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标题: 柔性扫描log文件用gview打开错误 [打印本页]

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Author: lijiayisjtu 时间: 2018-2-12 10:40
标题: 柔性扫描log文件用gview打开错误
柔性扫描，一次是找到个TS后，去testify the different orientation in TS，看H和裸露的O是否会形成氢键，就扫了H和O的键长，涉及O-O键断裂，关键词um062x/6-31+g(d) opt=modredundant guess=(mix,always) ，末尾是B 4 8 S 15 -0.150000。一次是寻找过渡态初猜，扫了S和O的键长，末尾是B 3 15 S 10 -0.100000。但用gaussview两次打开log文件，均无法从results栏选择Scan选项查看scan plot，想问下是啥原因导致，之前都能正常查看scan plot去看scan of total energy的。有一个log文件太大，没大上传，谢谢了

作者
Author: sobereva 时间: 2018-2-12 15:56
如置顶的新人必读贴所示，上传较大文本文件前必须先压缩以节约论坛空间、降低下载耗时。给你压缩后重新上传了，希望下次注意

作者
Author: sobereva 时间: 2018-2-12 16:17
gv6能打开，并看到四帧

作者
Author: huangtf 时间: 2018-2-12 19:40
File, open, 勾选Read Intermediate Geometries (Gaussian Optimizations Only), 打开，就能查看scan plot去看scan of total energy。

作者
Author: lijiayisjtu 时间: 2018-2-13 10:22

huangtf 发表于 2018-2-12 19:40
File, open, 勾选Read Intermediate Geometries (Gaussian Optimizations Only), 打开，就能查看scan plot ...

我用的是gaussview5.0.8,勾选后确实能查看scan plot,谢谢了！

作者
Author: lijiayisjtu 时间: 2018-2-13 10:24

sobereva 发表于 2018-2-12 15:56
如置顶的新人必读贴所示，上传较大文本文件前必须先压缩以节约论坛空间、降低下载耗时。给你压缩后重新上传 ...

谢谢Sob提醒，下次我会压缩再上传。我用的是gv5.0.8，我下个gv6试试

作者
Author: lijiayisjtu 时间: 2018-2-14 10:57
正常用GV打开scan后的log文件去查看scan plot是正常显示，横坐标是scan coordinate，如图1，但有时勾选Read Intermediate Geometries (Gaussian Optimizations Only)后显示，横坐标是scan step number，而且gjf文件末尾是B 4 8 S 15 -0.150000，只扫描15步，却出现48个结构，如图2 ，这是为什么呢？谢谢解答了

作者
Author: sobereva 时间: 2018-2-14 17:00

lijiayisjtu 发表于 2018-2-14 10:57
正常用GV打开scan后的log文件去查看scan plot是正常显示，横坐标是scan coordinate，如图1，但有时勾选Read ...

图2估计是任务没正常结束的情况，于是显示出来的不是扫描曲线，而是某步的柔性扫描曲线

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