计算化学公社

标题: 做TD计算时可以用色散校正吗?怎样计算二聚体到溶液里会不会被破坏? [打印本页]

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风影月瞳    时间: 2018-1-17 09:49
标题: 做TD计算时可以用色散校正吗?怎样计算二聚体到溶液里会不会被破坏?
在研究一个二聚体,做TD计算吸收光谱时可以用色散校正吗?该二聚体是通过氢键连接,怎样计算二聚体到溶液里会不会被破坏?


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sobereva    时间: 2018-1-17 10:18
可以用,但对于垂直激发不会影响激发能,因为D3校正只依赖几何结构
计算溶液中二聚化过程的自由能变,越负越不容易被破坏(热力学角度),怎么算溶剂下的自由能看
谈谈隐式溶剂模型下溶解自由能和体系自由能的计算
http://sobereva.com/327
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风影月瞳    时间: 2018-1-17 12:06
sobereva 发表于 2018-1-17 10:18
可以用,但对于垂直激发不会影响激发能,因为D3校正只依赖几何结构
计算溶液中二聚化过程的自由能变,越负 ...

谢谢老师,二聚体的自由能-25kcal/mol左右,其单体的-16kcal/mol,这些值能直接判断会不会被破坏吗?是不是要搞一些二聚体再加一些溶剂分子建一个模型去跑个动力学再看看平衡后是个什么状态?跑动力学跑什么类型的,有什么建议吗?
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sobereva    时间: 2018-1-17 13:48
风影月瞳 发表于 2018-1-17 12:06
谢谢老师,二聚体的自由能-25kcal/mol左右,其单体的-16kcal/mol,这些值能直接判断会不会被破坏吗?是不 ...

计算二聚体过程自由能变化
变化为负已经从热力学上说明能出现二聚(前提是计算级别合理)
做MD判断更为严格,但前提是力场合理




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