计算化学公社

标题: MS7.0 CASTEP模块求助手动导入的计算结果无法分析晶体的PDOS [打印本页]

作者
Author: shaco 时间: 2018-1-30 21:46
标题: MS7.0 CASTEP模块求助手动导入的计算结果无法分析晶体的PDOS
请教各位老师，我最近用MS7.0中的CASTEP模块计算晶体的性质（能带结构，态密度等）。计算结束后，有的任务能够自行从服务器上下载相应结果（这种情况下是可以分析晶体的PDOS的），有的不能，只能手动下载然后导入进windows版的MS7.0中。在这之中出现了一个问题，手动导入结果后，MS只能够分析体系的能带结构和TDOS，不能分析PDOS。且在选中xsd文件后，analysis模块下会显示<No results file available>，而且结构也无法更新。诚心请教各位老师，这个问题应该怎么解决？能否从手动导入的结果中生成一个新的xsd文件进行分析？衷心感谢施以援手的各位！！
(, 下载次数 Times of downloads: 101)

作者
Author: 卡开发发 时间: 2018-1-31 03:14
服务器上面直接运行CASTEP或者DMol3是没办法自动去计算性质的，你需要将Task_BandStr或Task_DOS以及check文件上传到服务器单独运行RunCASTEP.sh Task_BandStr或Task_DOS的任务才行。

作者
Author: shaco 时间: 2018-2-1 16:12

卡开发发发表于 2018-1-31 03:14
服务器上面直接运行CASTEP或者DMol3是没办法自动去计算性质的，你需要将Task_BandStr或Task_DOS以及check文 ...

感谢老师您的回复！但是我之前在服务器上算过体系的DOS和能带（在calculattion的property选项卡中选中Band Stucture 和 Density of States,然后再勾选Calculate PDOS），计算结束后从服务器自动下载到个人电脑上用软件是能够分析的，也能分析该物质的PDOS。但是如果计算正常结束后，服务器不能自动下载计算结果，需要我去服务器里找到计算结果目录手动下载到服务器上，再导入个人电脑上的MS7.0，就无法分析该物质的PDOS数据。给我的感觉好像是服务器和我windows版的MS连接出了问题一样，想请教下您这是哪种情况呢？
再次感谢您的帮助！

作者
Author: 卡开发发 时间: 2018-2-1 16:23

shaco 发表于 2018-2-1 16:12
感谢老师您的回复！但是我之前在服务器上算过体系的DOS和能带（在calculattion的property选项卡中选中Ban ...

哦，你是Win连接Linux算的，我以为你的情况是Linux下面直接运行出现的情况。你检查一下castep计算后产生的check文件是否也被拷贝到本地。

作者
Author: shaco 时间: 2018-2-1 16:42

卡开发发发表于 2018-2-1 16:23
哦，你是Win连接Linux算的，我以为你的情况是Linux下面直接运行出现的情况。你检查一下castep计算后产生 ...

拷到本地了已经，不过win版的MS好像读不出这个类型的文件啊？

作者
Author: 卡开发发 时间: 2018-2-1 18:14

shaco 发表于 2018-2-1 16:42
拷到本地了已经，不过win版的MS好像读不出这个类型的文件啊？

应该不会读不出，但是应该是个二进制文件，没办法用文本格式打开。你看看其他电脑是否有这样的情况。

作者
Author: shaco 时间: 2018-2-1 19:18

卡开发发发表于 2018-2-1 18:14
应该不会读不出，但是应该是个二进制文件，没办法用文本格式打开。你看看其他电脑是否有这样的情况。

嗯，好的，我再试一下看看。多谢您的帮助了！

作者
Author: xiaowandouer 时间: 2018-2-2 12:28
本帖最后由 xiaowandouer 于 2018-2-2 14:49 编辑

是不是输出文件没有拷全？以DOS分析为例，*.castep, *.castep_bin，*.cst_esp, *.bands，*.pdos_weights, 这几个输出文件都是必须的。

没有check文件不会影响分析。

作者
Author: shaco 时间: 2018-2-5 22:54

xiaowandouer 发表于 2018-2-2 12:28
是不是输出文件没有拷全？以DOS分析为例，*.castep, *.castep_bin，*.cst_esp, *.bands，*.pdos_weights, ...

感谢您的回复！您说的几类拓展名文件我都拷进去了（包括bands,bib,castep,castep_bin,
cell,check cst_esp,orbitals,param,pdos_weights,status.dat这几个文件），但是有些文件在win版的MS中读取不出来（软件中只显示bib,castep,param和status.dat这四个文件）。而且，好像这段时间算的性质数据都没办法从服务器自动下载到电脑上，原来没有出现过这个问题啊。我一直挺怀疑是不是服务器和台式机之间的连接出了什么问题，应该如何修正呢？再次请您不吝赐教！多谢！

作者
Author: xiaowandouer 时间: 2018-2-6 12:28

shaco 发表于 2018-2-5 22:54
感谢您的回复！您说的几类拓展名文件我都拷进去了（包括bands,bib,castep,castep_bin,
cell,check cst_e ...

复制的这些文件有没有放到性质计算的文件夹中？有些文件是隐藏文件，不显示没关系，但程序分析性质的时候需要用到。你的作业能在台式机上提交吗？

作者
Author: zorow 时间: 2018-2-7 18:22
请问楼主 7.0的软件报价是多少？

作者
Author: shaco 时间: 2018-2-28 16:45

zorow 发表于 2018-2-7 18:22
请问楼主 7.0的软件报价是多少？

不好意思啊，我刚进实验室，不是很清楚还

作者
Author: zorow 时间: 2018-2-28 22:58

shaco 发表于 2018-2-28 16:45
不好意思啊，我刚进实验室，不是很清楚还

没事，我向创腾询过价了，感谢您的回复！

作者
Author: 明天的荻荻 时间: 2019-6-5 13:20
想问问解决了吗，我也遇到了相似的问题

作者
Author: shaco 时间: 2019-6-10 15:18

明天的荻荻发表于 2019-6-5 13:20
想问问解决了吗，我也遇到了相似的问题

具体的还是没弄明白，我当时解决是重算了一篇，中间不关MS，等他自动下载下来

作者
Author: 王博 时间: 2021-11-9 14:31

shaco 发表于 2019-6-10 15:18
具体的还是没弄明白，我当时解决是重算了一篇，中间不关MS，等他自动下载下来

请问楼主解决了吗，我也遇到了相同的情况，超算计算结果导入后无法查看PDOS

作者
Author: ycmingjing 时间: 2022-11-10 10:45
同学你解决了吗

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)