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标题: xshell断开与服务器的连接后，计算停止 [打印本页]

作者
Author: lastzealot 时间: 2015-4-11 15:30
标题: xshell断开与服务器的连接后，计算停止
用xshell输入命令，用winscp看里面的文件。关掉xshell直接导致计算停止，winscp里面的那个.out文件大小不再变化，打开看里面最下行也不再变化。
求问大神这是为啥？如何处理？

作者
Author: lastzealot 时间: 2015-4-11 16:05
补充一下，我是用一个批处理文件提交的任务，不是利用命令行提交的，下面是批处理文件内容：
#!/bin/bash
for inf in *.gjf
do
outf=`echo ${inf}|tr "gjf" "out"`
/db/home/haha/g09/g09 < ${inf} > ${outf}
done
我在网上查看到说的是加上g09 test.com&，有的说加上nohup g09 *.com &
我不知道这是什么意思，也不知道怎么加进去，麻烦高手帮忙。
（由于我想每次提交任务提交多个，所以才用批处理；再说我不懂linux系统，命令行提交我也不会。所以，做了一个批处理文件，每次都用这个，方便一些。这种方法在我自己的电脑上屡试不爽，但是用在服务器上总是遇到各种问题，呵呵。

作者
Author: diaolanxinyu 时间: 2015-4-11 16:57
我是这样的使用的，建一个**.in文件，里面输入需要计算的文件，g09 01.gjf 01.out 然后回车输入下一个回车下一个，注意空格，
然后传到服务器上，然后输入setsid sh **.in & 就OK了！

方法比较笨一点，但是没有出过错，呵呵

作者
Author: lastzealot 时间: 2015-4-11 17:30

diaolanxinyu 发表于 2015-4-11 16:57
我是这样的使用的，建一个**.in文件，里面输入需要计算的文件，g09 01.gjf 01.out 然后回车输入下一个回车 ...

谢谢你的帮忙
请问这种方法可用在批处理文件上吗？我的文件比较多，一个一个输入如果输错了就运行不了了。

作者
Author: lastzealot 时间: 2015-4-11 17:39
本帖最后由 lastzealot 于 2015-4-11 17:40 编辑

diaolanxinyu 发表于 2015-4-11 16:57
我是这样的使用的，建一个**.in文件，里面输入需要计算的文件，g09 01.gjf 01.out 然后回车输入下一个回车 ...

我试了一下，你这个方法的确好用。但是我需要输入/db/home/haha/g09/g09，而不是直接输入g09，也就是需要把g09的所在位置写上，请问这是为啥？

作者
Author: 卡开发发 时间: 2015-4-11 18:53
要么试试nohup g09 xxx.gjf &

作者
Author: diaolanxinyu 时间: 2015-4-11 22:05

lastzealot 发表于 2015-4-11 17:39
我试了一下，你这个方法的确好用。但是我需要输入/db/home/haha/g09/g09，而不是直接输入g09，也就是需要 ...

1.是不是你的用户权限没有设置好，例如4. chown -R root:users /opt/gaussian/g09d01/g09/
是修改g09目录及里面内容的所有用户权限为root:users
2.改用户权限，你可以用vi /etc/passwd命令该
例如cf:x:503:100::/home/cf:/bin/bash
注意：503是编号，改成100就好了

你试试吧，我也不确定

作者
Author: diaolanxinyu 时间: 2015-4-11 22:07

diaolanxinyu 发表于 2015-4-11 22:05
1.是不是你的用户权限没有设置好，例如4. chown -R root:users /opt/gaussian/g09d01/g09/
是修改g09 ...

只把503后面的数字改成100就好了

作者
Author: diaolanxinyu 时间: 2015-4-11 22:10

lastzealot 发表于 2015-4-11 17:30
谢谢你的帮忙
请问这种方法可用在批处理文件上吗？我的文件比较多，一个一个输入如果输错了就运行不了了 ...

我计算的不是很多，所以都是一个个输入的，要不你还是试试用脚本吧
不知道你看了sobereva老师的这个帖子没？
http://sobereva.com/258

作者
Author: lastzealot 时间: 2015-4-11 22:52

diaolanxinyu 发表于 2015-4-11 22:10
我计算的不是很多，所以都是一个个输入的，要不你还是试试用脚本吧
不知道你看了sobereva老师的这个帖子 ...

非常感谢
我一般是把若干个.gjf算上然后就上班，呵呵。我的工作不是理论计算，只是兴趣而已，所以上班做不了只能回家做，但目前依然是个小菜鸟。有些科研想法想通过计算来实现，所以才学高斯。
谢谢指教，你可以在小木虫上加我 lastzealot。

作者
Author: helpme 时间: 2015-4-12 14:43
比如你的脚本是 run.sh
那就写： nohup run.sh & 即可。
上面要求脚本run.sh在PATH路径里面，如果是当前目录下的脚本，可以 nohup ./run.sh & 。

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