计算化学公社

标题: 使用Multiwfn做ELF分析怎么计算原子壳层半径及其它 [打印本页]

作者
Author: jctyp 时间: 2018-3-18 17:04
标题: 使用Multiwfn做ELF分析怎么计算原子壳层半径及其它
各位老师及同仁，大家好！看了一篇文献（见附件），作者提到了使用了Multiwfn和AIM2000，AIMAll，TopMod，文中有三处不知是否可用Multiwfn如何去做：1. 图片1中原子壳层半径怎样计算
2. σ和π电子密度的分子图
3.表中第三列和第四列
只好在此请教大家，谢谢！

作者
Author: sobereva 时间: 2018-3-18 18:34
Multiwfn是分析ELF最强的工具，根本用不着其它程序，一个Multiwfn包办，比用其它程序好得多也快得多也灵活得多。

1 参考
使用Multiwfn绘制原子轨道图形、研究原子壳层结构及相对论效应的影响
http://sobereva.com/152
电子定域性的图形分析
http://sobereva.com/63
绘制从原子核开始的ELF径向图，直接就能定位极大点，立刻就知道壳层半径

2 在Multiwfn里通过主功能6的子功能26修改占据数，如果把sigma轨道占据数清零接下来的到的就是pi的，反之亦然。之后用Multiwfn的拓扑分析功能做电子密度的拓扑分析，看
使用Multiwfn做拓扑分析以及计算孤对电子角度
http://sobereva.com/108

3 看
使用Multiwfn做电子密度、ELF、静电势、密度差等函数的盆分析
http://sobereva.com/179
以及手册3.18.5节对定域化和离域化指数的介绍，以及与电子波动方差指标的关系。

作者
Author: jctyp 时间: 2018-3-18 19:56

sobereva 发表于 2018-3-18 18:34
Multiwfn是分析ELF最强的工具，根本用不着其它程序，一个Multiwfn包办，比用其它程序好得多也快得多也灵活 ...

谢谢卢老师！周末快乐！

作者
Author: jctyp 时间: 2018-4-1 17:24
卢老师，您好！上述三个问题中第三个在您的帮助建议下，已弄清楚。但第一个关于计算原子壳层半价，没重复出文献数据。比如用ELF计算Mg原子壳层半径，是不是应该单算一个镁原子，所用方法和基组和文献中一样，取fchk文件在Multiwfn，选3-9-2，输入0,0,0,4,0,0,然后选6看极大值位置。还是要单看Mg原子的3s轨道的径向分布函数，让其他轨道占据为0？谢谢！

作者
Author: sobereva 时间: 2018-4-1 18:52

jctyp 发表于 2018-4-1 17:24
卢老师，您好！上述三个问题中第三个在您的帮助建议下，已弄清楚。但第一个关于计算原子壳层半价，没重复出 ...

不看轨道，就是通过ELF径向曲线来判断

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