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标题: 点突变自由能计算服务器 [打印本页]

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Author: kunkun 时间: 2015-4-11 19:22
标题: 点突变自由能计算服务器
本帖最后由 kunkun 于 2015-4-12 00:01 编辑

可能很多做蛋白的或则酶突变方向研究的同学需要做到点突变筛选，但是苦于该如何有效的筛选出稳定性更好的蛋白。在discovery studio 3.0中已经加入了突变子能量筛选的功能。。但是这个软件居然要15w软妹币..简直无法直视。

于是根据文献里的key word 谷歌了一下。发现了这么这些服务器网站：
SDM：http://mordred.bioc.cam.ac.uk/~sdm/sdm.php
PopMusic-2.0:http://dezyme.com I-mutant2.0：http://folding.biofold.org/i-mutant/i-mutant2.0.html
FoldX：http://foldx.crg.es
粗略地看了下原理，基本是计算突变自由能变的来估算点突变后的蛋白折叠自由能。
有需要的同学可以仔细去看看相关的文献。
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若是只计算自由能的话，貌似gromacs也能自己算。（这部分等我研究研究再发上来分享。。）

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