计算化学公社

标题: 相关bcp搜索不到 [打印本页]

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Author: jctyp 时间: 2018-1-23 10:40
标题: 相关bcp搜索不到
向各位老师请教：1.附件中是fchk文件，拓扑分析时，最长的和最短c-cr键的bcp找到了，但并不是所有的c-cr的bcp都找到了。满足PH关系。问题是既然最长的和最短c-cr键的bcp找到了，那不应该是所有的c-cr的bcp都应该有吗？
2. b-cr的bcp怎么会没有，怎么会出现一个RCP（3.+1）？
麻烦大家帮分析一下，谢谢！
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作者
Author: sobereva 时间: 2018-1-23 11:12
如置顶的新人必读贴所示，上传较大文本型文件前一定要压缩，以节约论坛非常宝贵的空间、加快他人下载速度
我给你压缩后重新上传了，尺寸只有原先的1/4

作者
Author: sobereva 时间: 2018-1-23 11:21
当前体系临界点
The number of critical points of each type:
(3,-3): 29, (3,-1): 34, (3,+1): 6, (3,+3): 0
Poincare-Hopf relationship verification: 29 - 34 + 6 - 0 = 1
Fine, Poincare-Hopf relationship is satisfied, all CPs may have been found

总共就是这些
(, 下载次数 Times of downloads: 33)

并非所有看似有直接相互作用的原子间都理应有BCP，如果搞不清楚，看此文
利用约化密度梯度考察AIM临界点的位置
http://sobereva.com/267

作者
Author: jctyp 时间: 2018-1-23 11:35

sobereva 发表于 2018-1-23 11:12
如置顶的新人必读贴所示，上传较大文本型文件前一定要压缩，以节约论坛非常宝贵的空间、加快他人下载速度
...

看到没有超过上传大小要求限制，就上传了。考虑不周，谢谢sob指出，今后注意。

作者
Author: jctyp 时间: 2018-1-23 11:58

sobereva 发表于 2018-1-23 11:21
当前体系临界点
The number of critical points of each type:
(3,-3): 29, (3,-1): 34, (3,+1 ...

再请问卢老师，我已经用Multiwfn计算除了最长的和最短的c-cr键的bcp对应的Laplacian of electron density大于0，the -Gb/Vb between 0.7 and 1，energy density （Hb）小于0，是不是就可以说配体与中心原子成键有部分共价键特征，而不需要再考虑配体中B原子与Cr的成键情况？配位模式呢？6配位还是7配位？谢谢！

作者
Author: sobereva 时间: 2018-1-23 15:27

jctyp 发表于 2018-1-23 11:58
再请问卢老师，我已经用Multiwfn计算除了最长的和最短的c-cr键的bcp对应的Laplacian of electron density ...

配位数可以用主功能100里的选项9来计算，一般还是靠谱的
当前肯定是共价作用，典型的配位键

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Author: jctyp 时间: 2018-1-23 21:02

sobereva 发表于 2018-1-23 15:27
配位数可以用主功能100里的选项9来计算，一般还是靠谱的
当前肯定是共价作用，典型的配位键

谢谢卢老师！

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