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标题: 过渡态优化问题 [打印本页]

作者
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華華    时间: 2018-2-4 20:46
标题: 过渡态优化问题
各位大神,过渡态优化时,由于反应物的原子较多,优化时本来不应该反应的部分和发生反应的氧原子发生了反应,这主要是什么原因?我试了一下把反应物其中的一部分固定住,使其在优化时不与氧原子反应,这样优化氧原子的反应方向是对的,但是我不知道这样得到的结果是合理的吗?如果不合理我应该怎么解决这个问题呢?望各位不吝赐教,谢谢!!!

作者
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ysr9868    时间: 2018-2-5 00:14
我也经常遇到这种问题,我一般是用柔性扫描等方法找更精确的初猜,调整分子结构让容易反应的原子分开。
作者
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sobereva    时间: 2018-2-5 12:15
找到过渡态之后,必须把之前优化的地方放开,重新继续优化,否则结果明显引入人为虚假因素。如果之后又和氧反应上了,把那个部分构象修改一下,诸如偏向另一头,看优化后什么情况
另外也可以尝试其它计算级别




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