计算化学公社

标题: 过渡态结构计算问题 [打印本页]

作者
Author: Faye 时间: 2018-1-14 22:24
标题: 过渡态结构计算问题
老师好，我想求反应的过渡态，之前用TS方法，但求出的过渡态经过IRC之后一直连接不了反应物，于是使用QST2方法，但是求出的过渡态结构与假设的反应物和中间体相差很大，用此过渡态做的IRC也是连接不了假设的反应物和中间体，请问老师，是我QST2方法用错了，还是假设的反应物和中间体本身有问题呢？
图片是我参考的文章中做的模拟，想做类似反应的模拟，请问我这种方法一直做的话，做的通吗？老师有推荐的方法吗？非常感谢老师的阅读

作者
Author: sobereva 时间: 2018-1-14 22:25
上传较大文本文件前一定要先压缩！以节约论坛空间、降低他人下载耗时
并且帖子标题要明确，直接反映帖子内容。考虑写一篇论文的时候是怎么起文章标题的

作者
Author: sobereva 时间: 2018-1-14 22:28
先确认过渡态虚频方向正确，再去跑IRC。虚频都明显不靠谱，跑IRC只会纯粹浪费时间
不要指望QST2比人聪明，QST2经常初猜的过渡态结构根本不靠谱，优化出来自己期望的过渡态更是不可能

作者
Author: Faye 时间: 2018-1-14 22:28
非常抱歉，这是我压缩后的文件，谢谢您

作者
Author: Faye 时间: 2018-1-14 22:31

sobereva 发表于 2018-1-14 22:28
先确认过渡态虚频方向正确，再去跑IRC。虚频都明显不靠谱，跑IRC只会纯粹浪费时间
不要指望QST2比人聪明， ...

非常感谢老师的答复，之前老师有说过TS 方法较适合，可总是有“IRC路径与自己设想想去太远”的问题，这个是自身化学知识薄弱，基元反应假设错误的缘故吗？

作者
Author: sobereva 时间: 2018-1-14 22:37

Faye 发表于 2018-1-14 22:31
非常感谢老师的答复，之前老师有说过TS 方法较适合，可总是有“IRC路径与自己设想想去太远”的问题，这个 ...

opt=TS适用于一切问题，能否找到应有的过渡态，纯粹看自己给的初猜结构是否适合，以及一些关键词是否有助于收敛到过渡态。
过渡态找对了，IRC自然就能往实际的基元反应的产物和反应物方向走。

作者
Author: sobereva 时间: 2018-1-14 22:40
你的输入文件明显不合理
你的IRC任务的初始结构是极小点结构，和过渡态完全没有相似性，显然不可能走得通IRC
常识看
在Gaussian中计算IRC的方法和常见问题
http://sobereva.com/400

而且QST2的输入文件里的两帧也不对应于反应物和产物复合物结构，显然也找不到过渡态
这种体系不要用QST2

标题给你改了

作者
Author: Faye 时间: 2018-1-14 22:44
非常感谢老师的回复，真的非常感谢您!

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