计算化学公社

标题: 电子圆二色和振动圆二色固体计算 [打印本页]

作者
Author: GDZYJ 时间: 2018-1-26 08:54
标题: 电子圆二色和振动圆二色固体计算
本帖最后由 GDZYJ 于 2018-1-26 09:02 编辑

各位大牛好：
小子想请教一个问题，在用高斯进行固体ECD和VCD计算时，怎样去建立真空模型？

谢谢！
祝好！

作者
Author: sobereva 时间: 2018-1-26 12:48
Gaussian默认计算就是真空下，不用像第一性原理程序那样设立真空层
Gaussian没法在PBC下计算固体的ECD和VCD，只能挖个团簇来算

作者
Author: GDZYJ 时间: 2018-1-26 13:03

sobereva 发表于 2018-1-26 12:48
Gaussian默认计算就是真空下，不用像第一性原理程序那样设立真空层
Gaussian没法在PBC下计算固体的ECD和VC ...

好的，谢谢老师！

作者
Author: mozixingchen 时间: 2019-8-3 21:11

sobereva 发表于 2018-1-26 12:48
Gaussian默认计算就是真空下，不用像第一性原理程序那样设立真空层
Gaussian没法在PBC下计算固体的ECD和VC ...

请问sob老师，这个团簇要怎么选择，对周期性离子化合物是只选择有机阳离子还是有机阳离子和金属骨架阴离子一起选？选择个数和选择方法都是怎么样的？另外，我计算这个VCD是想和实验值来做对比的，我这个团簇模型算出来的结果是不是能够代表真实的VCD？多谢！

作者
Author: sobereva 时间: 2019-8-4 00:13

mozixingchen 发表于 2019-8-3 21:11
请问sob老师，这个团簇要怎么选择，对周期性离子化合物是只选择有机阳离子还是有机阳离子和金属骨架阴离 ...

看具体情况，包括分子结构、分子间相互作用情况等

你可以先尝试把截取的半径逐渐增加，得到越来越大的团簇，看看计算结果的收敛趋势。怎么挖团簇这里有演示
基于分子晶体cif文件抠出分子团簇结构
https://www.bilibili.com/video/av35864488/

如果本身分子就很刚性，可能取一个结果就足够说明问题。

也可以考虑用ONIOM，只考虑一个或几个分子，而把更外层的以MM方式描述。

作者
Author: mozixingchen 时间: 2019-8-5 10:51

sobereva 发表于 2019-8-4 00:13
看具体情况，包括分子结构、分子间相互作用情况等

你可以先尝试把截取的半径逐渐增加，得到越来越大的 ...

谢谢sob老师！我尝试取了几个半径，截出来的结果有半个或者说不完整的分子，例如：含H2O的化合物，截出来以后只有H-O, 请问这个情况应该怎么处理? 还有，这个团簇的电荷应该怎么取？另外，如果团簇带电荷会对计算出来的谱图的准确性有影响吗？多谢老师！

作者
Author: sobereva 时间: 2019-8-6 07:45

mozixingchen 发表于 2019-8-5 10:51
谢谢sob老师！我尝试取了几个半径，截出来的结果有半个或者说不完整的分子，例如：含H2O的化合物，截出来 ...

保留完整分子
电荷根据实际情况取。没具体情况没法说

作者
Author: mozixingchen 时间: 2019-8-6 10:05

sobereva 发表于 2019-8-6 07:45
保留完整分子
电荷根据实际情况取。没具体情况没法说

好的，多谢sob老师！

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