计算化学公社

标题: Warnings in Gaussian frequency calculation [打印本页]

作者
Author: ymygc 时间: 2018-2-9 04:53
标题: Warnings in Gaussian frequency calculation

我在计算两条parallel reaction pathways的决速步的吉布斯自由能，想要由此预算实验上不同产物的比例，所以需要精确的吉布斯自由能。command line如下：

# opt=(calcfc,tight,ts,noeigentest) freq m06/6-311G(d,p) int=ultrafine Temperature=423.15

高斯输出文件里有两个警告（加粗处），请问这警告会多大程度影响吉布斯自由能的精确性呢？如此影响较大，该怎样修正？

Eigenvalues -- ******************************

X 0.99981 -0.01461 0.01301

Y 0.01387 0.99837 0.05544

Z -0.01380 -0.05525 0.99838

This molecule is an asymmetric top.

Rotational symmetry number 1.

Warning -- assumption of classical behavior for rotation

may cause significant error

Rotational temperatures (Kelvin) 0.00709 0.00467 0.00405

Rotational constants (GHZ): 0.14773 0.09724 0.08445

1 imaginary frequencies ignored.

Zero-point vibrational energy 1222745.6 (Joules/Mol)

292.24322 (Kcal/Mol)

Warning -- explicit consideration of 66 degrees of freedom as

vibrations may cause significant error

作者
Author: sobereva 时间: 2018-2-9 13:49
这是提醒你，对于那些低频振动模式，当做谐振子方式考虑可能对计算的热力学量产生明显误差，改用诸如受阻转子、自由转子等方式考虑可能会得到明显改善

但一般没必要太在意这个，比如是个大分子反应，反应的地方只涉及局部很小区域，不怎么牵扯柔性区域构象变化，那么那些地方计算前后误差会充分抵消

作者
Author: ymygc 时间: 2018-2-9 23:31

sobereva 发表于 2018-2-9 13:49
这是提醒你，对于那些低频振动模式，当做谐振子方式考虑可能对计算的热力学量产生明显误差，改用诸如受阻转 ...

谢谢老师！

作者
Author: devilove 时间: 2021-10-3 15:19

sobereva 发表于 2018-2-9 13:49
这是提醒你，对于那些低频振动模式，当做谐振子方式考虑可能对计算的热力学量产生明显误差，改用诸如受阻转 ...

可是sob老师，这里不是提示“ 1 imaginary frequencies ignored.” 存在虚频嘛？也不用在意影响嘛

作者
Author: wzkchem5 时间: 2021-10-3 16:13

devilove 发表于 2021-10-3 08:19
可是sob老师，这里不是提示“ 1 imaginary frequencies ignored.” 存在虚频嘛？也不用在意影响嘛

如果这个虚频是平动/转动的频率，就可以不用考虑，否则需要尽量消掉。一般说的虚频必须消掉指的是振动的频率

作者
Author: QJW 时间: 2025-4-25 01:01

wzkchem5 发表于 2021-10-3 16:13
如果这个虚频是平动/转动的频率，就可以不用考虑，否则需要尽量消掉。一般说的虚频必须消掉指的是振动的 ...

佬，怎么看是什么频率呢？

作者
Author: wzkchem5 时间: 2025-4-25 09:46

QJW 发表于 2025-4-25 01:01
佬，怎么看是什么频率呢？

搜最近的translation、rotation两个词分别出现在哪，然后对输出文件做阅读理解，不难发现你这个频率是不是平动或振动频率

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