计算化学公社

标题: 激基复合物优化问题 [打印本页]

作者
Author: Yoghurt 时间: 2015-3-11 22:26
标题: 激基复合物优化问题
对于激基复合物，往往有两个平面相互平行且靠的很近，但是完全放开优化时，得到的结构两个平面会错开并且不平行，请问大家知道怎么优化激基复合物吗？谢谢
如图1（右）即为很简单的激基复合物，图2为输入的构型，但是优化以后的结构为图3. 其中的Ni带着两个单位的正电荷。另外设置Ni不带电荷，优化出来的结构也不理想，两个平面不平行且错开。

作者
Author: sobereva 时间: 2015-3-12 02:20
用的什么方法和基组优化的？

文献中有无已经优化好的这类体系的立体结构？

作者
Author: Yoghurt 时间: 2015-3-12 07:23

sobereva 发表于 2015-3-12 02:20
用的什么方法和基组优化的？

文献中有无已经优化好的这类体系的立体结构？

Ni原子用LANL2DZ,其余原子都用6-31G（d）,别的文献中有类似的结构但是没有一样的，比如中央没有金属原子或者金属原子不是Ni2+还有两个芘中间的连接体不一样

作者
Author: Yoghurt 时间: 2015-3-12 07:24

sobereva 发表于 2015-3-12 02:20
用的什么方法和基组优化的？

文献中有无已经优化好的这类体系的立体结构？

方法是B3LYP

作者
Author: sobereva 时间: 2015-3-12 11:44
芳环间有明显pi-pi作用，建议改为B3LYP-D3(BJ)/6-31+G*后再试。

如果还是不行，取文献里的结构，用与它们相同的方法优化试试，看是否也有这个问题。

从直觉上看，由于有金属存在，可能会破坏平行的结构。

作者
Author: jiewei 时间: 2015-3-14 13:33
首先，这个体系有弱作用，这种激基缔合物牵涉到分子内的电荷转移，所以我其实更建议用方法CAM-B3LYP-D3.
其次基组选择对非金属我建议是 6-31+g（d，p）。

另外我建议，优化步长调小一点。

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)