时间是：
...

楼主能讲一下这个吸收光谱和发射光谱怎么做的吗，提取输出文件中的哪些数据还有您计算的过程步骤能讲一下吗，正在学习，谢谢您啦！
作者
Author: bomsaude    时间: 2015-12-11 22:49
本帖最后由 bomsaude 于 2015-12-11 15:01 编辑
万卷书万里路 发表于 2015-12-11 06:43
楼主能讲一下这个吸收光谱和发射光谱怎么做的吗，提取输出文件中的哪些数据还有您计算的过程步骤能讲一下 ...

In the following link:

http://ccc.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=774

there is a detailed description that I made before. It gave how to calculate the absorption and emission spectra including the input files.

After you get the out (or log) file, open it, you can easily find the data, and copy it to Origin to plot it. One thing should be mentinoned is you should change the D in the data to E before you plot the figures.  

Please try it. Good luck!

P.S. I don't have Chinese input method on this computer.

作者
Author: 万卷书万里路    时间: 2015-12-13 21:54
bomsaude 发表于 2015-12-11 22:49
In the following link:

http://ccc.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=774

谢谢！



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