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标题: G16转换出的fchk出现warning且用Multiwfn计算NTOs时出错 [打印本页]

作者
Author: lyc460360210 时间: 2018-4-8 11:26
标题: G16转换出的fchk出现warning且用Multiwfn计算NTOs时出错
高斯版本:G16 A03
Multiwfn版本：3.5
调用外部程序：NBO6
关键词：# opt b3lyp  6-311g(d,p) int=(acc2e=10,fine)  em=gd3bj scrf=conver=6 pop=nbo6
/home/work/basic$ formchk lhc-pyridine.chk
Read checkpoint file lhc-pyridine.chk
Write formatted file lhc-pyridine.fchk
FChkPn:  Coordinates translated and rotated.
FChkPn:  Coordinates match /B/ after translation and rotation.
Warning:  fchk array  MicOpt element          1 has value 4622945017495814144                                                                                                                                                             set to -1.
Warning:  fchk array  MicOpt element          2 has value 4622945017495814144                                                                                                                                                             set to -1.
Warning:  fchk array  MicOpt element          3 has value 4622945017495814144                                                                                                                                                             set to -1.
Warning:  fchk array  MicOpt element          4 has value 4622945017495814144                                                                                                                                                             set to -1.
Warning:  fchk array  MicOpt element          5 has value 4622945017495814144                                                                                                                                                             set to -1.
Warning:  fchk array  MicOpt element          6 has value 4624072647915317185                                                                                                                                                             set to -1.
Warning:  fchk array  MicOpt element          7 has value 4607217659633734768                                                                                                                                                             set to -1.
Warning:  fchk array  MicOpt element          8 has value 4607217659633734768                                                                                                                                                             set to -1.
Warning:  fchk array  MicOpt element          9 has value 4607217659633734768                                                                                                                                                             set to -1.
Warning:  fchk array  MicOpt element       10 has value 4607217659633734768                                                                                                                                                             set to -1.
Warning:  fchk array  MicOpt element       11 has value 4607217659633734768                                                                                                                                                             set to -1.

已经确认用Multiwfn 3.5 计算NTOs时载入 log文件时闪退

求各位老师能给出建议~

作者
Author: lyc460360210 时间: 2018-4-8 11:33
问题已解决，可能是因为同时安装了g09和g16，调用formchk时带上g16的绝对路径如 /home/g16/fomchk 1.chk 可以解决warning的问题，至于NTOs计算出现问题，是因为我拿一个opt的去求NTOs，傻了傻了....

作者
Author: zjxitcc 时间: 2018-4-8 11:36
是的，这一看就是混用不同版本的问题。

作者
Author: lyc460360210 时间: 2018-4-8 12:29
但是把g09的环境变量删掉还是会出现这种问题。。。不太明白咋回事

感谢公社里的dalao 非绝热-粽提出解决方案~

作者
Author: 让你变成回忆 时间: 2018-4-8 13:33
本帖最后由让你变成回忆于 2018-4-8 13:35 编辑

只要能用Multiwfn正确载入，这些警告就可以忽略。
利用Multiwfn转成fch文件就可以用Gview打开了。
以前出现这个问题问过sob老师，记得sob老师是这样回答的。

作者
Author: zjxitcc 时间: 2018-4-8 14:10

让你变成回忆发表于 2018-4-8 13:33
只要能用Multiwfn正确载入，这些警告就可以忽略。
利用Multiwfn转成fch文件就可以用Gview打开了。
以前出 ...

不包括这种情况，对g09和g16混用产生的.fchk文件，这样是不妥当的。因为此时fchk文件内所有原子核的质量可能是0

还有一些信息完全是错的。不是只有一两个数字的格式问题。

作者
Author: 让你变成回忆 时间: 2018-4-8 14:52

zjxitcc 发表于 2018-4-8 14:10
不包括这种情况，对g09和g16混用产生的.fchk文件，这样是不妥当的。因为此时fchk文件内所有原子核的质量 ...

多谢告知~

作者
Author: 吴双 时间: 2021-5-27 09:52
只用G16计算也同样出现这种问题是为什么呢，应该怎样解决呢求告知

作者
Author: zjxitcc 时间: 2021-5-27 10:10

吴双发表于 2021-5-27 09:52
只用G16计算也同样出现这种问题是为什么呢，应该怎样解决呢求告知

你就算用了g16做计算（例如g16 A.03），你还得证明你用的是相应高斯版本的formchk。例如你得展示你生成fch文件的命令行，以及which formchk运行结果。

有的机器上同时写了g09和g16的环境变量（这其实是不对的），你看上去在用g16做计算，很可能生成fch文件时用的是g09的formchk小程序，无意中被坑。

作者
Author: 吴双 时间: 2021-5-31 19:25

zjxitcc 发表于 2021-5-27 10:10
你就算用了g16做计算（例如g16 A.03），你还得证明你用的是相应高斯版本的formchk。例如你得展示你生成fc ...

好的好的谢谢啦

作者
Author: 好多于 时间: 2021-6-8 10:20

lyc460360210 发表于 2018-4-8 11:33
问题已解决，可能是因为同时安装了g09和g16，调用formchk时带上g16的绝对路径如 /home/g16/fomchk 1.chk 可 ...

请问我也出现了这种问题，但是他还是继续进行fchk转换，得到的结果还是不能用对吧？

作者
Author: zjxitcc 时间: 2021-6-8 10:24

好多于发表于 2021-6-8 10:20
请问我也出现了这种问题，但是他还是继续进行fchk转换，得到的结果还是不能用对吧？

解决方案很简单，不要同时写两种高斯版本的环境变量即可，改一下就几秒钟的事，不要偷懒。看《G16和G09环境变量同时生效的危害》这里面写了怎么合适的写环境变量

作者
Author: 好多于 时间: 2021-9-12 15:57

zjxitcc 发表于 2021-6-8 10:24
解决方案很简单，不要同时写两种高斯版本的环境变量即可，改一下就几秒钟的事，不要偷懒。看《G16和G09环 ...

好的谢谢！

作者
Author: 吕安琪 时间: 2022-9-22 17:05

zjxitcc 发表于 2021-5-27 10:10
你就算用了g16做计算（例如g16 A.03），你还得证明你用的是相应高斯版本的formchk。例如你得展示你生成fc ...

可是我加了g16的绝对路径formchk 还是会有同样的警告请问应该怎么解决呢

作者
Author: zjxitcc 时间: 2022-9-22 17:21

吕安琪发表于 2022-9-22 17:05
可是我加了g16的绝对路径formchk 还是会有同样的警告请问应该怎么解决呢

你这句话只证明了你用的formchk是g16的，还需证明你的chk文件是用同一版本的g16算得的。这样才能达到“用g16的formchk小程序去操作g16算得的chk文件”

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