计算化学公社

标题: Dalton 编译报错求助 [打印本页]

作者
Author:
lianghuashou    时间: 2018-1-25 16:36
标题: Dalton 编译报错求助
在编译DALTON2016的时候,一直报错,报错信息是
[  0%] Performing configure step for 'gen1int'
CMake Error: The source directory "/dalton_2016/external/gen1int" does not appear to contain CMakeLists.txt.

按照论坛上的方法,
#git submodule update --init --recursive
也不行,报错信息还是一样的
试过,rm CMakeCache.txt 然后在make,依然报错,信息还是一样
请各位专家帮忙看看怎么解决。十分感谢


作者
Author:
sobereva    时间: 2018-1-25 17:01
=======安装方法=========
CentOS 7.2,root,gfortran

串行版编译:
./setup --prefix=/sob       //会安装到/sob/dalton下面。默认用gfortran和gcc
cd build
make -j 36
make install
ctest -j 36   //同时测试四个任务,每个任务串行计算

并行版编译:
安装openmpi:./configure --prefix=/sob/openmpi202; make all install (用-j没用,并不会并行编译)
然后把openmpi目录下的bin、lib加入到PATH和LD_LIBRARY_PATH里
./setup --mpi --prefix=/sob
cd build
make -j 36   (四核的话18分钟编译完毕)
make install
ctest   //一次运行一个任务,并行执行

把此加入到.bashrc:export PATH=$PATH:/sob/dalton

运行任务、做测试前要设定如下环境变量
export DALTON_TMPDIR=/sob2/Daltonscr
export DALTON_LAUNCHER="mpirun -np 36 --allow-run-as-root"
export LSDALTON_LAUNCHER="mpirun -np 36 --allow-run-as-root"
=======================
作者
Author:
bomsaude    时间: 2018-1-25 18:29
直接按Sob的下载
http://bbs.keinsci.com/forum.php ... =%B5%C0%B6%FB%B6%D9

或者按论坛说的,才能下载到外部模块,直接下载那个文件装不上的

git clone --recursive -b release/2016 git@gitlab.com:dalton/dalton.git


编译很容易,测试时Ubuntu下gfortran编译全部通过,Centos下ifort编译有几个通不过

另外,我在个人电脑安装Dalton2016,感觉ifort编译的比gfortran编译的快许多(计算磷光时,其它没试),不知道有否普遍性?

祝你好运!
作者
Author:
lianghuashou    时间: 2018-1-26 18:14
各位老师,可否发我一个编译过的dalton测试一下,按照各位老师介绍的方法编译依然是同样的错误,深感无力,感激不尽




欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3